西施舌和琴文蛤线粒体基因组研究

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1、中国海洋大学硕士学位论文西施舌和琴文蛤线粒体基因组研究姓名：刘鑫蓬申请学位级别：硕士专业：水产养殖指导教师：李琪20120601西施舌和琴文蛤线粒体基因组研究摘要西施舌(CDP肠埘臼c护口臼"z幻“臼f臼)隶属于软体动物门(胁，，“sca)双壳纲(Bfv口fv蛔)异齿亚纲(觑·，e厂D如，?砌)帘蛤目(阮门P阳f砌)蛤蜊科(^彻c，ri如P)，是我国重要的经济贝类。本研究首次测定了西施舌线粒体全基因组，西施舌线粒体基因组全序列长度为17190bp，基因组(A+T)碱基比例为64．7％。整个线粒体基因组编码34个基因，包括12个蛋白质编码基因、2个rRNA基因和20个tRNA基因，西施舌线

2、粒体基因组也缺少了两个tRNA：缓M＆7翻GM和f尉州&7r㈣，也缺失了基因臼矽8。西施舌线粒体基因组的所有的基因都编码在同一条链上。在西施舌线粒体基因组最长的非编码区中，发现了8．9个拷贝的99bp的串联重复序列。另外，西施舌的线粒体基因排列也与其它物种存在很大差别，是一种新的基因排列顺序。琴文蛤隶属于软体动物门(物，，淞c口)双壳纲(BfⅧfv砌)异齿亚纲(肌fP加如，2细)帘蛤目(沈玎P厂Df幽)帘蛤科(阮门8加f砌e)文蛤属(胁陀护坟)。本研究测定了琴文蛤线粒体基因组序列7505bp，在获得的序列中包含了c甜3和cy场基因的部分序列；5个完整基因的序列：c似J『、，2口棚、”口以

3、、行a洲工、c佩2；5个tRNA基因：坻W么爿k、缬W么上8”心冽、壕W么胁、确!Ⅳ，4爿甲、外ⅢZPrD以及10个非编码区域。将琴文蛤已测定的5个完整蛋白质编码基因与文蛤属四个物种(文蛤Mme坨驴讶，丽文蛤必，淞D，．砌，斧文蛤M肠聊们七ff，短文蛤MpPfP砌j口凰)比较，发现5个基因的起始密码子以及终止密码子存在一定差别。本研究基于c似J、cD妇、门口们、，?日出、胛口出三五个基因基础上，构建了文蛤属5个物种的NJ系统发生树。本研究结果支持文蛤属为单系发生，文蛤Mme阳驴及与短文蛤MpP把如f以凰具有很近的亲缘关系，但是两个物种是否为同一物种，需要今后结合其形态上的数据才能得出更确

4、定的结论。关键词：西施舌琴文蛤线粒体基因组西施舌和琴文蛤线粒体基因组研究StudiesonmitochondrialgenomesofCDP，D，船臼cfr口臼朋，幻扰以faandMeretrixlyrCllQAbstractThemitogenomeCDP7D，”臼c，r臼口，2rfg“臼fPisdete舯inedinthisstudy．C口胛ffg甜口febelongstophylum胁，，“sc臼，classBfV口，Vi臼，subclass肌，e加c幻胛f口，order玩，2P，·Df(扬，胁ilyj、彻c，rf(加P．ThewholelengthofmitogenomeC口玎f

5、ig“口reis17190bpwithATcontent64．7％．ThemitogenomeC口玎r由甜口陀missingfRⅣ彳＆7翻GM，f甩V4＆7冈cMand口矽艿genecontains12protein—codingregion，2rI斟Aand20tRNA．Allgenesarecodingonthesamestralld．Inthemajornon—codingregionofmitogenomeC臼，zf国“口把，thereisatalldemrepeatsequencew11ichis99bpwith8．9copies．Inaddition，thearrangeme

6、ntofmitogenomeC．a”rfg”臼fPisaneworderdi仃erentfromothergeneorderspublished．^钯陀驴政纱口砌belongstophylum^勿Z，zfsc吼classBf砌知砌，subclaSs日毒fP阳如刀幻，order沱刀PrDi幽，f-锄ily昆，zerDid沈，genus朋叠陀伊髓．Incompletemitogenomeof且Z缈口砌with7505bpin1en薛hwasdetemliIled．T11isincompletesequencecontainsp川ialc似3aJld哕仿genes，5tRNAgenes：mM肋

7、，坎M砌rc㈣，mM胁，删W卸，蹴MmaJldtennon—codinggenes．Thestanandst叩codonof5protein—codinggenesofmitogenomeM纱口砌arenotalltllesameWhencompared、妨thother4speciesbelongingtogenusA钯旭护投．BaSedont11egenescDxJ，c甜2，，2口们，玎以以，门日出三，theNJphylogen