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《被子植物dna去甲基化酶基因的进化分析（可编辑）》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在教育资源-天天文库。
1、被子植物DNA去甲基化酶基因的进化分析HereditasBeijing7>2014年3月,363:276―285//0>.研究报告被子植物DNA去甲基化酶基因的进化分析刘秋香,薛庆中,徐建红浙江大学农业与生物技术学院,杭州310058摘要:DNA甲基化模式和水平取决于DNA甲基转移酶和去甲基化酶的作用,而DNA去甲基化酶在DNA主动去甲基化过程中起到关键作用。文章以已知的10个DNA去甲基化酶基因为参照,鉴定出两种单子叶植物水稻和高粱、两种双子叶植物拟南芥和毛果杨中所有的DNA去甲基化酶同源基因,其中新鉴定出两类DNA去甲基
2、化酶类似基因DML4和DML5。基于保守的糖苷酶结构域序列的系统进化分析以及基因在染色体上的位置分析表明,植物中DNA去甲基化酶基因存在串联复制、染色体区段复制和全基因组复制而导致基因的新功能化和亚功能化。文章还进一步分析了DNA去甲基化酶基因在不同组织中的表达情况,旨在理解DNA去甲基化酶基因的功能与进化的关系,以期为DNA去甲基化酶基因在植物中的利用提供参考。关键词:DNA去甲基化酶;糖苷酶结构域;进化;基因复制与丢失;基因表达PhylogeneticanalysisofDNAdemethylasegenesinangi
3、ospermQiuxiangLiu,QingzhongXue,JianhongXuCollegeofAgricultureandBiotechnology,ZhejiangUniversity,Hangzhou310058,ChinaAbstract:TheDNAmethylationpatternsandlevelsaredependedonthefunctionofDNAmethyltransferaseandDNAdemethylase,andDNAdemethylaseplaysacriticalroleinacti
4、veDNAdemethylation.Inthispaper,allhomologousDNAdemethylasegenecopieswereidentifiedinmonocotsO.sativaandS.bicoloranddicotyledonA.thalianaandP.trichocarpabasedontenknownDNAdemethylasegenesfromriceandArabidopsis.TwotypesofnewDNAdemethy-lase?likegenesDML4andDML5wereide
5、ntified.Tandemduplication,segmentalduplicationandwholegenomeduplica-tionexistinDNAdemethylasegenefamilyinplants,whichresultinneofunctionalizationandsubfunctionalizationuponthephylogenyofconservedglycosylasedomainsandchromosomallocationsofgenes.Furthermore,theexpres
6、sionofDNAdemethylasegeneswasinvestigatedindifferenttissues.Thisstudywillfacilitateourunderstandingoftherelationshipbe-tweenfunctionandevolutionofDNAdemethylase,andutilizingtheDNAdemethylasegenesinplantsKeywords:DNAdemethylase;glycosylasedomain;evolution;geneduplica
7、tionandgeneloss;geneexpression收稿日期:2013?11?21;修回日期:2014?01?09基金项目:国家重点基础研究发展计划973计划项目编号:2010CB126205,国家自然科学基金项目编号:31171165和人事厅留学回国基金项目编号:J20120581资助作者简介:刘秋香,硕士研究生,专业方向:植物基因组学。E-mail:lqxabcxyz@163通讯作者:徐建红,博士,研究员,研究方向:基因组学与分子生物学。E-mail:jhxu@//.DOI:10.3724/SP.J.1005.2
8、014.0276网络出版时间:////.URL:2014-2-1716:17:48第3期刘秋香等:被子植物DNA去甲基化酶基因的进化分析277[22,23]DNA甲基化是一种重要的表观遗传修饰,参与甲基化。如水稻Oryzasativa中的ROS1b[1,2][3][4]默子沉诸如转座印迹基
