肺结核病人dna低甲基化趋势与dna去甲基化酶的相关性研究

肺结核病人dna低甲基化趋势与dna去甲基化酶的相关性研究

ID:34883936

大小:5.82 MB

页数:56页

时间:2019-03-13

上传者:U-24835
肺结核病人dna低甲基化趋势与dna去甲基化酶的相关性研究_第1页
肺结核病人dna低甲基化趋势与dna去甲基化酶的相关性研究_第2页
肺结核病人dna低甲基化趋势与dna去甲基化酶的相关性研究_第3页
肺结核病人dna低甲基化趋势与dna去甲基化酶的相关性研究_第4页
肺结核病人dna低甲基化趋势与dna去甲基化酶的相关性研究_第5页
资源描述:

《肺结核病人dna低甲基化趋势与dna去甲基化酶的相关性研究》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在学术论文-天天文库

中@聲3钟《版硕±研究生学位论文■北京协和医学院研究生院 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文学校代码:10023学号:S2012035004硕±学位论文肺结核病人DNA低甲基化庭势与DNA去甲基化巧的相巧性研究所院:中国医学科学院病原生物学研究所姓名:张洪静指导教师:刘海鹰副研究员导师小组:刘海鹰副研巧员学科专业:免疫学研究方向;肺结核病人宿主基因甲基化影响因素的研究完成日期:2015.05 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文目录摘要1Abstract3缩略減56引言-、肺结核病面临新的挑战,宿主免疫应答能力与肺结核病的密切关联是战胜新挑战的nm7二、DNA甲基化对宿主免疫系统起着重要调节作用10S、课题姐在前期实验中发现肺结核病人呈现DNA低甲基化趋势11四、DNA甲基化水平受DNA去甲基化酶及DNA甲基化转移酶调控12於17第一部分17活动性肺结核病人及健康人全血RNA中DNA去甲基化酶及DNA甲基化转移酶表达量的分tf17一、实验材料和方法17二、实验结果23三、小结25第二部分26549-体外刺激A、Beas2B细胞探讨DNA去甲基化酶及DNA甲基化转移酶对DNA低甲基化趋势的影响26一26、实验材料和方法二、实验结果33H、小结38職39一、肺结核病人DNA去甲基化酶影响DNA低甲基化趋势的相关性分析39二、肺结核病人的低甲基化趋势可能通过増强免疫应答来影响疾病的发生发展40H、DNA去甲基化酶及DNA甲基化转移酶在同种刺激物刺激过的不同细胞中差异表达的趋势及种类不同41IS论42 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文参考女献43致谢49独创性声明和学位论文版权使用授枚48 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文搞要肺结核病(pulmonarytuberculosis,PTB)是由结核分枝杆菌(Mycobacterium一tuberculosisA)感染引起的,M种与机体细免疫应答密切相关的慢性感染性疾病,在肺结核病的发病过程中,细胞介导的抗原特异性免疫应答发挥着重要作用。当结核分枝杆菌感染机体时,抗原递呈细胞(AntigenresentincellsAPC)将结核分枝pg,--CD80双途径激活T淋己细胞杆菌抗原通过抗原MHC分子复合物和CD28,同时一-12--分泌正、正1等细胞因子,进步刺激免疫细胞释放效应分子如TNFa等W杀灭结核分枝杆菌。DNA甲基化修饰作为动植物体内一种重要的表观遗传修饰形式,参与免疫应答反应的调控,对肿瘤性疾病、慢性感染性疾病、自身免疫性疾病等多种疾病的发生发展中起着重要的作用。而DNA甲基化主要通过DNA甲基化转移酶(DNAme也ransferas的DNMT1、DNMT3A、DNMT犯)上调DNA甲基化水平yh,;通过DNA去甲基化酶(TET1、TET2、TET3、TDG)下调DNA甲基化水平,两方面的调节共同维持DNA甲基化水平的高低。课题组在前期通过全基因姐DNA甲基化芯片研究发现,肺结核病患者宿主基因普遍呈低DNA甲基化状态一DNA甲基。为进步探索肺结核病人化调节的分子机制、研究肺结核病人DNA低甲基化状态的影响因素,本研究在前期研巧结果的基础上,收集健康对照(Y干扰素释放实验,即IGRA阴性)和活动性肺结核病人治Rea-疗前全血RNA,通过实时巧光定量PCRltimePCR方法,首先对参与DNA甲()基化下调的DNA去甲基化酶的4个基因进行定量检测,W初步明确DNA低甲基化状态与DNA去甲基化酶之间的关系。结果发现,在肺结核病人组中,参与下调DNA甲基化水平的4个基因(TET1、TET2、TET3、TDG)表达均显著升高(P值<0.05)。为了全面探讨肺结核病人DNA低甲基化状态的影响因素,我们又对可W被动影响DNA低甲基化状态的DNA甲基化转移酶的3个基因(DNMT1、DNMT3A、DNMT3B)进行了定量检测,结果发现:只有DNMT1表达显著升高(P值<0.05)。一为了进步验证7RVA甲5-,我们利用H3裂解抗原W及体外降低DN基化水平的氮杂胞嚼巧核巧(5azac-2B)刺激物刺激A549、Beas两种细胞系,并收集刺激后不同时间点细胞DNA、RNA。利用甲基化敏感性限制性分析(MSRA)对所收集DNA样本进行分析,结果表明,拟7Rv抗原、5azac导致DNA甲基化水平降低,ea--且刺激时间越长甲基化降低越明显。我们利用民ltimePCR(RTPCR)方法对RNA样本进行检测。结果显示,在两株细胞中,DNA去甲基化酶随着刺激时间的延长逐渐升高,DNA甲基化转移酶表达的时间动态图却无明显特异性表达。且结果中1 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文在刺激第四天A549细胞中H37RV刺激组DNA去甲基化酶TET2、TET3上调,而在Beas-2B中为取7Rv刺激组DNA去甲基TDG上化酶调,即DNA去甲基化酶表达显著升高,这与临床检测结果相符;在A549细胞H37RV刺激组有两种DNA甲3A-基化转移酶DNMT、DNMT3B上调,而在Beas2B细胞H37RV刺激姐中表现为DNMT3A下调。综上所述,我们发现无论是临床肺结核病人组还是体外细胞实验H37RV刺激姐,DNA甲基化水平呈下降趋势,而DNA去甲基化酶差异性表达上调。并且在细胞刺激实验中,,随刺激时间越长,DNA去甲基化酶表达逐渐升高而DNA甲基化降低程度逐渐明显。总之,本研巧验证了肺结核病人DNA甲基化呈现降低趋势,并初步回答了这种DNA低甲基化趋势可能主要受DNA去甲基化酶调控。,TETTDG关键词:肺结核病DNA甲基化,DNA去甲基化,DNMTss,,2 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文AbstractPulmonarytuberculosisPTBisoneofthechronicinflammatordiseasescausedb()yyMM*ycobacteriumtuberculosis.th,Itiscloselyrelatedwiththebodyscellsimmune()response.DuringthedevelomentofPTBthecellmediatedresonselasanimortantp,ppyprole.Intherocessofmcobacteriumtuberculosisinfection,antienresentincellspygpgAPCresenttheantienofmcobacteriumtuberculosisbdoublewasofMHC()pgyyyCD28-moleculescomplexandCD80toTcellstoactivatethem.Andatthesametime,theAPCssecretIL-12L-1、Iandsooninorder化fiirtherstimulateimmunecells化-releasetheeflBcientmolecularTNFawhichcouldkillthemycobacteriumtuberculosis.DNAmethylationisakindofimportantformofepigeneticmodificationsinmanyorganisms,eitherinanimalsormplants.化hasimportantbiologicalinfluenceonthedevelopmentandtheoccurrenceofdiseases.DNAmethylationrealizesitsmodificationfunctionmainlythrouhraisinandlowerinitsmethlationlevelandsubseuentlgggyqyaffectstheeneexression.DNAmethlationismainlthrouhDNAmethltransferasesgpyygymainlincludinDNMTlDNMT3AandDNMT3B化rai化itsDNAmethlation(yg,)ylevel,anditismainlythrouhDNAdemethlasesmainlincludingTET1%TET2>TET3>gy(yTDGtoloweritsmethlationlevel.ThetwoasectsofreulationU)etherlmaintain)ypggytheeveofDNAmethatonllyli.Inourearlywork,wepreliminarilyilluminate化atDNAmethylatio凸levelisdownregulatedinthetuberculosis(TB)infectionusingthemethodofenomeDNAgmethylationchip.InordertoilluminatethemolecularmechanismsofDNAmethylationadjustmentandfindouttheinfluencefactorsofdownregulatedDNAmethylationtrend,o打thebasisofpreviousresearchfindingsourresearchfirstlcollecthealthcontrols,yyve'IGRAnegtiandactivetuberculosispatientswholebloodKNAU)quantitativel()ydetectfourenesofDNAdemethlaseswhichcouldforwardldownreulatetheDNAgyygmethylationlevelmainlincludinTET1?TET2、TET3andTDGbmeansof(yg)yRea-weltimePC民method.虹thissectionuroselwant化Ulustratetherelationshi,ppypbetweentheDNA^methylationandtheroiA*demcthylas的.Theresultsshowthatallthefourgenes(TETKTET2,TET3,TDG,DNMTl)thatdownregulateDNAmethylationlevelappearupexpressedintheactivetuberculosispatients<0.05.虹order化(p)comprehensivelydiscusstheinfluenceefectorsoflowDNAmethylatio。trend,weadditionallydetectthethreemembersofDNAmethyltransferaseswhichcouldupregulateDNAmethylationlevel.Theresultshows,intheTBgroup,onlyDNAmethyltransferases3 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文IDNMT1isdiferentialluexressed<0.05?虹order化fiirthervalidateOUT()ypp(p)findings,subsequentlyweuseH37Rvcrackingantigenandpositivestimulus(5azac)化s-whichcouldmaketheDNAmethylationleveldroptimulateA549Beas2btwocell,linestoconductthevalidationexperimentsinvitro.AndthenwecollectthestimulatedcellDNARNAofdiferenttimeoints.UisetheDNAsamles!;〇rocessmethlatio打,pppysensitiverestrictionanalysis(MSRA)testinorder!:〇confirmtheDNAmethylationlevelMSRAshows-afterstimulation.TheresultoftheH37Rvantige打and5犯acpositivestimuluscancauseDNAmethylationlevePsdropasthegenomeDNAmethylationchipshows,and化dropsmoreas也etimeoes.Inorder化detecttheexressionofDNAgpdemethylasesandDNAmethyltransferaseswemakeuseoftheRNAsamles化化St化e,p-enesb-gythemethodofRealtimePCRasmentionedbefore.TheRealtimePC反detectionsreflectthattheDNAdemethylasesareincreasedasthetimegrowsinthe--化H37RvstirousofboA549andBeas2B.AndonthefourthdaTET2andTET3aregpy,--tdifere打讨yureulaio打exressedintheH37RvstirouofA549cellUne.AndTDGispgpgp-diferen过H3RvtB-2BceAyincreasedinthe7sirouofeasllline.ndtheexressio打ofgppDNMT3A-、DNMT犯isdiferentlyincreasedintheH37艮vstirouofA549cellline.gp-Bu-tDNMT3Aisdiferentlydowne邓r的sionedintheH37RvstigroupofSeas2Bcellline.Inconclusion,DNAmethylationisonthedeclineastheDNAdemethylasesare-increasinglyexressedinbothactivetuberculosisatientsandH37Rvsticells.AndasppthetimeoesConcernintheDNAmethltransferasestheresultsshowtheexressiong,gy,pofDNAme化lationtransferasesisnotsecific.Inawordaccordintotheaboveresultsyp,gwefinallyansweredthefollowingscientificquestions.Theoccurrenceanddevelopmentofactivetuberculosisdiseasearecloselyassociatedwiththeho巧lowDNAmethylatio打trend.ThediferencechangeofDNAmethylationlevelintuberculosisatientsiscloselpyrelatedwithDNAdemethylases.AnditisthechiefenzymestodroptheofDNAmethylatio打level.Keywords:Pulmonarytuberculosis,DNAmethylation,DNAdemethylation,DNMTs,TETsTDG,4 