彩色豆马勃硝酸还原酶基因克隆与序列分析-论文.pdf

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1、第37卷第6期南京林业大学学报(自然科学版)Vo1.37.No.62013年11月JournalofNanjingForestryUniversity(NaturalSciencesEdition)NOV.。2013彩色豆马勃硝酸还原酶基因克隆与序列分析周爱东,吴小芹,王明生,王小龙,叶建仁(南京林业大学森林资源与环境学院,江苏南京210037)摘要:彩色豆马勃是重要的林木外生菌根真菌,采用RT—PCR和cDNA末端快速扩增法(RACE)从彩色豆马勃中克隆得到硝酸还原酶基因,将其命名为ptnr(GenBank登录号为KC698974)。ptnr

2、cDNA全长2951bp,ORF长2754bp,编码917个氨基酸,推测所得蛋白质的分子质量为102.06ku,等电点为6.34。序列相似性检索和系统进化树分析结果显示:彩色豆马勃ptnr编码的氨基酸序列与担子菌皱木耳硝酸还原酶基因的氨基酸序列同源性最高为60%,与担子菌灰盖鬼伞的同源性为57%,与外生菌根真菌粘滑菇和双色蜡蘑的同源性分别为53%和56%。关键词:外生菌根真菌;彩色豆马勃;硝酸还原酶基因;cDNA末端快速扩增;序列分析中图分类号:Q786文献标志码:A文章编号:1000—2006(2013)06—0022—05Cloningan

3、dsequenceanalysisofnitratereductasegenefromPisofithustinctoriusZHOUAidong,WUXiaoqin,WANGMingsheng,WANGXiaolong,YEJianren(CollegeofForestResourcesandEnvironment,NamingForestryUniversity,Naming210037,China)Abstract:Pisolithustinctoriusisanimportantforestectomycorrhizalfunguswi

4、thwideapplicationinrootstimulations.Nitratereductasegene,namedasptnr(GenBankaccessionnumberKC698974),wasclonedfrom尸.tinctorius,usingreversetranscript—PCR(RT.PCR)andrapidamplificationofcDNAends(RACE).TheannotatedptnrcDNAhadato—tallengthof2951bp,witha2754bpORF,coding917aminoac

5、ids.Theencodedproteinwasestimatedatthelengthof102.06kuandwithanisoelectricpointof6.34.BothsequencesimilarityretrievalandphylogenetictreeanalysesshowedtheaminoacidsequencehomologybetweenP.tinctoriusencodednitratereductaseandAuriculariadelicateenco-dedreductasewasthehighest,wh

6、ichcouldreach60%,whilethenitratereductasesequencehomologybetweenP.tinctoriusandCoprinopsiscinerea,orectomycorrhizalfungiHebelomacylindrosporum,orLaccariabicoloris57%,53%and56%,respectively.Ourstudyprovidesabasisforfurtherresearchofgenesinvolvedinthesymbioticassociationbe—twe

7、enectomycorrhizalfungiandforest.Keywords:ectomycorrhizalfungi;Pisolithustinctorius;nitratereductasegene;rapidamplificationofcDNAends(RACE);sequencesanalysis外生菌根是土壤真菌与植物根系相互作用物中涉及一系代谢过程,这一过程有多种酶参形成的互惠共生体,它们能够为树木的生长提供与,如谷氨酸脱氢酶(glutamatedehydrogenase,矿质营养,提高林木的生产力、增强植物抗逆境GDH)、谷

8、氨酸合成酶(glutaminesynthetase,GS)胁迫能力,具有重要的生态环境效益和经济价和硝酸还原酶(nitratereductase,NR

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