广西火桐基因组dna提取方法探究

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1、广西火桐基因组DNA提取方法探究　　摘要：以广西火桐[Erythropsiskwangsiensis（Hsue）Hsue]叶片为试料，比较了改良CTAB法、试剂盒法和改良SDS法提取基因组DNA的提取效果及对干燥叶和鲜叶提取的基因组DNA进行了比较研究。结果表明，改良CTAB法和试剂盒法提取的基因组DNA质量较好、杂质少，适合广西火桐基因组DNA的提取。改良SDS法提取的基因组DNA无完整条带，质量较差，不适合广西火桐基因组DNA提取。硅胶干燥90d的叶样和新鲜叶样所得的基因组DNA纯度相当，产率前者多于后者。关键词：广西火桐[Erythropsiskwangsiensis（Hsue）Hsu

2、e]；基因组DNA；提取中图分类号：Q781文献标识码：A文章编号：0439-8114（2013）20-5060-03StudiesonGenomicDNAExtractionofErythropsiskwangsiensisLUOWen-hua1，HUANGShi-xun1，MAHu-sheng1，FUZhi-hong1，2，DAIWen-juan1，TANGWen-xiu1，PANBo1，ZHAOBo1（1.GuangxiInstituteofBotany，GuangxiZhuangAutonomousRegionandtheChinesesAcademyof9Sciences，Guil

3、in541006，Guangxi，China；2.CollegeofLifeSciences，GuangxiNormalUniversity，Guilin541004，Guangxi，China）Abstract：UsingtheleavesofErythropsiskwangsiensisasmaterial，thegenomictotalDNAwasextracted.ThreemethodsofgenomictotalDNAextractionincludingimprovedCTABmethod，reagentboxmethodandimprovedSDSmethodwerecomp

4、ared.ResultsshowedthattheDNAextractedfromimprovedCTABmethodandreagentboxmethodhadhighqualityandlessimpurity，butquantityofthelatterwaslessthanthatoftheformer.Thereagentboxmethodhadtheadvantagesofsimpleoperation，shorttimeandlessharmful，butmoreexpensivethanthatoftheimprovedCTABmethod.Inaddition，improv

5、edSDSmethoddidn’thavethecompletebands，soitwasnotsuitableforgenomicDNAextractionofErythropsiskwangsiensis.ThegenomicDNAextractedfromtheleavespreservedinsilicagelfor90dayswerenotsignificantlydifferentfromthatoffreshleaves，andtheyieldoftheformerwasmuchmorethanthatofthelatter.9Keywords：Erythropsiskwang

6、siensis；genomicDNA；extraction广西火桐[Erythropsiskwangsiensis（Hsue）Hsue]隶属梧桐科火桐属（Erythropsis）植物，为中国特有种，仅分布于广西壮族自治区中部至南部的石灰岩地区，对研究植物区系和植物地理及亲缘关系等均有重要的学术价值。其木材纹理直，材质柔韧，不开裂，是制作家具的上等用材；其先花后叶，花色鲜艳靓丽，花期长，具有极高的经济和观赏价值。由于人类的过度利用，广西火桐野外种群和个体数量稀少，已处于濒危状态，为国家二级重点保护植物[1]。目前，对广西火桐的研究仅限于光合速率、群落及种群生态学特征等方面[2-6]，其基因组D

7、NA提取方法的研究还未见报道。本试验研究了不同提取方法提取广西火桐基因组DNA的提取效果，为广西火桐的群体遗传多样性研究奠定基础，探讨硅胶干燥叶样与鲜叶DNA的区别，为野外样品保存提供一定的依据。1材料与方法1.1材料广西火桐采自广西壮族自治区靖西县，选取无病虫害的当年生嫩叶，用变色硅胶室温保存90d，嫩叶完全干燥；广西火桐新鲜嫩叶采自广西植物研究所。1.2方法91.2.1不同提取方法提取基因组DNA分别采用