中国医学科学晓北京协和医学院硕±学位论文缩II词巧缩写英文名務中文名巧5azac5-azacnne5-ytii氮杂胞瞎惦核巧5hc5-hroxthimydymeylcytosne5替甲基胞喀惦A549A549人肺腺癌细胞株APCan-tienresengptingcell抗原递呈细胞Beas-2BBeas-2B人支气管上皮细胞株CFP-10OkDacuureraenlOKDalltfilttantige培养滤过蛋白抗原CXCU2--thestromalcellderivedfactor1基质细胞衍生因子CXCR4CXCL12receptor4CXCL12受体DNMTlDNAmethyltransferases1DNA甲基化转移酶1DNMT3ADNAmethyltransferases3ADNA甲基化转移酶3ADNMT3BDNAmethyltransferases3BDNA甲基化转移酶3BDNMTasesDNAmethyltransferasesenzymesDNA甲基化转移酶DNMTsDNAmethyltransferasesDNA甲基化转移酶ELIE-nkedImmsSPOTnzymeliunopotAss巧酶联免疫斑点检测ESAT-Da66kearlsecretorantigenictaret6ykDa早yg期分泌抗原GOGeneOntology基因本体论--IFNInerferonamma-ytg干扰素yIL-2n--/10/12Interleuki2/10/12白介素2/10/12--IP10Interferonnduclein-11iibrote0干扰素诱导蛋白0pLDNDrannmnodeiiglyph引流淋己结M.tbMycobacteriumtuberculosis结核分枝杆菌-MDRmultidrugresistance多耐药结核菌MHCMajorhistocompatibilitycon^lex主要组织相容性复合物MSRAMethylationsensitiverestrictionanalysis甲基化敏感性限制性分祈PTBPumonaruberculytlosis肺结核病PRRpaternrecognitionreceptors模式识别受体RARheumatoidArthriti风湿性关节炎RT--PCRReaPltimeCR实时萊光定量PC民---SAHS-adenosyllhomocysteineS腺巧同型半脱氨酸SAS-Adenosm-MylethionineS腺昔甲硫氨酸TBTuberculosis结核病TCRTcellreceptorT细胞受体TDGmneDNAthyiglycosylase胸腺喀赌糖基酶—TETT-1-leneleventranslocationenzyme十H染色体异位酶1 ̄—TET2Ten-ranscanenz-eme22leventlotio十yi染色体弄位酶—TET3Ten-em-leventranslocationenzye3十H染色体异位酶3—TET-e-sTenleventranslocationenzymes十H染色体异位酶TNF-aTumo--riftrlha肿瘤坏死因子necrossacoapaVDRvitaminDreceptor维生素D受体5 中国医学科学院北京协和医学院硕女学位论文引言TubTB‘结核病(erculosis)(co6actenM/wft/bercw/osk,,是由结核分枝杆菌缔M沾一)引起的种慢性感染性疾病,主要感染肺部并引起W肺部肉芽肿为主要病理一特征的疾病(Pulmonarytuberculosis,PTB)。长期W来,结核病直严重危害人类健康。据WHO统计显示,全球现有1/3(约20亿)的人群感染了结核病,其中10%(2000万)可发展为原发性结核病(Primarytuberculosis),而近90%的人体内可长期携带结核分枝巧菌成为潜伏感染者(LatenttuberculosisinfectionsLTBI)。近年来,,由于人口迁移、艾滋病等共感染化及耐药结核病的出现等,结核病患者数量不断增W力口,每年新发生约900万病人,每年死亡人数高达300万。中国是世界上结核疫一情非常严重的国家之,发病率排名世界第二5,占全球所有结核病例的1%左右。一人类对结核病的认识与研究己有个世纪之久,虽然人们在结核病领域有相当的认识与了解且有一,并定预防、诊断W及治疗手段,但是人们对结核病的认识还不够详细一、彻底,而且防、诊、治各方面也有定的局限与困难。所W面对结核病疫情一的严峻挑战,人们急需进步深入理解结核病的发病机制和免疫保护机制,这样才。能更加有效的防止结核分枝杆菌的感染,阻止结核病的发病就目前形势而言,对于快速诊断、新型治疗药物的研究与开发更是迫在眉睫。而近年来,联合应用化学治疗药物和免疫治疗更是逐渐成为研究热点P’。而结核病免疫保护和免疫调节机制不清是限制新型诊断和治疗手段研发的瓶颈问题。众所周知,宿主免疫系统对肺结核病的发展有着重要影响,虽然对宿主的免疫保护机制已经研究了近一个世纪之久,但是仍有很多免疫保护反应的特点都不清楚W。在结核分枝杆菌感染的过程中,抗原递呈细胞(APC)将细菌抗原递呈给T细,并产生免疫应答,,天胞,清除抗原。近年来随着各项研究的不断推进然免疫反一W步认识,研究表明应在清除结核分枝杆菌方面的作用被进,天然免疫中各种、NK、细胞成分,如单核细胞、巨嗟细胞、中性粒细胞细胞树突状细胞等,在结核分枝杆菌感染的早期及后期都发挥着重要作用。研巧显示,单核细胞、巨峰细胞、中性粒细胞、树突状细胞在肺部肉芽肿形成及后续结核分枝杆菌的清除方面起着重要作用,,而NK细胞可W导致CD8+和CD4+适应免疫应答对杀灭结核分枝杆菌起着重要作用一。虽然些研究成果不断充实着这个领域,T细胞介导的免疫应答仍然W是人们关注的重点。宿主免疫系统发挥作用受多种分子机制调控,主要包括信号通路与转录因子WilRWtl顺式作用元件、miRNA调控,表观遗传修饰等。其中,DNA甲基化修饰作为动植物体内一种重要的表观遗传修饰形式,在调控基因表达、维持基因组的稳定6 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文lttw性等方面发挥重要的生物学作用。根据文献报道,DNA甲基化修饰的催化类型多种多样,但在真核生物体内DNA甲基化修饰主要是在DNA的CpG二核巧胞喀巧的第五位碳原子上面加上或去掉甲fW基。近年来,随着DNA甲基化的研究技术不断成熟,生物学功能不断被了解,DNA甲基化在成熟个体疾病发生发展中所发挥的重要作用不断被揭示。DNA甲基化水平的改变会引起后续基因表达的改变从而影响疾病的发生与进展,现已表明,DNA甲基化修饰与多种疾病密切相关。目前硏究最多、而且相对来说研究也较为成熟的,就是DNA甲基化在肿瘤性疾病当中的作用,许多证据表明DNA甲基化影iwsti响肿瘤的发生、进展及预后等多个方面。除了肿瘤性疾病W外,DNA甲基化、与其他多种疾病的关系,也不断成为研究热点。例如,在感染性疾病自身免疫性DNA甲一疾病。、慢性病、血液病等各种疾病中基化都发挥着重要作用值得提DNA甲一的是:在前述多种疾病中,基化般是通过影响免疫细胞的分化W及调控免疫因子的表达等来促进或抑制疾病的进展的。一、肺结核病面临新的挑脈宿主免疫应答能力与肺结核病的密切关联是战胜新挑战的契机""近些年来,随着结核病不断出现新的挑战,结核病似乎又回到不治之症年代。而造成这种死灰复燃的征象的主要原因是人群中感染结核分枝杆菌的人口基数非常之大,每年出现的结核病新发病例较多,死亡人口基数大;而且随着结核分P01枝杆菌多耐药性菌株(MDR)的增多、艾滋病的不断流行及结核分枝杆菌潜伏感染的威胁,结核病对人类健康产尘的影响越来越重。在结核分枝杆菌多耐药性菌株(MDR)方面现在世界上约有5000万人感染结核分枝杆菌多耐药性结核菌株一(MDR),在些地区超过10%的结核病例为多耐药性结核菌株。而在中国新增病例的5%、所有结核病例的1/4W上,被确定为结核分枝杆菌多耐药性结核菌株一(MDR)。最近的项研巧表明,在HIV血清阴性而结核分枝杆菌细茵培养及疲涂片阳性的1662例结核病患者当中,有%5例(5-巧6例属于8.1%)患者为耐药结核病DRT巧,而在这些耐药结核病患者当中有(P31R-TB607%多耐药结核病(MD,占耐药结核病的.,目前的两种或多种主要疗法都不能治愈该病。另外在艾滋病的威胁方面,HIV和结核分枝杆菌双重感染是使全球结核病回42一P’3。,1/3IDSHIV(+)和结核升的重要原因之据统计的A病人死于结核病,IV分枝杆菌两者相互影响,相互促进疾病发展,因此H感染是目前己知的结核病的一PW最大危险因素之。众所周知,在感染了结核分枝杆菌的20亿人群,大约只有10%发病,剩余90%7 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文可能终生携带结核分枝杆菌一大。结核分枝杆菌的潜伏感染己成为结核病防治中的隐患。在潜伏感染者体内,结核分枝杆茜的复制变得非常缓慢或已经休眠,即结核分枝杆菌己适应了宿主的免疫环境,从快速生长状态转变到非复制的缓慢生长状。态,抗原表达谱较快速生长状态时有显著差异在目前的结核病化学治疗过程中,抗结核药物杀死了快速生长的结核分枝杆菌,却无法彻底清除生长缓慢的细菌,也造成部分细菌在宿主体内残留。送些细菌生长缓慢或处于休眠状态,数目极少,产生的抗原量少,导致的炎症反应小,激起细胞免疫的能力有限,因此宿主免疫系统s一pi无法将其清除这成为结核分枝杆菌反复感染的大威胁。一面临系列新的挑战,人类对肺结核病常规的预防、诊断、治疗措施逐渐捉襟一见肘。20世纪初问世的卡介苗(BacillusCalmeteGuerin,BCG)是目前唯被承认的结核病疫苗,而且己经被广泛使用,其在对儿童结核性脑膜炎的预防起到了重要pswi’作用,然而卡介苗对不同人群的保护效果差异很大,尤其对成人肺结核病的保护作用存在较大争议tuberculinskintest,TST)虽然广泛用于。结核菌素皮肤试验(临床诊断,但其特异性较差,其结果容易受到环境中非结核分枝杆菌及卡介苗的影P01响。随着MDR出现目前缺乏针对耐药结核病有效的治疗药物。,PU为寻求新型预防、诊断与治巧手段,结核病研究者们该朝着什么样的方向前32[]?由于肺结核病的发生发展与宿主免疫应答能力密切相关进呢,而且结核病出现的新挑战又无不与免疫密切相关。我们认为肺结核病与免疫系统的密切关联仍然是一PSI解决系列问题的契机所在。肺结核病的发生发展与宿主免疫应答能力密切相关。健康人在与活动性肺结核病人密切接触后,可因吸入含有结核分枝杆菌的气溶胶而被感染,吸入肺泡的结核分枝杆菌直接被特定的模式识别受体(paternrecognitionreceptors,PRRs)识别,或者在被某些可溶性的宿主因子包被后绑定到巨峰细胞和树突细胞相应的受体上。被感染后的巨随细胞及树突细胞(dendriticcellDC),从外周血移至肺实质和引流淋己结(draininglymphnode,LDN)而后经抗原递呈激活结核抗原特异性的T淋己细胞。这些淋己细胞连同巨幢细胞及结核分枝杆苗共同构成肺部结核性肉芽肿,防止一步复制和扩散结核分枝杆菌的进。此时宿主体内有结核分枝杆菌存在,但无任何结核病的临床体症,称为结核分枝杆菌潜伏感染者。若机体免疫反应不能再抑制肉芽肿内结核分枝杆菌的生长,导致肉芽肿坏死并引起严重的肺损害和结核分枝杆菌tMl的扩散,则称为活动性肺结核。在结核分枝杆菌感染机体的过程当中,无论是固有免疫应答还是适应性免疫应答都对其防护、清除、抵御起着重要作用。从结核分枝杆菌侵入人体到被细胞清除,固有免疫细胞如巨睡细胞及树突状细胞细(DC)、中性粒细胞发挥了重要的作用。人体经呼吸道感染结核分枝杆菌后,固有免疫细胞通过模式识别受体(PRR)识別结核分枝杆菌细胞壁中的化聚糖及脂多8 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文糖等抗原成分。将其吞礎并诱导自身的调亡,W限制细菌的繁殖、扩散。在识别结核分枝杆菌抗原的过程中,参与其中的最重要的模式识别受体是Toll样受体a-tR〇lllikereceporsTLs)。在天然免疫抗结核免疫应答过程中,TLR2、TLR4和,PwsiTLR9被认为发挥重要作用。固有免疫细胞识别并吞唆抗原的过程最初在用H37Ra等减毒菌株感染肺泡巨隨细胞后发现一。然而多篇文献报道,这功能在巨隧P9WarRemo>ld等人最近报道细胞感染毒性菌株后则会受到限制。B沈,,巨隨细胞在感染一""结核分枝杆菌后通过种被称为eferocytosis的过程快速的被未感染细菌。的巨嗤细胞吞嗤,从而到达杀伤细菌的效果中性粒细胞在抗结核免疫中具有两面性。在活动性肺结核病人中,外周血中中性粒细胞的数量増加与呼吸衰竭和病人死W’43亡率的增加具有相关性。在固有免疫应答过程中,中性粒细胞的作用也非常重一要,中性粒细胞能够吞嗟结核分枝杆菌成为结核肉芽肿的个姐成成分,同时它也+[431能促进抗原特异性的CD4T细胞激活和增强DC细胞的递呈功能。中性粒细胞也一是肺部正-10的主要产生者之树突状细胞是主要的抗原递呈细胞-(antienresentincellAPC),吞峰细菌后能够激活T细胞并引发适应性免疫gpg,。控制结核分枝杆菌的感染不仅需要天然免疫中各种免疫细胞的活化和作用,更需要适应性免疫中CD4、\CD8叮和你r淋己细胞的作用。效应T细胞的激活需要有活的结核分枝杆菌扩散并由树突状细胞和其他递呈细胞迁移至引流淋己结进行抗原呈递。而后在引流淋巴结内,抗原特异性的T细胞增殖、分化并迁移至肺部4一t94-的病灶区域发挥相应的免疫学效应。这过程大约需要117天的时间。EFN--被激活的£04寸淋己细胞能够产生多种细胞因子(如y、正2等)调节免疫功能;CD8寸和yST淋己细胞则能够释放颗粒酶和穿孔素等直接杀伤感染细胞和结核分枝杆菌,同时通过Fas/FasL途径诱导飽细胞调亡T细胞。外周血中的被结核----分枝杆菌抗原(如ESAT6、CFP10等)激活后分泌IFNY、TNFa等细胞因子。另夕hyST淋己细跑在细胞免疫抗结核分枝杆菌的感染中也有着重要的作用。抑T淋一-圧N-己细胞是正17和Y的主要分泌者之,能够有效的调节前炎症反应和趋化因fW子的分泌。近年来有研究发现,相对于健康对照,活动性肺结核病人体内的wtiVy9/V泌T淋巴细胞显著减少。但它对天然免疫或适应性免疫的具体作用机制尚未被完全明确。B淋己细胞被激活后主要产生抗体,可W对多种细菌发挥作用。由于结核分枝杆菌是胞内细菌一直认为B细胞在抗结核分枝杆菌的感染中作用并不,所1^^长期来是很重要。但随着研巧的不断深入,B细胞在抗结核病免疫中的作用也越来越受到重视。研巧者在小鼠研巧模型中发现,感染结核分枝杆菌后的小鼠肺肉芽肿中有大48Bf3量细胞的存在。非人类的灵长动物在感染结核分枝杆菌后其肉芽肿内也发现了49tl类似的现象。同时也有研巧表明活动性肺结核病人的肺组织内也观察到了大量滤泡样B细胞的聚集。这些研究都表明,B淋己细胞及其抗体在病灶区局部免疫的防9 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文御和调节中可能同样发挥重要作用,,然而其确切的免疫学效应特别是在结核病中的作用有待进一步的研究。综上所述,目前在肺结核病领域的形势非常严峻,面临的挑战非常多,我们亟需从预防、诊断、治疗等各个方面不断突破,W期待从多个方面来应对这些挑战、,解决这些问题,而由于肺结核病与而宿主免疫系统关联密切宿主的免疫应答能力1^直接影响疾病的发生与发展,所,要想攻克肺结核病这个难题,宿主的免疫系统是我们研巧的出发点。这些新的方法包括不断研巧、开发新的疫苗,寻求新的标志物分子,开辟新型免疫治疗手段等等。但是不管是哪个方面,都应W更加明确的宿主免疫保护机制为研究重点。二、DNA甲基化对宿主免疫系统起着重要调节作用DNA甲基化是一种非常重要的调节机制免疫系统。目前,己有多项研究表明DNA甲基化可(^1通过调节机体免疫系统来影响多种疾病的发生发展从大的方面来讲,目前研巧主要从两个方面,即DNA甲基化参与调控免疫细胞的分化和DNA甲基化参与调控免疫因子的表达证实了DNA甲基化参与免疫系统的调节。详细说来,DNA甲基化主要是通过甲基化水平上调或下调的方式来影响基因的表达Mtl。,进而影响免疫细胞的分化或者是功能蛋白的表法另外有研究证明,DNA甲基化水平的改变可W通过多种方式,例如可W通过调一些分子节细胞表面的(如MHC分子、TLR)的表达来调控T细胞的分化。而且DNA甲基化可W影响巨隨细胞的活化。在很多的疾病研究中也发现,DNA甲基化可W通过调控免疫系统功能蛋白的表达进而影响疾病的发生发展,例如在前列腺癌中为了确定甲基化介导调节基因表达,改变、影响生物通路,继而影响疾病的发生[55],研巧者分析了由12个前列腺癌样本及口个周围正常组织配对组成的样本池的14495个基因中27578个CpG位点,发现前列腺癌组织中在所涉及的1043个差异性基因当中有972个CpG位点的甲基化水平升高;相反地,只有209个位点甲基化水平差异性降低,而这种基因组基因特异性的高甲基化模式在其他多种癌症模型中也被发现。对这些甲基化模式发生改变的基因进斤通路分巧发现,在前列腺癌发一--生中,与癌症相关的系列基因活性受到TNFa的调控。结果发现与TNFa依赖性调亡有关的细胞程序的表观遗传调节异常可能密切参与前列腺癌的发生。在乳腺癌中,XCR4启动子区域甲基化水R4表达上XCL12随着C平的降低CXC调,而随着C启动子区域甲基化水平升高,CXCL12表达下调16%。而无论是W上哪种表观遗[,]传改变,进而影响疾病的分期、大小、组织型分级、,都影响着相应蛋白的表达水平一淋己结转移及病人的预后及存活率等16。另外在些自身免疫病W及慢性病当中,[]也证实了DNA甲基化的重要化例如在乙型肝炎当中-,DNA甲基化通过影响IFN10 中国医学科学院北京协和医学院硕丄学位论文57在风湿性免疫病(如风湿性关节,RheumatoY的表达来影响疾病的进展id[];arthriti,RA)中,DNA甲基化影响CX化口的表达进而影响疾病的进展[58;值得]我们关注的是在肺结核病领域对DNA甲基化的研巧也越来越多,已有的研究是DNA甲基化水平影响肺结核病人体内某些天然免疫基因及维生素D受体(VDR)的表达59。