rsap分子标记技术在园艺植物研究中的应用

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1、BIOTECHNOLOGYBULLETIN·技术与方法·2012年第1期RSAP分子标记技术在园艺植物研究中的应用任羽1王得元2黄少华1徐世松1张志群1(1中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所,儋州571737;2广东省农业科学院蔬菜研究所,广州510640)摘要:限制性位点扩增多态性(RSAP)是一种基于PCR的新型植物分子标记技术,具有操作简便、结果稳定、效率较高的特点。该技术以植物基因组上广泛分布的限制性位点位为靶标,通过独特的引物设计和PCR扩增程序,无需限制性酶切环节,只要一个简单的PCR,即可产生基于植物限制性位点的多态性标记。阐述了RS

2、AP的原理与流程,对该技术的优势和应用情况做了总结,并对其前景进行了展望。关键词:园艺植物限制性位点扩增多态性(RSAP)分子标记RSAPMolecularMarkerTechniqueandItsApplicationofHorticulturePlants12111RenYuWangDeyuanHuangShaohuaXuShisongZhangZhiqun(1TropicalCropsGeneticResourcesInstitute,ChineseAcademyofTropicalAgriculturalSciences,Danzhou57173

3、7;2VegetableInstitute,GuangdongAcademyofAgriculturalSciences,Guangzhou510640)Abstract:Restrictionsiteamplifiedpolymorphism(RSAP),anovelPCR-basedplantmarkertechnique,featureseasy,reliability,andefficientcharacteristic.Targetedtorestrictionsitesdispersedamongplantgenomes,RSAPadopte

4、duniqueprimerdesignandPCRproceduretogeneratepolymorphicmarkersatrestrictionsites,withoutrestrictedenzymedigesting.ThispaperdescribesdtheprincipleandprotocolofRSAP,analysestheadvantageandtheapplicationofRSAPmarkertechnique,anddiscussestheprospectofthistechnique.Keywords:Horticultu

5、rePlantsRestrictionsiteamplifiedpolymorphism(RSAP)MolecularmarkerDNA标记以其数量多、多态性高、可直接反映生物基因组多态性等优点,目前已被广泛应用于遗传多样性分析、连锁图谱构建、重要性状基因标记及标记辅助选择等方面,在植物遗传育种和基因组研究中发挥着越来越重要的作用。通过锚定生物基因组中不同种类的位点或序列,采用一定的检测手段,目前已发展出了多种DNA标记技术。如限制性片段长度多态性(restrictionfragmentlengthpolymorphism,RFLP)[1]、扩增片段长度

6、多态性(amplifiedfragmentlengthpolymorphism,AFLP)[2]、切割AFLP(cleavedAFLP,cAFLP)[3]等锚定的是基因组上的限制性位点,分别采用特定的方法检测这些位点上存在的多态性;简单重复序列多态性(simplesequencerepeat,SSR)锚定的则是基因组上的简单重复序列,检测其因重复次数不同产生的多态性[4];相关序列扩增多态性(sequence-relatedamplifiedpolymorphism,SRAP)[5]、目标区域扩增多态性(targetregionamplifiedpoly

7、morphism,TRAP)[6]锚定的是基因编码区,因启动子或内含子差异产生的多态性标记;反转录转座子间扩增多态性(inter-retrotransposonamplifiedpolymorphism,IRAP)则锚定反转录转座子,通过PCR扩增检测它们之间DNA片段长度多态性[7]。限制性内切酶识别位点(简称限制性位点)在生物基因组上分布广泛。基于限制性位点,科学家们首先创建了RFLP标记,该标记技术采用克隆的收稿日期:2011-07-12基金项目:国家科技支撑计划项目(2007BAD45B06),海南省自然科学基金项目(30824),中央级公益性科

8、研院所基本科研业务费专项(2011PZS067),广东省自然科学基金项目(000

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