mef2a的启动子多态性致使启动子转录活性改变

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1、hMEF2A的启动子多态性致使启动子转录活性改变#刘本荣1，熊龙根1，田朝伟2，黄璟1，钟赟1，莫沛1，李爱群1，刘世明1**51015202530（1.广州医科大学附属第二医院心血管疾病研究所；2.广州医科大学附属第二医院急诊科）摘要：目的：研究肌细胞增强因子2A（MEF2A）启动子多态对转录活性的影响。方法：采用长片段PCR扩增、Sanger法DNA测序等技术鉴定MEF2A启动子区的SNPs，采用基因克隆及双萤光素酶报告基因系统等技术评价MEF2A不同启动子单倍型的转录活性。结果：在1245bpMEF2A启动子区域发现9个SNPs（singlenucleotidepol

2、ymorphism），它们组成18种单倍型，其中频率较高的单倍型分别是H1（16.29%）、H5（17.42%）、H8（16.85%）、H16（28.65%），占总数的79.21%。对频率较高的12种单倍型进行萤光素酶双报告基因系统分析发现，H5和H8具有最高的启动子活性，H9次之，而其它几种单倍型的启动子活性较低。TFSEARCH分析发现3个SNPs导致转录因子结合位点丢失，分别是-580(C->A)、－646(G->T)和-948(C->T)。由－948（C/T）、－646（G/T）和－580（C/A）组成的单倍型有CGC（17.98%）、CGA（3.94%）、TGA（36

3、.51%）、TTC（33.15%）、TTA（3.94%）、TGC（3.37%）、CTC（1.69%），其中包含TGA的单倍型表现出最高的启动子活性。结论：MEF2A启动子区的SNPs会导致转录结合因子结合位点的改变，由不同SNPs组成的单倍型具有不同的启动子活性。关键词：肌细胞增强因子2A；启动子；SNP；转录因子结合位点中图分类号：R394.3PolymorphismsinthepromoterofMEF2AcausealterationofthetranscriptionactivityLiuBenrong1,XiongLonggen1,TianChaowei2,Huang

4、Jing1,ZhongYun1,MoPei1,LiAiqun1,LiuShiming1(1.TheInstituteofCardiovascularDisease,theSecondAffiliatedHospitalofGuangzhouMedicalUniversity;2.EmergencyDepartmentoftheSecondAffiliatedHospitalofGuangzhouMedicalUniversity)Abstract:objective:Toexploretheinfluenceofthepolymorphismsinthepromoterofm

5、yocyteenhancerfactor2A(MEF2A)onthetranscriptionactivity.Methods:LongfragmentPCRamplificationandDNAsequencingwithSanger’smethodwasusedtoidentifythesinglenucleotidepolymorphisms(SNPs)inthepromoterofMEF2A.Genecloneanddualluciferasereportersystemwasusedtoassess354045thetranscriptionactivityofth

6、edifferentMEF2Apromoterhaplotypes.Results:NineSNPswerefoundinthepromoterofMEF2Ainaregionof1245bp,andtheycombinedinto18haplotypes.Amongthesehaplotypes,themorepopularhaplotypesareH1（16.29%）、H5（17.42%）、H8（16.85%）andH16（28.65%）,whichtakes79.21%ofthetotal.Dualluciferasereportersystemanalysisforth

7、e12popularhaplotypesshowedthatthetranscriptionalactivityofH5andH8ismorestrongly,andthatoftheotherhaplotypesisweak,andthetranscriptionalactivityofH9ismoderate.AnalyzingwithTFSEARCHshowedthatthreeSNPs,-580(C->A),－646(G->T)and-948(C->T),causedalossofp