[]H、课题组在前期实验中发现肺结核病人呈现DNA低甲基化趋势我们前期研究结核病患者DNA甲基化水平呈低甲基化状态。本研究主要集中在研究临床肺结核病人与健康人全基因组DNA的甲基化水平。对两组人群(活动性肺结核病人及健康人)全基因组所有甲基化位点分析、总结,,我们发现在DNA甲基化出现差异性改变的所有位点中,健康人中大部分位点甲基化水平高于活动性结核病人,即肺结核病人呈现DNA低甲基趋势(见图1)。并且对这些差异位点所一涉及的基因进行聚类分析发现,这些基因有很大部分落在了抗原呈递及--2interferonamma(IFNy)信号介导的通路上(见图)。gAB■1HyperMethylation0TBoHD圓HypoMethyl如on1.0500。物/]]°°0^400-0〇〇lbII::。。z_I0.0i—ano^H;!_Dtt__■■■_iffereniallyniEllilaedreionlodyg〇!图1;TB组DNA低甲基化趋势A组:两组人群差异性改变的CpG位点的甲基化水平变化情况,B姐比于:相HD,TB组出现高甲基化和低甲基化的位点数目。11 中国医学科学院北京协和医学院硕丄?学位论文GO-H〇g2PAna)lysis0i?4681012inerferon.amma.fnedlate'rulnttgdigigpahwaytturtn£nucleoidgcaabolicrocesspp"irnilalonoftanyaiogttn’gaa-tntiwregulUanof)nt,rleukjn2secreioosiivereulaionofrtelosis■ptgthotnshorlaio^ppy'JtIregulaionofulclumontransport二neavereulaionoaxonexnsonHgtigtf化itnervoussstemdevelomen巧ypdeclionofbio"【simulus3Wtbthttc,"ufresonseocarbodraesimuluspyttIntrinsicjpopoic^igtiAlingathwapy?ntenroc巧snanreset。lgpig。pn。"口neativereulationofaxonoenesisgggnaceaittitrlulrsgnalransducoinet'ippidylSennehoshorlatonppy)itlNtinimmmmmmmmmmmmm^^mi^mmmmmmmmmm^m|oenposphorvlaottitiMH[?rtigenrocessinandresentaionof,1(〇,。〇。&epde.nenvia.pgp8pgetalntflisbishmeocelobrtpynultionceusorganUaterminationofRNAolmeraseItranwritionpypmcrouuenormaonitblbudkfHnegMiwregulationofproteinkina&eBsignaUngn巧t,"ve'egubtlonofranuloce扣行eren""iongytiglomerul"""raonddheirensunctonassembl,ynealivrreulationofaruteinflammatorresonseggyp图2;甲基化差异改变与免疫系统密切相关芯片结果最初Microsoft0巧ceexcel软件进行处理及筛选;聚类分析使用Cluster3TreeView进行分析。GO分析结DNA甲基.0及果盈示;化的差异位点涉及^多种基因,而进步对这些基因的所涉及的分子功能、生物学过程等进行聚类分析发现:在DNA甲基化有差异性改变位点所涉及的基因中,功能落在抗原递呈通路-1^及上的最多。IFNY信号介导的信号通路四、DNA甲基化水平受DNA去甲基化酶及DNA甲基化转移酶调控DNA甲基化是一种非常重要的、参与调控细胞转录活性的表观遗传方式,它通过多种途径影响着机体的正常发展。研巧表明,DNA甲基化在维持基因沮完整性方面起着重要作用:主要通过体内重复序列沉默、内源性逆转录病毒的灭活W及自主基因元件(如转座子等)的失活等多种途径来实现这种维持作用;另外研究发现DNA甲基化对X染色体灭活、组织特异性蛋白表达L:A义干细胞分化诱导作用显著。很久前,DNA甲基化就被确定为与基因沉默密切相关,而且这种表观遗传修饰一的具体生物过程也慢慢地被揭开面纱。研巧发现,DNA甲基化是种后期合成-(ostsnthetc),,pyi修饰过程在这个修饰过程中需耍酶的参与人们将这类特殊的-类酶命名为DNA甲基化转移酶(DNMTs)。DNA甲基化转移酶家族主要有王类:DNMT1、DNMT2、DNMT3,DNMT1及DNMT2无巧他分型,DNMT3父包括…3BI’…DNMT3A、DNMT、DNMT3LH种。在这1£类0踰甲基化转移酶当中己被证实具有DNA甲基化酶活性的主要是DNMT1、DNMT3A、DNMT3BH种。这H种酶的甲基化酶活性表现为一:在DNA启动子或者第外显子序列富含CpG位点的w’tWIW区域-,由辅助因子S腺昔甲硫氨酸(SAM)提供甲基,在CpG二核昔胞喀12 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论义--巧的第五位碳原子上加上甲基,而同时S腺昔甲硫氨酸转变为S腺昔同型半脫氨酸(SAH)。DNA甲基化主要有两种开文式:维持性甲基化(maintainancemethylation)65’6616]和重新甲基化(或者称为从头甲基化411(^0111611巧131;011),所谓维持性甲基化就是W亲代DNA为模板,将亲代DNA甲基化模式遗传给子代的过程。而所谓从头甲基化是指将在机体发育过程中失掉甲基的CpG位点上再次加上甲基的过程。在真核生物体内,参与DNA维持性甲基化的主要的酶是DNA甲基化转移酶1tW(DNMT1),而参与DNA从头甲基化的酶主要是DNA甲基化转移酶3(DNMT3),见图3(A、B)。AB5-hydrmccosnoxythylytiemC{5h)mo^undifiedDNANH*henU-me2SthylatedDNA^?-methyfullladDNA0te止/\t1,1\INh/NH2?^^^义。鴻。街分>mectithlctsyosne5yyoineC<5mC)()CDNMTi—fcii—391?(D^TTVixsAONMT3BONMT3L—.im6DNA甲DNMT1"图3基化的调控机制及s结构示意图关于H种DNA甲基化转移酶(DNMTI、DNMT3A和DNMT3B)的研究历史较e一IW为久远。Bstor等于1988年克隆了第个真核生物的DNMTl,该基因编码1573个氨基酸,蛋白质分子量为,190KD如前所述DNMT1主演负责机体内的维持性甲基化,与DNA复制密切相关。在结构上图3(C)DNMT1具有被DNA,认为是所有-胞嚼巧甲基转移酶活性的脯氨酸半脫氨酸二化,DNMT1主要有H种类型结构域,包括氨基端的一个富含半脱氨酸的CXXC巧指结构一、对漠代邮连同型异构体(BAH)W及殘基端的保守的催化甲基化反应的催化结构域。氨基端的CXXC待指结构iDNA双螺旋的大沟内未甲基化C,,可L;?特异性识别pG模体而綾基端的催化结构域主要结合辅因子SAM。在人体内,DNMT1编码1616个氨基酸,分子量大约为169ICDdDNMT1在体内和体外都有按照模板的甲基化模式遗传给子代的活性,、即具有维持甲基化的功能。人DNMT1在很多成熟组织包括屯、脑、肺、肝、肾、13 中国医学科学院北京协和医学院硕止学位论文tW肌肉、膜腺中都有表达。有研究发现,用全长人DNMTlcDNA构建真核表达重组质粒,使之高表达,结果发现基因组中某些敏感的甲基,之后转染人成纤维细胞tW化程度大大增加而且DNMT1的正常与否直接影响着疾病发展,研究表明在7273[’3肾纤维化小鼠模型体内DNMT1表达明显升高。一另外类对DNA甲基化起着重要作用的甲基化转移酶是DNMT3,而被证实具有DNA甲基化酶活性的酶是其中的DNMT3A和DNMT3B,DNMT3L无DNA甲基化酶活性。与DNMT1相比,DNMT3在结构上图3(C)无CXXC及BAH结构域,取而代之的是两个分别命名为PWWP及ADD的结构域。对于DNMT3A来说,PWWP结构域主要结合组蛋白,而ADD结构域主要识别非甲基化的H3K4。相比较于细菌的85个DNA结合残基,人DNMT3A只有50个DNA结合残基,而且有一二趣的是在DNMT3A分子上有个具有聚作用界面,它使两个DNMT3A分子的活一性位点有效的聚集在起,使DNA结合残基达到100个。DNMT3B与DNMT3A有相似的结构,但是它幾基端的甲基化酶活性只是DNMT3A的80%。DNMT3A、DNMT3B在组织中的分布情况大致相同,DNMT3A在胚胎干细胞中表达丰度较高,在发育成熟的组织中很低;DNMT3B在未分化的胚胎干细胞和睾丸组织中高表达,但在分化细胞和发育成熟的组织中几乎检测不到表达。DNMT3A和DNMT3B是参与机体DNA从头甲基化的主要酶,它们的正常与否影响着机体是正常发展还是处于疾病状态。研究发现,DNMT3A、DNMT3B在体外具有将甲基加到未甲基化的DNA上的功能,小鼠白血病病毒DNA在体外与DNMT3A、DNMT3B蛋白反应的DNMT’实验显示,在其DNA与DNMT3A、3B反应后其3端长末端重复序列中的G二核昔酸的胞喀惦均被其甲基化一DNMTAC,3p,而进步的动物实验显示缺乏和DNMT一些疾病当中3B的小鼠胚胎发育不全,出生不久后死亡而且在,如在M4型及M5型急性淋己瘤(AMLM4/M5)W及骨髓増生异常综合征(MDS)中DNMT3A均发生突变异常,且突变点主要分布在关键的DNA结合区域,在免疫fMl缺陷性着丝点不稳定面部异常综合征(ICFsyndrome)中,DNMT3B结构异常;一、肌组织纤维化而在另外的些疾病当中,如特发性肺纤维化(IPF)屯(CTF)中一DNMT3A及DNMT3B出现差异性表达上调的现象。系列的研究表明,DNMT3A及DNMT化是参与DNA甲基化的重要酶,他们的结构正常与否及蛋白表达水平的75’76tl正常与否直接影响生物体的功能状态及疾病的发生发展。其余两种DNA甲基化转移酶2(DNMT2)及3L(DNMT3L),虽然在结构上具有甲基化酶结构域,,但却没有DNA甲基化酶的活性。分开来说DNMT2无DNA一甲基化酶活性,但却有甲基化tRNA的活性而DNMT3L可能作为个调节因子及辅助因子协助DNMT3A的从头甲基化过程。作为一DNA的甲NA种调控方式,基化修饰必然要求有相应的协调过程来平衡D甲基化过程,这就需要有DNA去甲基化来解除CpG二核巧酸胞嚼巧第五位碳原子14 中国医学科学院北京协和医学院硕丄-学位论义上面的甲基,进而来解除由于甲基化的抑制作用而导致的基因沉默,最后达到激活基因的作用。在很长的时间W来,人们对DNA去甲基化过程都处于茫然状态,直DNA甲^,DNA到近年,基化的进^^来随着人们对步关注去甲基化的研巧也成为一一个热口领域,因为DNA去甲基化跟DNA甲基化样对生物体的发育、成长W及975fi’^疾病的发生发展有着非常重要的作用。目前己有报道的DNA去甲基化的机制主要分为被动去甲基化和主动去甲基化。首先被动去甲基化的过程是复制依赖性一的,主要是通过阻止新生链上发生DNA甲基化而达到去甲基化的效果;另外种15一11就是非复制依赖性的主动去甲基化的过程,这方面在植物方面己有比较成熟的’研究,在动物方面的研究也日渐增多,其机制也逐渐变得明了清楚。DNA的被动去甲基化主要是通过减弱或阻断DNMTs的作用来实现,而DNA的主动去甲基化一-方面,目前报道的DNA主动去甲基化的潜在机制主要有W下几个过程:由十十W-SIU染色体异位酶(TETs)参与的氧化去甲基継而由胸腺嚼巧DNA糖基酶(TDG),一介导的碱基切除修复去除甲基,最后依赖于DNA修复的碱基切除脱氨基及进步的核昔酸切除途径完成去甲基化(图4)*?0Q-0玉斗-I!vL0KGSuccinate.A4Oxidaiontrit。!四四40巧0f\」巧wa扣《?iet1应1I)\J\-々巧\画0黑?01?前?PgpBfl^dciPPPI」^图4DNA去甲基化的调控过程及其中主要的作用酶。一-近来备受关注的个方面就是十H染色体异位酶(TETs)在DNA甲基化修TET一一饰中的作用。s这家族的发现是加强我们对DNA去甲基化机制的理解,这一52一11发现是个重要的分水岭,使我们对DNA甲基化的理解上升到个更加复杂的一层面。TETs在动物中的研究最早可追溯到1982年,Martin等人发现了种蛋白酶15 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文twiW敏感的物质,谊种物质具有去甲基化的作用,后来eiss又在大鼠的成肌细胞全细胞裂解液中又发现了RNase敏感的物质,同样这种物质也具有去甲基化的活性tMl,这是甲基化酶研究的起点,但是当时的送些发现抑制W来都没有被很全面的认一同-,直到近期W来,DNA去甲基化酶有了突破性的进展,那就是十十染色体异位酶(TETs)在DNA去甲基化中的作用。TET家族主要由H个成员,即TET1、一一一TET2、TET3、,每个成员拥有个核屯催化结构域,该结构域是个双链P折叠,一P折叠内含有个非常关键的金属结合残基,这种金属结合残基曾经在二价铁离子8£3-依赖的加氧酶中发现。按照推测的机制,TET主要是将分子氧作为酶底物催化a二一丽戊酸的氧化脱綾基作用,进而生成个有活性的高化合价酶偶联铁的氧络中间86t化合物,这种中间化合物可W将甲基化了的胞嚼赌(5mC)喉化为矮基化的胞喀87f35hmC),而且TETs)可5hmC5hmC迭巧(去甲基化酶(^^^在的基础上将代重5-5fC5-5caC复氧化成甲酷胞略巧及綾基胞喀巧(),从而实现其去甲基化的作用,()TETs将5mC氧化成5hmC,这使得5mC在DNA序列上有所减少,DNA的甲基化状态通过DNA的不断复制而将5mC被动稀释,从而降低DNA甲基化水平;还有研巧表明DNA甲基转移酶(DNMTs)可W促进胞喀巧被氧他了的第5位碳原子上,5hmC相互作用取代基的添加或移除在体外己经证明了DNMTs可W与,所WDNMTs理论上是可W参与去甲基化过程的,但这种逆转的DNMTs的作用的生物相一关性还未可知一,这方面可能是比较有趣的去甲基化机制的另个关注点。目前的研究表明由TETs参与的将5mC催化氧化成5hmC的反应过程并不是去一及最后终止的反应5甲基化过程中唯,后续的WhmC为中如的诸多反应在去甲基化过程中扮演着重要的角色,现在已有报道的这些后续反应主要包括由胸腺喀巧DNA糖基酶(TDG)参与的碱基剪切修复脱氨基等,研究表明TDG的主要作用是将5紀及5caC切除碱基形成脱氨基位点。DNA一DNA与转移酶样重要,去甲基酶对生物体的正常发育W及各种功能的维持有着非常重要的作用,他们参与维持机体DNA甲基化水平的平衡。它们的正常与否,直接影响机体的功能状态,甚至影响着疾病的进展,目前,有很多研巧表明,很多疾病中去甲基化酶蛋白水平发生异常16 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文正文第一部分活动性肺结核病人及健康人全血RNA中DNA去甲基化酶及DNA甲基化转移酶表达it的分析一肺结核病是种与机体细胞免疫应答能力密切相关的慢性感染性疾病,课题组前期部分实验收集活动性肺结核病人及健康人全血样本,并提取DNA样本,采用fllumina公司的Infinium?HumanMethylation450SeadArray产品对其进行全基因组甲基化忘片检测,初步探讨肺结核病人与DNA甲基化之间的关系。对其结果进行分析发现:在肺结核病的发生发展过程中,而DNA甲基化通过与免疫系统的调节密切相关、对疾病有着重要影响。结果显示:相较于健康人全基因组甲基化水平,肺结核病人全基因组DNA甲基化水平呈现差异性降低趋势一。为了进步初步探讨造成肺结核病人全基因组DNA低甲基化水平的可能影响因素,我们收集活动性肺结核病人及健康人两沮人群全血样本,首先拟从RNA水平上检测下调DNA甲基化水平的DNA去甲基化酶(主要包括TET1、TETl、TE13、TDG)的表达水平,W初步了解在活动性肺结核病人体内,这些己被报道的可W下调DNA甲基化水平的几类酶的表达水平是否有着差异性的改变。为了从多个方面探索肺结核病人DNA低甲基化趋势一,本研究进步检测了活动性肺结核病人及健康人两组人群全血RNA样本中可W上调DNA甲基化水平的DNA甲基化转移酶的表达量(主要包括DNMT1、DNMT3A、DNMT3B)。一、实验材料和方法1.獅體结核病人和健康人入组队列’-本部分实验所用样本来自深圳市第H人民医院。收集全血样本,并贬存于80C冰箱保存备用。。各组人数及入组条件等详细信息见下表17 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文1表:活动性肺结核病人和结核分枝杆茵潜伏感染者细胞因子检测样本信息实獲分样本性巧(男/ELISPOT入组平齡齡狙致女)(SFCs)、1初发活动性肺结核病:2姨涂片检测结果阳性、;3、胸片检查结果阳性;活动性>44、ELISPOT检査阳性(A抗原SFCs0/B抗原-肺结核.9±3.243298148/633>SFCs30);患者5、排除义滋病、肝炎、糖尿病及类风湿等自身免疫性疾病6、无既往结核病史。