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《基于scot和ssr标记的药用菊花种质资源遗传多样性研究》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。
1、杭州师范大学硕士学位论文摘要0.565~0.882之间。（2）SSR标记分析：成功应用了55对理想引物，共扩增出1319条带，大多数条带大小集中在100~500bp，其中多态性条带有1306条（占98.90%）。不同引物的多态性百分比在92.0%~100%之间。多态性信息含量变化范围为0.938~0.993（0.973，PIC>0.5）；各材料的遗传相似系数范围为0.533~0.809。（3）基于两种标记数据合并后的UPGMA聚类结果显示，药用菊花种质间的遗传相似系数为0.553~0.831，另外通过U
2、PGMA聚类和主坐标分析发现，SCoT和SSR及整合标记（SCoT+SSR）均将32份药用菊花种质聚为两大类，I类包括22份种质，II类包括10份。4、SCoT、SSR及SSR+SCoT标记之间的相关性分析：应用Mantel测验对SCoT、SSR及综合标记进行相关性分析，结果发现，SCoT和SSR标记相关性显著（r=0.48，P=1.00），但综合标记（SSR+SCoT）与SSR和SCoT标记的相关系数更高，分别为0.93和0.78。结果表明，SCoT和SSR技术均可以有效地应用于药用菊花种质资源遗传多
3、样性研究，但综合两种标记能更有效地检测基因组变异、更全面地反映药用菊花遗传多样性。关键词：药用菊花；遗传多样性；SCoT；SSR；聚类分析；主坐标分析；III万方数据杭州师范大学硕士学位论文AbstractAbstractChrysanthemum,Chrysanthemummorifolium(Ramat.)Kitam,isaperennialherbplantoftheAsteraceaefamily,widelyusedinornamentalhorticultureandtraditionalm
4、edicine.MedicinalC.morifoliumhavenumerouscultivars,extremelycomplexgeneticbackground,however,itlackofbreakthroughingermplasmInnovationcurrently.Therefore,inordertomakefulluseofgermplasmsresourcesamongmedicinalC.morifoliumandbreeding.Itisveryurgentandnece
5、ssarytoinvestigategeneticdiversityandrelationshipsinmedicinalC.morifolium.Inthisstudy,weusedthefreeESTdatabasetodevelopprimerwithStability,goodcommonalityandhighpolymorphismfortheSSRmarkers.Afterthat,SCoTandSSRmolecularmarkertechniquewereconductedonitsge
6、neticdiversityandgeneticrelationshipwithinatotalof32populations,including32C.morifoliumsamples.TheobjectivesofthepresentstudyweretoofferreliableprotectionreferenceandtoassessthegeneticrelationshipsanddiversityamongChinesemedicalC.morifoliumvarieties.Toou
7、rknowledge,theresultswillprovidemuchmoreusefulinformationforresourceprotectionandwillalsousefultoimprovethecurrentplantbreedingprograms.Themaincontentsandresultsofthisexperimentareasfollows:1.TheoptimizedSCoTandSSRReactionSystem:(1).TheoptimumSCoT-PCRrea
8、ctionsystem(20μL)wasestablished,including10ngtemplateDNA,1.5UTaqDNApolymerase,0.8μmol/Lprimer,2.0mmol/L,Mg2+,0.2mmol/LdNTPs.TheamplificationwasperformedwithaPCRprogram:94ºCfor4min,followedby35cyclesof94ºCfor1min,50ºC(Prime
