溶菌酶作用机理研究

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1、裂解酶PlySs2裂解细菌的作用机理研究1.实验目的PlySs2是从猪链球荫{Strept()c()ccussuis}噬荫体巾分离到的一种裂解酶,对甲氧西林耐药念黄色葡萄球菌(MethicUlin-resistantstreptococcusc/w/rwA-,MRSA)>万古霉素屮介耐药金货色葡萄球苘(Vancomycin-intermediate价印/队仇.dm"5V1SA)、粘链球荫、乎斯特菌{Listeria)、模{//葡菊球菌(Streptococcussimulans)等细菌具有抑制iS•

2、性,讯性高,抗菌谱广[1'2]。研究发现,PlySs2由两个功能结构域构成,即催化结构域(Catalyticdomain,CD,PlySc)和细胞壁结介结构域(Cellwallbindingdomain,CBD,PlySb)H’21。CBD结构域负责与细胞壁上相应基质结合,CD结构域侧催化相庖的化学反疢促使细胞壁上特定物质分解,从而破坏细胞蜡结构儿裂解细胞。PlySs2的N端为半胱氨酸-纟II氨酸氨基水解酶(Cysteine-histidineamidohydrolase/peptidase,CHAP

3、)催化结构域,C端为SH35型结合结构域。CHAP结构域即具有丙氨酸酰胺酶活性,也具有肽桥内切酶活性[2]。研究发现,以有完整的PlySs2才能保持艽较高的溶歯活性,PlySs2属于结合结构域PlySb依赖型,单独的催化结构域PlySc的溶解活性很小或者基木无活性说明PlySb对底物的识別十分重耍。PlySs2能识别多种菌的细胞壁丼产生裂解活性,何是不同菌之间存在活性差异,这即体现了其广谱性,乂体现了活性差异性。相关报道表明,多数裂解酶与细菌细胞壁中肽聚糖的特定位点结合并破坏其结构,从而裂解细蘭。不同

4、菌株之间细胞娥的组成成分具宥差异,导致裂解酶存在活性差异[鬥前推测,PlySs2的结合位点在细胞壁肽聚糖上,并破坏艽结构以裂解细歯。木研究的M的是找到PlySs2与肽聚糖相互作用的结合位点,分析PlySs2裂解细菌的作用机理。2.实验思路根据实验室己有的方法诱导表达和纯化PlySs2,备川。选择PlySs2裂解活性最尚的金黄色葡萄球菌作为实验菌,在最适条件K培养并获得菌体。实验思路一:PlySs2直接与金黄色葡萄球菌相互作用。在敁适条件下孵育PlySs2和金黄色葡菊球齒的混介物,离心并收集上清液。由

5、于PlySs2与金黄色葡萄球菌细胞壁上某种物质相互结合并反应,可能存在PlySs2与底物结介在一起的复合物,离心后收集上淸液,其屮可能存在少景该复合物,再采川非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(Native-PAGE)检测分析。若与空白对照比较有特异性条带岀现,回收产物并分析其中的物质成分。方法特点:简单易行,但可能上清液中PlySs2与底物结合的S合物含虽较低,无法检测出来。实验思路二:PlySs2与金黄色葡萄球菌细胞壁相互作用。若实验思路一无法找到PlySs2的结合底物,则进一步提取金黄色葡萄球荫的细胞壁,

6、直接让PlySs2与细胞壁反应,反应方式有两种:(1)在最适条件下孵育PlySs2和细胞壁的混合物,离心后收集上清液,采用非变性聚内烯酰胺凝胶电泳(Native-PAGE)检测分析。若与空闩对照比较有特异性条带出现,1叫收产物丼分析tt:中的物质成分;(2)找到合适的万法固定PlySs2,然后固定化的PlySs2与细胞壁反应,分离岀固定化的PlySs2与细胞壁成分结合的复合物,再从PlySs2上解离出结合底物,收集底物并鉴定。方法特点:提®了PlySs2底物的浓度,减少了细胞内容物对结合反应的影响,但

7、细胞壁提取过程中有可能破坏其天然结构,可能影响PlySs2与底物的结合,固定化PlySs2也冇可能影响艽结合位点的结合活性。实验思路三:PlySs2与金黄色葡萄球菌细胞壁单一成分相互作用。1.实验方法1.1.PlySs2的诱导表达和纯化PlySs2的诱导表达和纯化参考黄燕玲的毕业论文

8、41。1.2.金黄色葡萄球菌细胞壁的提取和纯化采川超声波法提取细胞梢

9、5'61,具体操作步骤如卜*。(1)菌体收集:在Baird-Parker培养基中培养金黄色葡萄球菌。培养完毕后,迅速降温至4"C(冰浴),在4'C下3

10、000r/min离心20min,收集菌体沉淀。4°C蒸馏水反复洗涤荫体至0色,收集苘体,置于10CTC沸水中灭活20min。(2)超声波细胞破碎:条件为超声功率400W、超声时闽30min、超声温度40°C。(3)细胞壁收集:超声处理过的混合液在3000r/min卜*离心20min,去除未破碎的菌体沉淀,收集上淸液,12000r/min离心15min,收集沉淀即为细胞壁。1.3.PlySs2与细胞壁的结合实验方法一:1.实验材料1.1.菌株和质粒PlyS

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