1、无结核病临床体征和症状:2、无与结核病人密切接触史;3、胸片检査结果未见异常:健康对4SP值SFC且B抗-1.±.、ELIOT阴性(A抗原s含10原47/730729224照、、SFCs<30);5、、S聯艾滋病乙肝、糖尿病及类风湿等自身免疫性疾病。一注:①、活动性肺结核病人均为初次发病并且治疗时间小于周的患者。排除艾滋病、肝炎、糖尿病及类风湿等自身免疫性疾病。②、TST:结核菌素皮肤试验,->-l〇。-mm为阳性③、ELISPOTMtssseccIFNmeld实验结果;.uberculoipifiyenzinkeyoso-tIFNimmunp,即:用于检测结核分枝巧菌抗原特异性y的酶联免疫斑点实验;t-Fo-SFCs:SpormingCells表示ELISPOT检测中释放IFNY的细胞数,用于该实验的结果判定。本课题中所用ELISPOT检测分别用试剂食中A抗原和B抗原两种结核分枝杆菌特异性刺激物对受试者PBMC进行刺激,结果中A抗原孔SFCs>40或B抗原孔SFCs>30判定为阳化A抗原孔SFCs谷K)且B抗原孔SFCS530为阴性。2.獅滕结该病人及健巧>^血RNA样本提取本部分实验所用试剂盒是或耗材、仪器主要有QIAampDNA^liniKit(250)、、RNA215ml离屯管、去酶水、台式高速离也机等,详细信息见表。21.实验中提取全血RNA所用试剂盒或耗材、仪器详细信息18 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文表2提取全血RNA所用试剂盒或耗材、仪器详细信息试沉金、巧材巧仪船務货号棘他来*QIAampDNAMiniKit(250)52304Qiag郎公司ml离也管430791购自cornin公司15g去RNA酶水W4502购于Siraa-Arichgld公司平板离也机巧10R购于巧pendorf公司台式窩速冷冻离也、机5417R购于巧pendorf公司22.实验步驟如下:2.2.1纯化PMBCy、将预先加入抗凝剂的全血样本1ml400g离也7min,将上清保存,留待后)用。(2)、加入等体积PBS,混匀。(3)、沿管壁加入Ficol试剂,然后再加入等体积W上混匀液体,400g,升9降4,离也30min。(4)、吸取中间白膜层枪头尖部顶及此层贴壁旋转吸取)。5、加入1倍W上体积PBS,混匀400g离也7min。()(6)、弃上清,并再次加入PBS清洗后计数,并留待后用。2.2.2用RNeasyMiniKit提取细胞RNA(1)、提前准备好下游所用试剂,备用。0、弃掉细胞培养基,每孔加入1mlPBS溶液清洗后弃掉PBS溶液。)6直接将3、根据细胞(小于5xl0个细胞),350BuferRLT直接加入孔內,()叫充分裂解3min。(4)、加入与1^>1上裂解液等体积的70%的乙醇溶液,充分吹打,不离也。5、、将W上细胞液收入1.5ml离屯管中,1000巧m离也5min。()(6)、转移W上液体700叫(包括任何的沉淀)到配有2ml收集管的RNeasy离,llOOO2化后也柱中,轻叩盖子g离也,弃掉滤液。(7)、加入70〇WBuferRWl清洗柱子,轻叩盖子,llOOOg离也20s,弃掉滤液。(8)、加入50〇nlBuferRPE清洗柱子,捏叩盖子,llOOOg离也20s,弃掉滤液。矜、再次加入500^11BuferRPE1^再次清洗柱子,轻叩盖子,llOOOg离也2min,)并弃掉滤液。(10)、将柱子转移至新的2ml收集管中,全速离也1皿虹。19 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文14、(11)、将柱子转移至.5ml窝也管中,加入(Hd去RNA酶水,llOOOg离屯Imin,W洗脱RNA。如果RNA的量大于30帖,可W再次加入仰1去RNA酶水W重复W上洗脱步驟,或者用!^>1上洗脱液重复洗脱。’D1000-80U巧、用N微量吸光光度计检测浓度,分装并于C冰箱保存W备用。注:在提取RNA的全过程所用水全部为去RNA酶的水。操作全程都需要戴手套及口罩,,提取过程尽量迅速,W防止RNA降解RNA样本需要分装后再冻存。3?活动性肺结核病人全血RNA定量检测本实验所用的试剂盒或耗材及仪器大部分来源于AppliedBiosystems(ABI)公司,主要有PowerSYB民GreenPC民MasterMix、封膜、MicroAmpFastOtical96pHT-孔板7900FastRealTimePCRSstem、RNA3。、y去酶水等。详细信息见表3-.1实验中将RNA逆转录为cDNA、RealtimePCR所用试剂盒或耗材及仪器详细信息-表3逆转录、RealtimePCR所用试剂盆或耗材及仪器详细信息试巧金、巧材或物》名巧货号巧其他来巧。PrimeScriptII1StrandcDNASynth的sis垃t62I0A购自ABI公司PowerSYB民GreenPC民MasterMixREF43676巧购自ABI公司封膜4311971购自ABI公司s---MicroAmptOtical96WellReactionPlateREF4346906MPXHCYP262KFap67900HT-ABIFastRealTimePCRSystem7900购自公司去RNA酶水W4502购于S-igmaAldrich公司3.2.实验步骤如下:3.21DNA.c的合成1)、实验前将所用样本和试剂平衡至室温后置于冰上。(一2、统配置RNA变性液:每个样本加入Oligo肝PrimerWdNTPMixture各()25,.叫混匀。(3)、准备RNA样本:取RNA样本20叫(totleRNA总量小于10帖),将己准备好的RNA变性液W5叫/样本的量加入准备好的RNA样本中,混匀。‘4、65C变性5min后迅速冰上解育。()5一配置逆转录PCR反应液,姐分如下、统:()20 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文巧分体巧W上变性RNA及引物混合物25pl/样本5xPrimeScrit口Bufer1〇l/样本pHRNA酶抑制剂1.25pl/样本PrimeScriptII逆转录醇SOOunits/样本去RNA酶水至5〇nl/样本6、轻轻漏匀W上逆转录PCR反应液。()(7)、迅速按照下体系及条件进行逆转录PCR扩増:PCR逆转录扩増条件如下;租度时间.42C60mm’-巧)、将W上逆转录PC民产物分装并置于80C储存备用。3.2.2WcDNA为模板进行7种目的基因的炎光定量PCR检测1、实验前将所需样本及试剂平衡至室湿,并于冰上放置。()一2-、根据所检测基因分别配置RealtimePCR反应液,每种基因配置管反应()液。本实验需检测8个基因,其中包括7个目的基因(TET1、TET2、TET3、TDG、一A-DNMT1、DNMT3、DNMT犯),W及个管家基因Pactin具体姐分如下:组分概?IowerSYBRGreenPCRMasterMix1〇Hl/样本F-rimer(lOM)样本pp-JRr.pimer(10M)OSil/样(j本去RNA酶水至2〇nl/样本(3)、将W上PCR反应液混匀,并取19叫加入AB巧6孔板中的每个空中。每个样本每个基因至少做2个复孔。(4)、将前期反转录好的cDNA模板取1叫加入96孔板的每个孔中。5、用封膜将板子密封好。()6、lOOOrm瞬时离也20s。()p7-()、上机进行RealtimePCR扩增21 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文Rea-ltimePCR扩増体系女口下组分備ea-RltimeCR反应液1/P1却孔cDNA模板Ifil化Rea-ltimePCR扩増条件女口下沮度时间.56C2mm‘95COminl‘95C15s40Cycles’60CImin95V15s’60C15sR-ealtimePC氏扩增引物如下引物名巧引巧巧巧产嘴I长度B-ACT-IN2FCAAAGACCTGTACGCCAACACb!42pB-ACT-2RGTACGCGCTCAGGAGGAGINATTDNMT3A-FCCGATGCTGGGGACAAGAAT*5IbpDNMT3A-RCCCGTCATCCACCAAGACACDNMT3B-FAGGGAAGACTCGATCCTCGTCWbp0NMT3B-2RGT6TGTAGCTTAGCAGACTGGDNMTl-FCCTAGCCCCAGGATTACAAGG118bpDNMTl-RACTCATCCGATTTGGCTCTTTCTETl-FCGaACGAAGCACaCTCTTA17Ib下打1-RCTTGCATTGGAACCGAATCATTTpTET2-FATACCCT6TAT6AAGGGAAGCC97bp1TET2-RCTTACCCCGAAGTTACGTCTTTCTET3-FAGTGTCCGAAAGCCCATTCA6216bpTET3-RGCAAATAGCGCAAGAGAAGGTTTDG-FT6ACCAAGACTCTCCCCGATA〇1撕TDG-RCCAGGTCCAGGGTAATGATGC口注一NA;①按照实验安排96cD,还,每块孔板上除了加入待检测的临床样本外需要保证每个基因加入去RNase水,作为阴性对照。排除任何污染物的非特异性22 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文扩增,保证质控质量,确保实验结果真实、可靠。②扩増引物是用PrimerBank软件设计,并用DNAMAN软件比对后送出由invitrogen公司合成,并且预实验验证过引物特异性后才用于实验。4.统计学分析实验中所得数据使用GraphPadprim5软件进行统计学分析和做图。本部分结果使用*Unpairedttest方法进行分析,实验数据W相对表达量表示,,值<〇.〇5、***值<0.01及;K0.001均被认为有显著性统计学差异。二、实验结果活动性脯结核病人和健康人全血RNA中DNA去甲基化酶及DNA甲基化转移酶的相对表法量我们本部分实验结果显示(见图4),相对于健康对照组,活动性肺结核病人全血RNA中,在活动性肺结核病人全血RNA中,己被报道参与DNA甲基化水平下调的DNA去甲基化酶(TET1、TET2、TET3、TDG)表达全部显著升高(P值<0.05)(见图4A);已被报道参与DNA甲基化水平上调的DNA甲基化转移酶(DNMT1、DNMT3A、DNMT3B、TDG)只有DNMT1(参与维持性甲基化)表达显著升高(P值<0.05),其余两种分子DNMT3A、DNMT3B表现为在健康人体4B)。内表达较高,但未见统计学差异(见图23 中国医学科学院北京协和医学院硕丄?学位论文A,社也4也也々*4+々?9去安甲TET2TET1基TOC肺化….酶.1‘UI?4?‘’*II妻至;了,’中-"t5!-?*_??__li;、、^疗*.心去.‘去了,.^.去。々*々*^广气广BDNMT1DNMT3ASDNMT巧0化"*。々巧1IW。,1。——I云|画dMJtdiL^UlSl基々冷々公々公?移酶DNMT1。…口。DNMT3A-0.0291M2Si???.0.020?■巧〇.争〇?-0.01SM8.GIS0i一一*0.V.01。hM10.;表卫下??.'〇〇〇]-.〇.:I玉—oJ尘__-jfr々公々奔々公图4活动性肺结核病人和健康人全血RNA中TETs、TDG、DNMTs检测。A组:两组样本中DNA去甲基化酶表达水平柱状图及散点图,检测;B组:两组样本DNA甲基化转移酶相对表达情况柱状图及散点图。TB:活动性肺结核病人;24 中国医学科学院北京协和医学院硕止学位论文—AAU***HD:健康人。数据W目的基因相对表达量2表示,公值<〇.〇5、,值<〇.〇1及***<70。/.001均被认为有显著统计学差异兰、小结本部分实验收集并检测活动性肺结核病人及健康人全血RNA样本中7种目的基因的相对表达量,结果显示:1、在未治疗的活动性肺结核病人全血RNA中目前已报道的可W使DNA甲基,化水平下调的所有DNA去甲基化酶,主要包括TET1,TET2、TETT3、TDQ表达水平均显著升高。2、在未治疗的活动性肺结核病人全血RNA中,目前已报道的可^?使DNA甲基化水平上调的DNA甲基化转移酶中只有一种酶即参与维持性甲基化的DNM,T1表达显著升高。DNMT3A、DNMT3B的表达量无显著性差异。25 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文第二巧分A549Beas-2B体外刺巧、细胞探时DNA去甲基化巧及DNA甲基化转移巧对DNA低甲基化趋势的巧咱一一一一为了进步验证前部分实验结果::DNA,进步确定甲基化与肺结核病密切相关,且在活动性肺结核病人体内确实呈现DNA甲基化水平降低的情况。二:参与下调DNA甲基化水平的DNA去甲基化酶确实对肺结核病人DNA低甲基化趋势有着重要影响。我们在体外利用阳性刺激物5azacW及肺结核病相关抗原549B-2B联7Rv刺激A、eas两种细胞系,进行模拟实验。本部分实验整体实验方一-2B:549、Beas两种细胞系不同刺激后法就是在体外给予A,段时间W后收集细胞上清、DNA、RNA样本,利用甲基化敏感性限制性分析(MSRA)实验技术检测DNA样本,观察DNA甲基化水平的改变。并且同时对该时间点所收集的RNA样本进行实时费光定量PC氏首先检测目前已报道的可W下调DNA甲基化水平变化DNA去甲基化酶(TET1、TET2、TET3、TDG)的表达情况。然后在RNA水平上检测可W上调DNA甲基化水平的DNA甲基化转移酶(DNMT1、DNMT3A、DNMT3B)的相对表达量。本部分实验之所W选送两种细施是因为:众所周知,肺结核病是由胞内茜结核一种慢性感染性疾病分枝杆菌引起的W肺部形成肉芽肿为主要特征的。所谓肉芽肿镜检肺组织内所形成得上皮样肉芽肿,可见肉芽肿中央有非干酪样凝固性坏死,,多核巨细胞、淋己浆细胞浸润,小血管炎其周围纤维组织增生。上皮细胞是其重要细胞成分-。A549是来源于肺腺癌的肺上皮细胞,而Beas2B细胞是来源于正9-常支气管上皮细胞的永生化细胞。因此体外实验选用A54、Beas2B两种细胞系一进行刺激实验。而且诸多研巧表明,5azac是种可W降低DNA甲基化水平的刺胃889〇]一[H37RV激物,它是种强效生长抑制剂和细胞毒素剂。而作为抗原刺激物,一种常用的裂解蛋白是、用于体外模拟结核病的蛋白。一、实验材料和方法1.娜t细胞并收集细胞上淸DNA及RNA、样本11.细胞刺激实验所用试剂盒及耗材本部分实验所用试剂盒及耗材主要有F12、DMEM/F12细胞培养基、胎牛血清(FBS、青链霉素双抗溶液(PS)5azac、拟7Rv7Rvlsis)、)、6孔板、裂解抗原(阳y26 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文赎酶、QIAampDNAMiniKit、RNeasyMiniKit等,所涉及仪器主要有生物安全柜、恒温解箱、水浴锅、倒置显微镜、台式商速离也机、超声破碎仪、纯水仪等。详细信息见表4表4:细胞刺激试验所用试剂盒、耗材及仪器详细信息巧刑金、耗材巧化#名巧货号巧其他^F12培养基REF11765购于G化co公司DMEM/F12(DF12)培养基REFm30购于G化co公司FBSREF10099购于G化co公司PS15140购于Gibco公司PBST900购于TaKaRa公司6孔板35化购于Coming公司购于-5azacA1287SigmaAldrich公司菌株来自于北京结核病胸部肿瘤研究H37RVlysis本实验室制备所赎酶REF1%04购于访bco公司BCAPro227购于Thermo公司teinAssayKitProd沿3QIAampDNAMiniKit(250)51306购于Qiage打公司RNeasyMiniKit(250)74106购于Qiagen公司生物安全柜型号;LABGARD425购于Nuarie公司二氧化碳培养箱型号;NU购于Nuarie公司水浴锅一购于AuaBahqt公司倒置显微镜ECLIP巧购于Nikon公司台式离速冷冻离也机5417民购于eppendorf公司超声破碎仪SOENTZ-IID购于SCIENTZ公司0.22畔滤膜SLGP的3RB购于MHipore公司纯水仪M购于颇尔过滤器公司1、、.2实验所用细胞种类、种植细胞数刺激物种类浓度、刺激体系、刺激方式、时间详细信息-2B两种细胞-本部分实验所用细胞主要是A549、Beas,刺激物主要是5氮杂胞嗦巧核昔(5azac)、狀7Rv裂解抗原。具体实验细节,见表5。27 中国医学科学院北京协巧医学院硕±学位论文表5:体外细胞刺激实验细节细化种谊细拥澈物抑齡前澈体系細苗樓养板抑致方式、时间及梓本化集方法种类化密度巧类巧度铺板24h后分别加入H种刺激物,^入/M刺激6d、5x,分别收集铺板24hl0mSazac2n口A5493ml/孔6孔板1、Id、3d4d、6d的1H37RV0化刺激物后刺激细胞上清、DNA、RNA样本铺板24h后分别加入H种刺激物,4-2xBeasl〇/mSazac2M刺激6d,分别收集铺板24h、加入p3ml/孔6孔板、、、2B1拟7Rv后刺激Id3d4d6d的10帖刺激物细胞上清、DNA、RNA样本注:细胞刺激实验重复H遍。1拟7RV.3抗原的制备1317Rv..拟裂解-1、将于7H9培养基中培养了34周的H37RV煮沸15min,为保证完全灭活,()‘再用80C水浴,膊育30min。、口、12000ipm、离也lOmin(或者4000rpm离屯30min)去除培养基。)(3)、加入PBS溶液,100叫体积空间大小沉淀约加入1mlPBS溶液,混匀。°(4)、于冰水混合物中超声,20%功率,巧C,01巧02模式,超声开9s,关5s,共超20min。‘(5)、12000rpm,4C,离也lOmin,沉淀冻存,上清定量。132SCA法测定总..蛋白浓度1、按照下方法配置BSA标准品。()V(BSA巧液俯*终巧准巧触(n/ml)ial脯液欄pi)gA0300ofstock2000B125375ofstock1500C325325ofstock1000D1V17575ofialB750E325325ofVialC500F325325ofVialD250G325325ofVialE125H400100ofVialF250QblankcontolI400r()2)、按照5倍、10倍、20倍等比稀釋样本。(28 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文3、根据样品数量,按照每个样本200^1,配制BCA工作液,按照()=regentB:regentAl:50比例,混匀。4200BCA工25、上样,每个孔加入作液1()叫,^各浓度标准品及稀释样本。即=按照王作液:待测样本8:1的比例。°5、37C解箱放置30min。()(巧、用酶标仪测定562nm波长处的吸光值。W不同浓度标准品所测吸光值为纵坐标,W各浓度标准品为横坐标。绘制标准曲线,得出计算公式。代入不同浓度样本吸光值,算出最终蛋白浓度。7、用化22m滤膜过滤掉杂菌及未裂解完全的茜株后,分装待用。()M1.4实验所用细胞密度及刺激物浓度的确立本部分实验所用细胞密度及刺激物浓度是经过多次预实验摸索获得。细胞刺激实验的目的是,给予细胞相关刺激后,希望细胞产生不同刺激物依赖性的DNA甲基化水平的改变。有研究表明,在进行此类实验时要求细胞W低密度种植,已达到是有限的细胞获得足够的外来刺激,并产生相应的改变的效果。1)、由于不同细胞生长速度及状态不同,本部分实验按照W下多种密度、多种(浓度进行预实验。细巧密度49-(A5)细巧密度(Beas2B)^/lxloVmIxlOraIl45xl〇/ml2xl〇Vml^4IxlO/ml4x/ll〇m刑澈物織拥補巧度5犯ac0.5、、^MIiM2^MjH37反V5惦、10惦、20帖(巧、预实验过程中发现,细胞种植密度过大,培养7天后,培养孔内细胞过度増殖、非常拥挤、细胞状态不好。而细胞数目过小,在后期收集DNA、RNA样本是质与量无法保证,影响实验。根据细胞生长情况,首先确定A549种植密度为445xl0mB-2B2x/l,eas种植密度为l0/ml。3、使用W上细胞种植密度,根据刺激3d后DNA甲基化水平的变化情况(),并结合文献及前期经验,最终确定5azac:2叫4,H37RV:10l。^g1.5实验步驟1.51.刺激细胞(1)、配置F12及DF12完全培养基;完全培养基含F12或DF12培养基,10%FBS1%PS,29 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文2、将A549及Beas-2B按照预先摸索好的细胞密度及刺激体系铺入6孔板。()324h。()、稳定后按照各刺激物浓度加入刺激物(4)、根据不同时间点,收集铺板24h、刺激Id、3d的样本,待用。152..收集细胞上清、并收集细胞提取DNA样本收集不同时间点细胞上清(留待后期检测)。收集细胞,提取全基因组DNA。使用Qiagen公司BloodorBodyFluidSpin全基因组DNA纯化试剂盒(A1125),实验步骤如下:’I、打开%C水洛锅,待用。提前准备好下游所用试剂。()、每个组收集500,留待后期检测。(巧叫细胞上清(3)、将剩余细胞上清弃掉,每孔加入1mlPBS溶液清洗后弃掉PBS溶液,并加‘0-102537C二4min。入..%的膀酶100叫,于氧化碳培养箱消化(4)、加入1mlPBS溶液,充分吹打,使细胞完全脱落。m离屯、5、将W上细胞液收入1.5ml离也管中,lOOOrp5min。()6一、由于细胞数较少,在原孔中再次加入1mlPBS溶液,再次清洗遍,收集()lim离也5min。残留细胞,并按顺序移入已离也细胞沉淀中,再次OOOp7200PBS。()、每孔加入叫溶液W重悬细胞巧)、加入20叫Qiagen蛋白獻吹打混匀。9、加入20〇nerALiU,15s()lBuf裂解细胞吹打W充分裂解细胞。°10、将样本放入%C水浴中艘育lOmin。时间不可超过lOmin,长时间解育对()DNA的质与量无影响。II、瞬时离也1化,使残留在离也管盖子上的液体甩下。()1、添加200100%乙醇,吹打混匀15s,然后瞬时离也lOstJl离也盖上残留液(巧叫体。、小也转移W上液体到配有2ml收集管的QIAampMini离也柱中。在转移过程当中不能弄湿管口边缘,轻叩盖子,8000rpm离也Imin,并把柱子转移到新的2ml收集管中,弃掉滤液。14IAMini离屯、、am,500BuferAW1轻轻打开Q柱盖子加入溶液,保持管()p叫缘干燥,SOOOim离也Imin,并把柱子移入新的收集管中,弃掉滤液。,轻叩盖子p15、轻轻打开IAampMini离也柱盖子,加入50(ilBuferAW2溶液,保持管()QH、缘干燥,轻叩盖子,14000rpm全速离屯3min,并把柱子移入新的收集管中,全速离也Imin。y6)、将QIAampMini离也柱移入1.5ml离也管中,弃掉滤液,轻开盖子加入lOOfil蒸溜水,室湿放置Imin,SOOOrpm离也Imin。’-17DIOOO80。()、用N微量吸光光度计检测浓度并于C冰箱保存待用-注,2602801819。;用于实验的DNA样本/:..30 中国医学科学院北京协和區学院硕±学位论文1.5.3收集细胞上清、并收集细胞提取RNA样本收集复孔细胞,提取RNA样本。使用Qiagen公司RNeasyMiniKit(250),货号74106,具体步骤如下:1()、提前准备好下游所用试剂,备用。、弃掉细胞培养基,每孔加入1mlPBS溶液清洗后弃掉PBS溶液。(巧63、根据细胞(小于5xl0个细胞),直接将350BuferRLT直接加入孔内,充()叫分裂解3min。(4)、加入与W上裂解液等体积的70%的乙醇溶液,充分吹打,不寓也。5、将W上细胞液收入1.5ml离也管中,lOOOipm离也5min。()6、转移W上液体700(包括任何的沉淀)到配有2ml收集管的RNeas也()叫y离柱中,轻叩盖子,llOOOg离也20s后,弃掉滤液。(7)、加入700^llBufer民\¥1清洗柱子,轻叩盖子,1100〇3离也2化弃掉滤液。巧)、加入50〇nlBuferRPE清洗柱子,轻叩盖子,llOOOg离也20s,弃掉滤液。(9)、再次加入500叫BuferRPEW再次清洗柱子,轻叩盖子,llOOOg离也2min,并弃掉滤液。10、2mImn()将柱子转移至新的l收集管中,全速离也i。'1、15m,40RNA"OOO。将柱子转移至.l离。管中力口入酶水,也Imin,)山去g离洗脱RNA。如果RNA的量大于30腿,可W再次加入40叫去RNA酶水W重复W上洗脱步骤,或者用W上洗脱液重复洗脱。’000-(12)、用ND1微量吸光光度计检测浓度,分装并于80C冰箱保存W备用。注:①在提取RNA的全过程所用水全部为去RNA酶的水。操作全程都需要戴手套及口罩,RNA,提取过程尽量迅速,W防止RNA降解样本需要分装后再冻存。②所用于实验的RNA样本,260/280:2.0左右。2.全基因组DNA甲基化敏感性限制性分析(MSRA)在本实验当中,我们用于刺激细胞的阳性刺激物是已报道的可W调节DNA甲基一5-5azac)DNA甲化水平的氮杂胞嚼巧核巧(。研究表明,5azac是种可W让基化水平降低的阳性刺激物。而且我们知道多种技术平台与手段都可W用于评估DNA甲基化水平一一,其中种较为方便、便利的种方法是甲基化敏感性限制性分析(MSRA)PU巧方法是利用两种限制性内切酶MsI及Hall,Ms议邮all是彼此的同列敵它ppp们可W对不同甲基化状态的CpG二核昔胞喀巧识别并剪切,Hpall只能识别非甲基化的CpG二核巧胞喀晚,而MsI既可W识别非甲基化的CpG二核昔胞略巧p,也可W识别甲基化了的CpG二核昔胞嚼瞎。该部分实验所用的阳性对照DNA样本为LambdaDNA,该DNA分子,大小为48502bp,其分子上面各有17个MspI及Hp加的酶切位点,31 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文W此DNA作为鉴定酶切体系是否工作的标准。酶切过后,制备1%琼脂糖胶对酶切产物进行鉴定,被酶切的并应用QuantityOne软件进行灰度分析,评定DNA甲基化率。2.1实验所用试剂盒及耗材本部分实验所用试剂主要是MspI及Hpall内切酶、LambdaDNA等详细信息见,表6表6:MSRA实验所用试剂或耗材及仪器详细信息试刑金、巧械仪當铺货号獻他^M巧I内切酶R010化购于NEB公司Hpall内切酶R0171L购于NEB公司LambdaDNAN3011S购于NEB公司—购于北京环宇金鹰公司SOxTAEdiferW(DL5-1DNAriderange002000)makerD5胸于TaKaRa公司19A2丄IMSRA实验步骤2.1丄1酶切反应1、调整样本DNA浓度,取叫gDNA样本。()(2)、按照下体系配置酶切反应液。海巧反应组々巧pl体系DNA模板/lx样本jgB51/样本lOxNEufFer^限制性内切酶lOunits/样本蒸馈水至25^11/样本3,()、轻弹混匀不可祸旋震荡。’(4)、37C金属浴,解育1小时。(5)、加入6xLoadingBufer终止酶切。2丄12配制1%琼脂糖凝胶.,并跑胶鉴定酶切情况,W判断DNA甲基化水平1、将SOxTAE溶液稀释50倍,配制成IxTAE溶液,并称取2,()g琼脂糖(2)、并加入200mllxTAE溶液,凉至微烫,加入核酸染色液。3、倒板,放置于室温,25min。()4、上样。()32 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文5、200V恒压,20min。()(6)、用凝胶成像仪照片,并用QuantityOne软件分析灰度,鉴定DNA甲基化水平。-RNADNADNA甲基3.通过RealtimePCR检測受剌巧鄉胞样本中去甲基化巧及化转移庚的相对表悲量3丄本部分实验所用试剂盒及耗材,详细信息同表3.3.2实验步骤32.cD.1NA的合成具体实验步骤同前,详见1丄3.2.1将RNA样本逆转录为cDNA的过程。322-mReatR检测TETs、TDG、DNMTs。..liePC的相对表达量-具体实验步骤、扩增体系、扩增条件、扩増引物等同前,详见L1.3.2.2RealtimePCR过程。4.统计学分析1、MSRA实验结果应用QuantityOne软件进行灰度分析。2--、RealtimePCR实验数据W相对表达量2AAct表示,其中的数据使用GraphPadprim5软件进行统计学做图和分析,结果中组间差异比较的统计采用******Unpairedttest方法进行计算;p值<0.05、p值<0.01及p值<0.001均被认为有显著统计学差异。二、实验结果1-…7RVDNA去甲基.利用RealtimePCR实验,检測两种细胞裂解抗原則澈组化巧及DNA甲基化转移麟鋪结核病相关抗原H37RV,对细胞的刺激作用,随着时间不同而有所差异,收集Rea-tPC民检DNA甲基加入刺激物后不同时间点RNA样本并进行lime测,对调节化水平降低的DNA去甲基化酶及调解DNA甲基化水平上调的DNA甲基化转移酶的表达水平进行检测。对不同时间点基因的相对表达量进行差异分析发现:无论是549还eas-2B细胞A是B,再加入拟7Rv抗原刺激4d后,在DNA甲基化水平降低时,均可检测到H37RV刺激组DNA去甲基化酶的差异性表达上调。这与临床检测结果肺结核病人组DNA去甲基化酶差异性表达上调相吻合。而对于DNA甲基化转33 中国医学科学院北京协和医学院硕丄'学位论文移酶(DNMTs)在A549细胞中,H37RV刺激组可检测到差异性表达上调(DNMT3A、DNMT3B)-2BHRV。这与临床样本检测结果趋势相同。而在Beas细胞37刺激组中发现DNMTs差异性表达下调。详见图5。AA549TBT!m2TBT5?*??’…"""]13DNMOnmiADTBT1NM3。 ̄却■頓,琴,BBeas-沈TPT5TET3T饥meT1TEU?…相心山111////////圓"圆?DNMT3A’.,…"**]1^^化DNA基化转巧巧甲1//////5-2BDNA去DNA甲基化转移图:H37Rv刺激A549、Beas第四天甲基化酶及酶表达情况A组:A549细胞被H37RV刺激第巧天DNA去甲基化酶及DNA甲基化转移酶表达B组Bea-2BH37RVDNADNA情况,s细胞被刺激第四天去甲基化酶及甲基化转移酶<0**<表达情况.05、<0.010.001。。值值及V值均被认为有显著性统计学差异2.利用MSRA实验,检测不同刺激物刺激不同时间所收集的细胞DNA样本甲基化水平对DNA样本进行MSRA检测实验,结果发现5azac阳性刺激物都可W降低DNA甲基化水平,这与临床全基因组甲基化芯片结果相同。具体体现为;在加入刺激物一三、四天DNA甲基化改变较明显后第天开始出现甲基化水平下降,第,,即随34 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文时间变化,DNA甲基化水平降低逐渐明显。详细情况见图6。HPA2+MSPl+HPA2+MSP1+HPA2+MSP1+HPA2+MSP1+A549-__con化〇15。,。-H37"v.s‘BHGSBPBea-s2BHPA2+MSP1+HPA2+MSP1+HPA2+MSP1+HPA2+MSP+__1__coWrol5azac-sti^|g^||H37Rv-sti图6:不同刺激物不同时间对细胞DNA甲基化的影响5acac37RV549B-2BNA甲及H抗原刺激A、eas细胞,D基化程度从刺激dl开始出现降低,d3、d4降低较明显。3.5azac及H37RV裂解抗原对细胞的刺激作用的时间动态图一DNA甲基化、为了进步明确肺结核病与之间的关系,我们分析了0点加入刺激物后Id、3d、4d、6d不同时间点的DNA去甲基化酶(TET1、TE巧、TET3、TDG)及DNA甲基化转移酶(DNMT1、DNMT3A、DNMT3B的表达情况,结果显A549细Bea-2B,7Rv)示:无论是在胞中还是在s细胞中从加入抗原刺物(H3第一一DNA去甲基,天开始,化酶随时间变化逐渐升高详细见图7。且在刺激第天时阳性刺激物(5azac)和抗原刺物(H37RV)对DNA去甲基化酶的作用显著且相似,一,表达量湿著改变的酶WDNA去甲基化酶(TET12、TET3、且在剩激第天时、TETTDG)为主。详细见图8。35 中国医学科学院北京协和医学院硕丄?学位论义AA549师丽TDGTET3*1?? ̄—— ̄A奉踰I]II?…。DNA去甲基化廣I^,^::可 ̄—i?W^i111rfl.」^^^^去DNMnDNMT3ADNMT3B。,"???瓜]’口1口1口,.,??53T-WI"?MWDNA甲基化转務Ri…i…一^"杉―—J—— ̄—,,,1I〇11j1i1山I110々I144夺冷夺?4BB-化S2BTET1TEHTET3mc:卫2丑1口1叫I?访TPvII^快*細DM去甲麵I令^^1"〇。T11-..■——??7OJ1IIT主M1,r,r"II11去A夺?*^^^4去夺??DNMT1DNMT3ADNMHB"'+臨I1I?恤W/I3"I'DNA甲*’%'基化巧巧?、>!"化1^化*— ̄—?*"JI1IIIJ ̄I111IOjIIIII7H37Rv-、5azacA549、Beas2Bs、TDG、DNMTs图:刺激两种细胞不同时间TCT的变化趋势HRv)A5、Id、A组:H組实验(control组、5azac刺激姐、37剩激组49细胞Od3d、4d、6dDNA去甲基化酶及DNA甲基化转移酶的表达稳势。B姐:H组实验组37RVa-2BI、、6(control组、5azac刺激、H刺激组)Bes细胞Od、d、3d4ddDNA去甲基化酶及DNA甲基化转移酶的表达趋势。36 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文A:A549-W巧巧H,T1川巧10TDO,*"/i.^拖报掠''*/////////〇d1DNMT1d1DNMT3Ad1DNMT3B.-含1。?52.01,I11|iIfilillIm'/'//////Bd1巧T2d1TET3d1TDG-**<.1-S1511方 ̄ ̄1|口-IIr^iilmlllllllJt/////////dIDNWnd1DNMT3Bd1DNMT3AA549Bea-8IDNA图:胎7Rv及5azac刺激、s2Bd后表达趋势相同的去甲基化酶及DNA甲基化转移酶A姐:H37RV及5azac刺激A549Id后表达趋势相同的DNA去甲基化酶及DNA甲-基化转移酶。B组:H37RV及5azac刺激Beas2BId后表达趋势相同的DNA去甲基化酶及DNA甲基化转移酶。37 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文兰、小结本部分实验,主要利用MSRA实验方法检测了DNA甲基化的变化情况,同时R-应用ealtimePCR技术检测了TETs、TDG及DNMTs的相对表达量:。结果显示-1、RealtimePC民实验中,在加入刺激物刺激4天时,两种细胞拟7Rv刺激姐都可W检测到DNA去甲基化酶表达显著升商,这与临床样本检测结果相吻合,这提示我们DNA去甲基化酶可能是促使形成DNA低甲基化趋势的主要影响因素。2、在A549细胞中H37RV刺激组DNA甲基化转移酶表达显著升高,这与临床R-t样本检测ealimePCR结果肺结核病人组DNA甲基化转移酶差异表达情况相吻-合,在Beas2B细胞中H37RV刺激组DNA甲基化转移酶差异性表达降低,这与目前理论研究相符合,但确与临床检测结果不相符,这说明H37RV抗原对两种细胞的DNA甲基化转移酶的刺激效果是非特异性的,这间接地说明了,DNA甲基化转移酶可能并非肺结核病人DNA低甲基化庭势形成的影响因素。3、在MSRA实验中,利用H37民V裂解抗原刺激细胞可W使DNA甲基化降低,即与全基因组甲基化芯片检测临床DNA样本所发现的肺结核病人DNA低甲基化趋-势相符,且随着随时间变化ealtimeCR实验,DNA甲基化水平降低逐渐明显。RP7Rv一中,DNA,在加入拟抗原刺激天后去甲基化酶随着时间变化逐渐升高。这两方面存在相关性,呈负相关。即随着时间推移,DNA去甲基化酶表达逐渐升高,且DNA甲基化水平逐渐降低。4一、在刺激第天时阳性刺激物5azac)H37RV)DNA(和抗原刺物(对去甲基一天时显著改变的酶WDNA去甲基化酶的作用显著且相似,且在刺激第,表达量3一化酶(TET1、TET2、TET、TDG)降低为主,这与第天DNA甲基化无明显变化存在相关性。38 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文讨论本文首先收集了肺结核病人及其健康人全血样本,提取DNA,利用全基因组甲基化孩片技术平台初步明确了肺结核病人DNA低甲基化状态。同时,我们提取全R-血RNAealtimePCR技术检测了活动性肺结核病人即将康人群全血RNA,利用中TET、TET2、TET3、TDG、DNMT1、DNMT3A、DNMT犯的表达情况W探索导致肺结核病人DNA低甲基化状态的可能影响因素,W初步建立TETs、TDG、DNMTs与肺结核病人DNA低甲基化状态之间的相关性。随后,我们在体外,利用A549、一B-2BDNAeas两种细胞系模拟肺结核病低甲基化状态,并在体外进步探求造成DNA低甲基化状态的可能的原因。一DNA去甲基DNA、肺结核病人化酶j彭咱低甲基化趋巧的相关性分析在本课题第一DNA进行了全基部分中,首先我们对肺结核病人及健康人全血因组甲基化水平检测ea-tmePC民实验,然后利用RNA样本,进行Rli,分别检测了可W下调DNA甲基化水平的DNA去甲基化酶(TET1、TET2、TET3、TDG),然后为了从多个角度进行验证>DNA甲DNA甲(1上,检测了可^调基化水平的基化转移酶。结果显示,活动性肺结核病人DNA呈现低甲基化状态。而且实时巧光定量PCR结果显示,在已报道的可W参与调解DNA甲基化水平改变的DNA去甲基化酶(TET1、TET2、TET3、TDG)在肺结核病人组全部差异性表达上调。DNA甲基DNMT一DNA甲化转移酶(s)中只有种基化转移酶1(DNMT1)表达显著升髙。在体外细胞刺激试验中,在两种细胞H37RV刺激组,首先检测DNA样本,DNA甲基化水平呈下调趋势,且随着时间改变,DNA甲基化降低明显。然后检测RNA一样本,在RNA水平上,H37RV刺激姐中DNA去甲基化酶在刺激天后表达逐渐升高,DNA去甲基化酶表达随时间无特异性表现。且两株细胞在加入H37RV抗原刺激四天后都检测到了不同DNA去甲基化酶差异性上调(A549细胞TET2、TET3差异性上调Beas-化中TDG)DNA甲差异性表达上调;同时也检测到了不同基化;3A-转移酶的差异表达(A549细胞DNMT、DNMT3B差异性表达上调、Beas2B中DNMT3A差异性下调)。首先,通过对临床检测结果及体外细胞刺激试验结果进行分析发现:在临床样本检测实验部分肺结核病人组,表达显著升高的相关调节DNA甲基化的酶中,主要W可促使DNA甲基化水平下调的DNA去甲基化酶为主;而且体外细胞刺激实验肪7Rv刺激组也检测到相应DNA去甲基化酶的表达显著升商。因为TETs及TDG主要参与DNA的主动去甲基他过程,W上这些结果与DNA低甲基化趋势相吻合,而且与目前研究理论相符合。所W这些结果都提示我们在肺结核病的发生发展中,39 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文肺结核病人体内DNA低甲基化趋势可能主要是由去甲基化酶参与调节的。其次,临床检测结果及体外细胞刺激试验结果也显示:无论是临床检测结果还是体外细胞刺激实验结果,都能发现上调DNA甲基化水平的DNA甲基化转移酶都一有不同程度的差异性表达。方面,在临床样本肺结核病人组及A549细胞H37RV刺激组表现为DNMTs上调。因为DNA甲基化转移酶(DNMTs)对DNA甲基化水平的调控也发挥着重要作用、扮演着重要角色。那它们差异性升高可能的原因是:一组DNA低甲基化趋势是一,全基因个整体上的反映,这避免不了在这种整体低一些基因的DNA甲基化水平是升高的些基因需要甲基化趋势的结果中,仍有,这一些功能的正常巧使那么甲基化水平升富来维持机体正常状态W及,这些基因,DNA高甲基化水平可能就需要DNA甲基化转移酶(DNMTs)参与调节。二,目前有研究表明DNA甲基转移酶(DNMTs)可W促进胞喀瞎被氧化了的第5位碳原子上取代基的添加或移除,在体外已经证明了DNMTs可W与5hmC相互作用,所W529DNMT[’s理论上是可W参与去甲基化过程的气但这种逆转的DNMTs的作用的生一一。物相关性还未可知,这方面可能是比较有趣的去甲基化机制的另个关注点另一Beas-2BH37RVDNMTs方面在细胞中刺激组表现为差异性表达下调,这与目前研巧进展也是想符合的,DNMTs是参与上调DNA甲基化水平的主要酶,这项结果一表明,DNA,可能在机体DNA甲基化水平降低的过程中甲基化转移酶也起着定一作用,也是其中的调控因素之。:n、肺结核病人的低甲基化趋势可能通过增强免疫应答来影响疾病的发生发展DNA甲一NA甲基化是调节免疫系统的重要机制之,而且D基化主要是通过影响基因表达来发挥调节作用的。而且目前对于结核病宿主体内甲基化情况的报道相对较少一。因此,因此了解活动性肺结核病人DNA甲基化水平对于进步研巧宿主免疫系统的应答机制有着重要意义。在肺结核病人体内,DNA甲基化水平降低,而DNA甲基化水平减低可W通过影响功能蛋白的上调表达进而影响疾病的发生发展PS’99一。这为新型药物的研发W及新型治疗手段的探求开拓了条新的道路。在目前的研究进展当中,DNA甲基化可W通过调节免疫系统应答来影响多种疾病的进展,,,研巧最多的就是肿瘤疾病当然近年W来DNA甲基化设计的疾病越来越多、,种类也越来越广。比如糖尿病、屯血管疾病、风湿性疾病、乙肝、寄生虫感染等多种慢性病及感染性疾病等等一部分中对全基因姐DNA甲。而本课题第基化苍片的方法获得的差异位点所涉及基因进行归类分析一,我们发现有相当部分基-因定位在了与肺结核病免疫应答密切相关的抗原呈递及IFNY介导的信号通路上。这与已报道的大量研究成果非常接近这都提示我们,肺结核病人DNA低甲基化可能影响其免疫应答过程,而且肺结核病的发生发展与DNA低甲基化状态密40 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文切相关。S、DNA去甲基化巧及DNA甲基化转移巧在同种剌激物剌激过的不同细胞中差异表达的趋巧及种类不同一RV,实验结果表明,种刺激37对于同,例如用H裂解抗原刺激两种细胞时DNA甲基化转移酶DNMTs在两种细胞H37RV刺激姐中虽然表达都有显著改变,A54-,而在Beas2B但其差异表达的趋势不相同,在9中表达显著升高中表达湿著一降低。而且两种细胞即便是同类酶表达量趋势相同,表达显著改变的酶的具体种一37RVA549和B-样,虽eas2B两种类也不,具体举例来说,对于同样的H刺激然细胞均有H37RV刺激组DNA去甲基化酶(TETs及TDG)表达的显著升高,但具体差异表达的DNA去甲基化酶种类却不完全相同:在A549中表现为TET2、TET3、B-2BTDG表达湿著升高eas表达显著升高。这竖实验结果与目,而在中之表现为、DNA甲前理论研究是相符合的。有研巧表明,在糖尿病屯肌细胞中基化转移酶DNMT一DNA甲DNMTA1DNMT3B表达上调3及,而另外种基化转移酶差异性PSl一些疾病中表达下调。而在另外,如乳腺癌中,DNMT3A却差异性表达上调送种结果可能是由于:首先,这可能与细胞类型不同,功能不同,那么参与不同功能调节的DNA去甲基化酶及DNA甲基化转移酶类别或种类就有所不同。其次,调节DNA甲基化水平的DNA去甲基化酶及DNA甲基化转移酶在不同细胞中的表达是不完全相同的,及具有细胞选择性。41 中国医学科学院北京协和医学院硕古学位论文结论本课题首先分析活动性肺结核病人和健康人全基因组DNA甲基化水平,同时'a-提取全血RNA样本,进行ReltimePCR实验,检测DNA去甲基化酶(TET1JElS、TET3、TDG)及DNA甲基化转移酶(DNMT1、DNMT3A、DNMT3B)的相对表达水平。随后我们在体外利用阳性刺激物5azacW及肺结核病相关抗原H37RV刺激A549-、Beas2B、DNA、R两种细胞系,进行模拟实验,收集细胞上清NA样本,利用甲基化敏感性限制性分析(MSRA)实验技术检测DNA样本,观察DNA甲基化水平的改变。并且同时对不同时间点所收集的RNA样本进行实时巧光定量PC氏检测目前已报道的可W调节DNA甲基化水平降低的DNA去甲基化酶(TETs、TDG)及可W调节DNA甲基化水平升高的DNA甲基化转移酶(DNMTs)的表达情况。结果发现:1、HRV无论在活动性肺结核病人中,还是体外细胞刺激实验37抗原刺激组中,DNA甲基化呈现低甲基化趋势。2DNA去甲DNA、在在结核病人体内,基化酶可能是参与其低甲基化趋势的主要的酶。3、而对于DNA甲基化转移酶,由于其表达变化无明显特异性,它对肺结核病人DNA低甲基化趋势的调控作用不明确。但它确实差异性表达,这说明可能体内,其他生物过程如其他基因的高甲基化状态,需要它的维持。42 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文的文献1.Gainsintuberculosiscontrolatriskdueto3millionmissedatientsanddruresistance.ProresspgginTBcontrolcanbesubstantllacceleraedbadd巧巧inhesehallenese打ub/'ciaytygtcg.Ct扣rJPeo化-H/7201321:2%237.,2.Lo巧nzrombPchalmedaousadaLMalardoe〇/nranaIiJCToneARoCDAiLRTt.It巧,,,巧,,vaccinationw化hmessengerRNAasanewapproachin呂enetherapy:useagainsttuberculosis.S/WC执otech打〇/2010,10^7.''tendah--mmun3-erlhortenneshortcoursetheranshtsntohost.Schon1mMS0.SithiiiiitX,gpygyma巧amen-contrib川e化newttt巧巧teiesfortuberculosis.■/扣temMeof2013巧3:%8382.yg,-e4larfnf.KunnathVudhanSPocelliSA.RecentAdvancesinDeiintheImmunoroteomeoy,gpMycobacterium化berculosis.片ont/mmii打〇/2013,4:巧5?5.BozzanotMarrastDeMariaA.Immunologyof化berculosis.Me曲化片7片e/noto//n/ectD/s2014,6:e20140巧.^州6.BeharSMCaiterSM化otMGBarberDl_JaaramanP.OrchestrationofulmonarTcell,p,y,,ypyM■mmunitdurincobacrumuberculossnfection:immunin化rnjus■m,打mmuno/iygyteitiityipt.Se/-201426:559577.,-Me7.SoJSKGSonMrketCf/6oxfiavonenhbsimCLeeCGPaEKimHJ.thiiitNFAT,,g,,,,y巧-translocationin化化enucleusandsuppssesTcella如vation.i/mmuno/2014193。7722783.,man-.Beostoslavskdemehlaon:rnineneson〇/C/rem巧98巧M.DNAtti化.扣1998:401407.乂yRyg邑,-.Lan化aoe〇/.reulatonofcoRNAbatts9iDiXPZhangWSunSH化GYtUpiMir146aii化,,,gX,gyH巧BVirusXProteinContribu化s化HepatitisDevelopmentbyDowiuegulatingComplementFactorH,MBio2015,6.10AtsbaMaszewczMonuszkoklinskiJAllaercroRula化rsof.RusekAMiAiMNiH.MiNAmod,,巧,,,gyeenecreulationhetumormcroenvronmentandtheimmussemnluncancerolpigtigtiineti.M,ygCancer.201514:34,"11.AnselKM,[)uieticI,TanasaBRaoA.R巧ulationofTh2diffewntiationand114locusacce巧ibilit.j,yAnnu-RevImmunol200624:607656.,12.OkitsuCY,HsiehCL.SensitivityandspedficityofimmunoprecipitationofDNAcontaining5-Methlctosine.SMC/?货A/ot的20:158:102yy.,13GaoRanLKonJianJSokolovWan乂Asse巧mentofDNAmethlationchanesin化sue.Y,g,乂Yggyg’-cu.ltureofBnssicanaus.Genet/to201450:13381344p,14.ildtinVPSointsevaSVNik化nPzrevS.TheroleofDNAmethlationinemechanismsN,,iVKoAth,yy巧9-ofmemorreconsolidationanddevelomentofamnesia.Se/?GVSramR巧2015:148巧4.y,pSan-15.tosF,PeatJ,Buige巧H,RadaCReikWDeanW.Activedemethlationinmousezotes,,yyginvolvescytosinedeaminationandbaseexcisionrepair.EpigeneticsChromatin20136:39.,*amosErochosk-化iMraunnkGGCavallNJ防beroe/.ienetic.RAGBP口doKSeisi,,iEMt〇Ep,,,,gchangesofCXCR4and化5ligandCXCL12asronosticfactorsforsoradicbreastcancer.户Onepgp20116:e29461.,-17leembbasKMananMazhmedBlet如eviewrafrcancer.SaMAHAAiM.REpigenetictheo.,,,U,,,py’-户cfkJharm打20巧28:1023.P51032,18alterationa巧ecancer/o/edRe.FuD任EpigeneticsinliReview.AfM20巧.g()p巧讯uanJ■lonesAeeSHNiIikaneta/Thednamicsandrono油coentialof.gLEFHZM.t,,,g,巧,,ypgp43 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文'DNAmethylationchangesatS化mcellenelodinwomenscancer.化〇5Ge打et2012^:el002517.g20.ChanCYanWeezenb化kCMorirsonhaleneselobalconrolofigVEnaDA.C化化t,,Xgg化-berculosis.Re坤wro/ogy201318:596604.,CCTcheenETBe说rraMCCohenuhesKCZhanet-21Of/heefectofHIVrelaed.Huang,tgXH,.Tt,,ggZ,mmunosuressonontheriskofuberculostransmssonohouseholdconClinnectippitisiittacts.Ifs458-D:765774.i201,22.FraserA,PaulM,AtamnaA,LeiboviciLTreatmentoflatenttuberculosisinpersonsatriskform-巧s-u化ruistantUiberculoss:sstematcrevewn/bercun10:巧23.idgiyii./tJTlLgDk2006,23anSao_uoet〇/skfactorsforoort巧amentoomesnaen.TangSTYlLiLi?Ritutcitits,,,tLGKpp-and-nhna-OneMDRTBXDRTBC:retrosecvemulc饥ernvesationw化hiiptitititig.2013足e扣943.24.CaruatiMSchiroliZaniniFVanoniNGalliMAdorniFetal.Anewredictivemodelforang,Q,,,,pm-wrovedresra化rsolaton巧ratenHnfectedatenw化hPTB.fibercjsippiyiigyiIVipi怯/n7TiLgD/-拍620141&831.,25.化nnaGRGanlebodlflmoU巧BamoneleiJNEaAT.Prevaenceonarjberculosis叩p,y,puy)gp(w化h-lnHnefandsenvrons,n讯C7打/cro扣0/49:23323tiviIVAIDSPLWHAiKiiti/J/W2009g/(),-巧s26lexanderheemeenceofexensveldojsntuberculoss:.APEDeP.T巧tiitatiTBHIV,yg(TB)/mu-confectionltidojresisdtheresultinublichealththreatfromexensiveli,gtantTBangpty--巧druresistantloballandnanadaan打ectsed/croib/o/18:2891.gTBiC.CJ/D/MZW2007,gy/,27.AagaardC,DietrichJ,DohertyM,AndersenP.TBvaccines:currentstatusandfutureperspectives,’mmuno/-Ce//&〇/200987。79286/.,toBPTheG-28lobalPlanSoTB20062015.acionsforlife:化wardsaworldfreeof.SpT.化tpt,tubercufD-losis.ntJTubercLunis200610:240241.g,29.LiuJTranLeunASAlexanderDCZhuB.BCGvaccines:heirmechanismsofatenuationand,乂g,,t-.imacton巧feandrotectiveeficac.HumWscc/n20095:7078pty,py.Brock30IWeldinhKLillebaekFollmannFAnders飢P.ComarisonfUiberculinskin化Stand,g,X,po■-.打化扣巧.newsecificbloodstintuberculosiscontactsAm7Res/VMeaf2004170:6569php,31.BeBoukhebzaHllonNLimacherJMInchauseG.Theraeuticvaccinaiontotreatchronic,,,pptMVA-infectiousdiseases:currentclinicaldevelopmentsusingbasedvaccines.HumVaccin-/mmun8.o化er2012:17461757,32.EsterhuyseMMUnhartHGKaufmannSH.Can化ebatleaain巧tuberculosisainfrom,,ggeienetic巧巧arch?rren妃M/crob,o/201220:220J26.pg,33-ans-rona.SinChanRHugA.DNMTsapotentialtherapeutictargetsinhighriskpediatricembyl-brain化mors.反rpe/tO/n7/jer7beb201418:11的1107.p巧,ruuer-azacannecobacteraco34lsas.SutASiSSixouSLakhdaGhlToaneelleG.Miliid,g,,t化Lygypotentlathoenctftoltfsochemtrpiapgiiyefecrs:aerationomodelandnaturalmembrane.Biisy1990-8502巧:8498.,35.AlfanoFPelettoSLuabelliMGBorrielloGUrciuoloGManiaciMGeta/.Ident巧cationofsinle,,,,,,gnucmor-leotidepolyphismsinTolllike巧ceptorCandida化genesassociatedwithtuberculosisinfectioninwa化rbuffalo(Bubalusbubalis)?执\4CGenet2014,巧:1巧.36.MortazE,AdcockIM,TabarsiP,Masje出MR|MansouriD,VelayatiAA/etcr/.In化巧ctionofPatern化巧..ReconitionRecew化hMcobacteriumTuberculosisJ知打/mma内〇/2014gpy37-----.TorresGarciaDCruzLaunasAGarciaSanchoFiueroaMCFernandezPlaRBaezSaldanaR,g,g,ta,,*Mendo巧-M-illaCe〇/.VariantsinlllikereceU>r9enein巧uencesus说化ilit,t化pgpty化44 中国医学科学院北京协和医学院硕古学位论文化brcu.elosisinaMexicanoulationJrmns/Mf201311:220.pp饥,巧ss-38ua巧zENun拉CSadaEEllnerSchwanderSKToresM.Diffe巧nialexionofIblllike.J,,,化,tpreceptorsonhumanalveolarmacrophagesandautologousperipheralmonocytes.RespirRes201011:2.,巧-.BeharSMMartinClNunesAlvesCDivanahiMRemoldHG.Liidsisd,,巧optos?加,,,gprosresenta.c^ption:linksinthechainofhostdefenseagain巧Mycobacteriumtuberculosistorob巧-A/nect201113:7497巧/.,"化ao40.BeharSM,Martina,BootyMGNishimuiaXX,GanHXeta/.Ao化化isaninnate,,ppdefensefunctionofmacrophagesagain巧Mycobacteriumtuberculosis.MucosalImmunol-20114:2巧287.,-41.BarnesPFLeedomJM〔hanLSWonSFShahJVachonLAef/.P化dictofshoterm,,tc巧ort,,,g,巧8-ronossnatenw化hulmonartuberculosis打ect执51988:366巧1pgiipi怯py.,./42.HsuPCYanCCYeHuanYChianPCLeeMH.Pronosicfacrsofiberculousmeninitis化,ttoU,g,gP,gggnadu-ls:a6ear巧rosecvesudatatertiarhos化atinnorernTaiwan.JM/crob沁/Itytptityypthmmwno/nect///2010,巧巧n-43lomrnunneutrohilsfaciliteacivaionofnaiveaniensec讯cCD4+Tcells.BgRE巧JD.L枯ttt,gpgp-^duringMcobacterium化berculosisinfection.■//mmuno/2011186:7110:19.y,-ManR44.ZhanXMalessiLDeriaudELeclercCLo.CoaivionofSkkina巧加dMD88g,ctat,j,,yyadaptorproteinpathwaysbybacteriapromotesregulatorypropertiesofneutrophils.Immunity200931^61-771.,C>45lifJMfmannSHMcShaneHvanHeldenFCVGairaA.Thehumanimmuneresonse.Kau,,,化,pU-iberculosisancMtstreatment:aviewfrom化eblood,/m/mino//?ev20巧之64巧8102.,如.化战iA,CatellaniS,MussoA,ZocdiiMR.GammadeltaTlymphocytesproducingIFNgammaandM-f_17inresponsetoCandidaalbicansormycobacterialantigens:possibleimplicationsoracute ̄巧.andchronicinflammation.Q/rrMedChem2009:47434749,47-.SzeredaLBalikoIS巧keresBarthoJ.Gamma/deltaTcellsubsetsinatientswithactivey,,pMycobacteriumtuberculosisinfediionandtuberculinanergy.ClinExpImmunol-巧2003131:巧71.,.HowBcetseaanstcobaceum48.MalionePJChanJllsshaeheimmuneresponiMtrig,pgybe-rculosis.furJ/mmuno/200939:676686.化,.PhuahJYMa忱円tvadB说llsn忱eranulomasofnonhumanrmates49la巧inPLnnJLAci化ii,L,ygpth-infectedwithMcobacteriumtuberculosis.AmJPaol2012181:508514.y,50.BickJ,Naumova0,HuMerS,BarbotB,LeeM,Lu化arSS,et如.ChildhoodadversityandDNA-a-ad巧nammlaxsandssemmethylationofgenesinvolvedin化ehypothalmusp化山taryiiuneyt:---l州ometeenesssocons.evschoo化〇/:whoeandcandidagii如D户yp201224141714巧.g,-hmmunes51ltonons化lefosem.KhoastehFardMTabriziMAmoliMM.IsDNAmetairesritj,,ypyt/-ies的巧9dsfunctioninschizoluenia?MedWo201177:573.ypyp,52.KohliRM,ZhangY.TETenzymes,TD6and化edynamicsofDNAdemethylation.Wcfture20135的-:472479.,-53-的.SuarezAlvarezBRodriuezRMFraaMFLoLaireaC.DNAmethlation:aromisin,g,g,pypg--.landscaeforimmunesstemrelateddiseasesTrendsGenet201228:506514.py,54.Mo巧oslavskRBeman乂DNAmelaion:re山aionofeneexpre巧ionandroleinthey,gthytgtg’’’m目-immunesstem.执〇(加/o/jsAc化巧巧:F巧50.ypy,。巧-KWK.imSJKellFuAHainesKHoffmanAZhenTet〇/Genomewidemehlaionlsis,y,,,,g,tytanay45 中国医学科学院北京协和医学院硕古学位论文-identi巧esinvolvementofTNFalphamediatedcancerpathwaysinprostatecancer.〇7打cerLett2011302-:4753.,56Wen-.ZhouWJianZUuNXuFiuYe如DownreulationofCXCL12mRNAexressionb,g,,,tL,tgpypromoterhypermethylationanditsassociationwithmetastaticprogressioninhumanbreastca-rcinomas.JCancerResClinOncol2009135:91102.,.Chr57isten乂DuonFBernsmeierC扣nDssalMiMH.Inhibiionofalhainterferong,,NaHemt,,ps-inalinbhat化isBvirus./ro/200:巧9ggy巧7\/78116t,.KarouzakslunelllnaMchelBet〇/?DNethlaton巧ulates58iERengeY,JAKoiCGEiA,Ami,g,g,yR,ygtheexpwssionofCXCL12inrheumatoidarthritissynovialfibroblasts.GenesImmun-巧2201112:643.,59.AndraosC,KoorsenG,KnightJC,BornmanLVitaminDreceptorgenemethylationisassociatedw-ithethnicitberculosisandTaolmorhsmummmi/no/201172:262268y化Ii.H/.,,qpyp,60.HayashiYShi炉nobuSWatanabeDTogaKSaikiRShimadaKet〇/?Con巧ojctionand,,,,,,characterizationofnormalizedcDNAlib巧riesby454pyrosequendngandestimationofDNAmethylationlevelsin化reedistantlyrela化dhrmi化species.化o5One2013,8:e76678.--61.WanXLiLianJLiLJinLCaiHet〇/?Genomewideandsinleba巧巧soluionDNAg,Q,,,,,gtmethylomesofthePacificoysterC巧sso巧巧agigasprovideinsightintotheevolutionofinvertebrateCGmethlation.BMCGenomics201415:1119.py,^62..An扣laSHakkolaJTuominelovaa巧EHusafve^fursiainenKKaralainenAet〇/,,ntE,g,,jMethylationofcytochromeP4501A1promoterinthelungisa巧ociatedw化htobaccosmoking.的-Ccf打cerRes2003:8抗38628.,63化anWMT..BorlandMGKrishnanPLeeCAlbrechPPBilitet〇/Modulationofarl,,,t,,y,y-hdrocarbonrecetorAHRdeenden-yptsinalinberoxisomeroliferatoractivatedrecetor()pggyppp’-巧.beta/deltaPPA化eta/deltainkeratinoctes.Ca/r/noenes/s2014:160216口(,)yg64..KarSSenutaDDebMShiliAParbinSRa化SKeta/ExressionrofiliofDNA,gp,,p,,,ppn呂?"th--巧lattb.meyionmediaedepigeneticgenesWencingfactoninieacancer幻/打味旬enet/cs2014怎20..Mdome/.65i长uXMonHXuJUZLeeJMPatilAAetcrBiochemicalcharacterizationof,,,,,-.maintenanceDNAmethltransferaseDNMT1fromsilkwormBombxmoriInsectBiochemMoly,yO-执/2015班:5565.,66.NakashimaH,KimuraXKaga乂NakataniXSekiY,NakamuraT,eta/.Effectsofdpp巧onDNAmethylationdynamicsduringprimordialgermcelldevelopmentinmice.BiolReprod说.2013:1巧,67.LiKK,Luo巧化饥乂XuJ,ChenZ,ChenSJ.DNAme化yitransfera巧sinhema化logicmalignancies.emato-片/201350:4860.,6另WalshCesorTH.CtosinemethlatonandmammaUandevelomentGenesDev.tBtyyip.-199913:2634.,69.XieS,WangZ,OkanoM,NogamiM,U乂HeWWeta/.Cloninexressionandchromosome,g,p-locatonsof化ehumannefal.iDNMT3gemi.Gene巧992%巧795,yro巧nhofer-raonhadt70Mu.tswhn化emammalan.MagtJBEhrAELerHIneractionitiiDNA,y,?methtansfe巧f..lr化amilBMCMo/日,〇/20034:7yy,71.化ZXaohaoL.ltransfe巧化oiRenJBaiXSunMeta/DNAmethverexressionin,Q,Z,,,,ypsbft化-po巧出creastcancerisassociatedw化h巧ducedexp巧ssionoesrogen巧cepralpha/b巧astcancersuscetibilitene1andoorronosis.MolCarcinog2014,pygppg46 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文*aneneress-72WieonofKruellketorrou.XiaoXTYuanPengLYuP?iticiifac4化,g,成,巧gpppgh-Dnmtl化n巧nalf.contribu化sEMTiibrosis/打A4o//Wetf20巧巧:巧961602.,73.BechtelW,McGoohanSZeisbe巧EMMullerGAKa化acherHSalantDJet〇/.Methlation,,,,,y-determfbroblastaconandfkdneotd巧0.inesitivatiibroenesisinthei.WMe2010巧:544gy,memmune-.Teiarsonessemnmmuno/74itellMRiddB.DNAthlationinthit.饥/2003109:25.,yy,75.Hamidi巧nhAKChenT.Genetical化rationsofDNAm巧hlationmachinerinhumandiseases,Xg,yy’fe-/iom/cs20157:2472巧.p旬,76.MonkemannHDeVrieseASBlomHJKluitmanAHeilSGSchildHHetat.Earlmolecular,,,sL,,,jy’th-m州t.eventsin化edeveloofediabeticcardiomoa化Am/noAc/妃2002巧:巧1336.pypy,77.曰hardWShanmuamRJurkowsktiTPJelhA.Somaticcancermutationsin化eDNMT2RNA,g,,tsctme化-thyransfe巧化alteritscatalyticroerties.执ocWm/e20巧,112:6672.pp78.HeilCS.Nodetectableefectof化eDNAme化yitransfe巧巧DNMT2onDros叩hilameiotic-巧comb.inationG3et/ies加20144:20巧2100.,巧J79.LePageDtJern电anKK,Bord饥巧einSR.The巧lativeimportanceofDNAme化ylationand-medDnm拉ia化depigeneticregulationonWo化achiadensitiesandcytoplasmicincompatibility.化er/2014,2:e678.-.Oocoosoe80iSKBestorTH.ThelrfulhitrofactiveDNAdemethlation.C//2008133:11451148.,y,y81.IerLMTahilianiMRaoAAravindLPredictionofnovelfamiliesofenzmesinvolvediny,,,yoxmo_idativeandothercomlexd讯cationsofbasesinnucleicacids.Ce//Cyc/e20098:1698r710.p,82.Sas巧A,CaglayanM,DyrkheevaNS,BeardWA,WilsonSH.Baseexcisionrepairoftandem?tt-mod..ificationsinamehlaedCGdinucleotideJ执〇/C/iem20142的:1399614008yp,(Mart.83.SersetRAinDWJrPresenceofaDNAdemethlatinactivitin化enleusofmurinej,,ygyuc-rthrllf/ieyoleukemicces.J6/oCemW82257^5818583.,84..WeissIKFinkSEdmundsSHarrisonRDonnellKContinuousaerialasmonitorin:initial,,,,yrtgg"-exer.iencewKh化eParat巧nd7inchildren.化tens/VeC饥eMerf199622:14141417p,85.LoenarzCSchofieldCJ,Phsioloicalandbiochemicalasectsofhdroxlationsand,ygpyydeme-thylationscatalyzedbyhuman2oxogluta巧teoxygenases,r巧打血BiochemSci201136-:7:L8.,-86.Meth.Tsaara化uARaoATETProteinsand5lctosineOxid如onintheImmuneSstem.CoWg,yyySrinHarh.pgSmuantBiol2014ypQ87.KohKPYabuuchanet〇eiARaoSHuunniffKNardoneJ/.TtlandTet2reulate,,,g乂C,,g-duct5hdroxmeth.yyylcytosineroionandcelllineaesecificationinmouseembronicstemcellspgpyCeWS化AT-)Ce//20;a&200213.-88lf.KimYl化imJKimBHLeeSJLeeHKChoCet〇/?Transcritionalsiencino化einhibinalha,,,,,,pgp-eneinhumana巧riccarcinomacells./ntJOnco/201241:690700.g,g--89■.VlahovicMBulicJakusFJuricLekicGSerman!SincicNKaUisicA.Eieneicde巧ulation,,,,,pgtgthrouhDNAdemethlationseemsnottointerferewiththedifferentiationofeitheliafromgyp--nt.rea3rulatmembrosinvitro.Dermotovenero/Croot200816:巧3189pgg,y--90MD..GraJeschSASeinGH5AzactidineinduceddemehlaionofDNAsenescentlevely,,tytyt化doe-snotblockroliferationofhumanfibroblasts.JCellPhsiol1991,149:477484.py91CharleJSchnekenbuerMBrownKWDiedrichM.DNAdemethlaioninc巧sessensitivitof.t,rg,eta,yy’neurob沿巧巧-lastoma化llschemohe巧euicdrus.S/ocAe所州a/vnoco/2012865.化tptg,92HechtSSTobaccocarc-inoenstheirbiomarkersandobaccoindur.NatRevCancer..g,tcedcance巧3-7442003乐.47 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文93.HechtSSroressandchalenesnselecedareasofobaccocarcnoeness.Pglgittigi.ChemResToxicol-200821.:160171,.Luevcutet94itkiiZLukinaviciusGMasevicius乂DauoteDKlimasauskasS.,,,jy---Cytosneme化itransfera化saddaldehdes.t/emi5yy化DNAWaCi8虹/20095:400402.,95.KarouzakisETrenkmannMGaREMichelBAGaSNeidhartM.Eienomeanalsisreveals,,y,,y,pgyTBX5asanoveltranscriptionfactorinvolvedintheactivationofrheumatoidarthritissnovialy巧mmu打〇 ̄brobas.?lts///2014193:49454951.,96.KimSH,LimKH,ParkHK,LeeSY,KimSH,KangHR,et〇/.ReducedIRF7巧sponse化rhinovirusunreaedw化lthDNAmethylationinperipheralmononuclearcellsofadu化asthmatics.>45/0Pac-20:.巧,511412297.Marica化JXFurtadoMN,TakenakaMC,NunesER,FincatiP,MelisoFM,etOf/.Epigeneticodu-MlatonsnctvaedCellsarlafterftdTheiiAitEyHIV1Inecionanir化ssibleFunctionalConseuceso5neq州.PLO20巧,10:e011犯34.havaUaMshracroR-t98.C乂TygiSCiPK.MiNA133areulaesDNAmethlationindiabeic,gyt-cardomoctW2.ies.8/oche/nS/o/)sRe5Commun2012425:668yypy,rovaanahnMt-99.WangYAKamaYShenKCJiJWana/.DNAmethlhansfe巧巧3a,,,gZ,H,gY,eynteracw化hreresss-titsp53andpep53mediaedgeneexpression.CancerBiotTher2005-:.,411381143佔 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文致谢惊风飘白日,光景西驰流。H年的研巧生生活在不知不觉中就到了要分别的季节。H年期间,我经历了许多,学习了许多,领悟了很多。我体验了与W往工作、学习截然不同的氛围与环境,也认识了很多帮助过我的朋友、老师、同学。在此毕一业之际直陪在我身边的朋友和关也、指导我的老师们致W真诚的感谢!,向首先,我要感谢我的导师,刘海鹰副研巧员。在S年的研究生生活中,我的导师在实验、学习和生活中给予很大的帮助。在实验及学习上,我的导师总是给予我!她W她广博的知识无微不至的指导与教诲,深厚的科研功底,精益求精的工作作风将我带进科研这条道路上来。在我的课题设计、实验计划和实验开展中都给予了很大的督促与帮助一。本论文中所涉及的课题就是在她步步的指导下完成的,凝聚了她大量的也血,在课题研巧进展过程中,刘海鹰老师多次询问研究进程,总是为我指点迷津,帮助我开拓科研思路。精也点拨、热忱鼓励,使我在遇到困难时依然能够坚定信也、不断前行。生活上,,我的导师W平易近人、朴实无华的人格魅力严W律已、宽W待人的崇高风范,为我树立了很好的榜样,从中我受益良多,学会了很多做人做事的道理。兰年时光,如白骑过隙,虽然仅历时H载,但我的导师却给W受益无穷之道。非常感谢我的导师,,对我老师的感激之情,无法用语言表达在此再次表示忠也的感谢。感谢我们研究所和所外各位专家、教授们在我开题报告、中期考核和毕业答辩过程中所给予的无私指导和耐也帮助,使我的课题和实验能够科学、合理的开展,及时发现并解决了课题中出现的问题,使课题得W朝着正确的方向发展。在此,向他们表示衷也的感谢。同时,也感谢金奇老师及所里其他各位领导、老师为我们创造了良好的学习、生活环境W及科研氛围。所里各位老师组织的科研讲座让我们开阔了眼界,,拓展了知识领域。在生活中各位老师不辞辛苦,能够及时的为我们排忧解难使我们可也学习和实验一,拥有个舒适的生活环境。在我整个课题过程中,感谢深圳市第H人民医院的陈也春教授及其所带领的团队给予的帮助。感谢他们所提供的临床样本。感谢他们在工作及生活中所给予的各种支持。在跟着陈教授学习期间,,陈教授平易近人的性格让人感到无比亲切陈教授科学严谨、实事求是的研究作风对我的科研学习产生了很大影响。为此表示真攀。、、的感谢在深圳期间也认识了杨帆张洁云朱秀云等朋友,他们无论在生活上还是在实验中都是非常亲切的良师益友。他们在我深圳学习期间给了我很大的帮助和鼓励。我还要感谢的是我们课题组的于杨老师,张艳老师,在入所之初,是两位老师手把手教我各种实验技能,教我应用各种生物软件。感谢于杨老师对我课题投入的49 中国医学科学院北京协和医学院硕±学位论文、血与指导大量屯,在于杨老师的帮助下我的课题得W进行。我还要感谢己经毕业的、我的师兄胡:i:宗斩冬冬,师姐白慧君和郑晓静。感谢他们在繁忙的工作之余,给一予我实验中的指导和建议,也感谢他们对我的关也与开导。也要感谢陪我起渡过H年研究生生活的同学们:李臻、张梦、杨小洁、贾倩楠、辛赫男、李端、武闯、裴彬、乔媛媛、贾雪、李建等。有你们的陪伴,H年的研巧生生活充满了欢笑与喜!悦,H;有你们的陪伴年的研巧生生活显得弥足珍贵需要特别感谢的是我的室友张梦与李臻,感谢你们兰年生活中对我的包容与理解。也感谢不同课题组的各位师兄、师姐、师妹、师弟们,感谢你们在实验和生活中他们给我的帮助与关也。最后要特别感谢我的家人一,谢谢他们直W来对我的理解和支持。50 中国医学科学院北京协和医学院硕壬学位论文独创性声明本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。论文中除了特别加W标注和致谢的地方外,不包含其他人已经发表或撰写过的研巧成果,也不包含为获得其他教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示谢意。-:学位论文作者签名;炭签字日期j哀年6月冻靜I日学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解韭左应租屋堂隨有关保存、使用学位论文的管理办法。有权保留并向国家有关部口或机构送交论文的复印件和磁盘,允许论文被查阅和借阅。本人授权北京协和医学院可W将学位论义的全部或部分内容编入有关数据库进行检索,可W采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。(保密的学位论文在解密后适用本授权书)学位论文作者签名;如乂脊导师签名:签字日期:A年《月日签字日期:日/学位论文作者毕业后去向:齡jK.工作单位:电话:通讯地址:邮编:51 中国医学科学院北京协和医学院硕壬学位论文个人简历及发表文章姓名:张洪静性别:女873出生年月:19年月毕业学校:北京协和医学院/中国医学科学院所院:病原生物学研究所硕±研究生专业:免疫学专业教育背景及工作经历:2005年9月-2010年7月,济宁医学院,临床医学,学±一20109月-20113月年年,济宁市第人民医院,急诊外科20114-201110年月年,巧水县计划生育服务站,妇科口诊2012年9-20157月年月,北京协和医学院,免疫学,硕±发表文章还未发表。

当前文档最多预览五页,下载文档查看全文

此文档下载收益归作者所有

当前文档最多预览五页,下载文档查看全文
温馨提示:
1. 部分包含数学公式或PPT动画的文件,查看预览时可能会显示错乱或异常,文件下载后无此问题,请放心下载。
2. 本文档由用户上传,版权归属用户,天天文库负责整理代发布。如果您对本文档版权有争议请及时联系客服。
3. 下载前请仔细阅读文档内容,确认文档内容符合您的需求后进行下载,若出现内容与标题不符可向本站投诉处理。
4. 下载文档时可能由于网络波动等原因无法下载或下载错误,付费完成后未能成功下载的用户请联系客服处理。
关闭