向海地区野鸟源禽副黏病毒分离鉴定及遗传进化分析

《向海地区野鸟源禽副黏病毒分离鉴定及遗传进化分析》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、万方数据学校代码：10225学号：S14614学位论文向海地区野乌源禽副黏病毒分离鉴定及遗传进化分析指导教师姓名：申请学位级别：论文提交日期：授予学位单位：李凤勇华育平教授硕士2014年4月东北林业大学学科专业：生理学论文答辩日期：2014年6月授予学位日期：2014年6月答辩委员会主席：论文评阅人：聋方厶杉素大学万方数据UniversityCode：10225RegisterCode：S146141㈣剃V．’777q1MDissertationfortheDegreeofMasterIdenti

2、ficationandphylogeneticanalysis。‘Avian1。’、‘"；olatedfromwildbirdsolAvianIt"aramyxovlrusisolatefrolras。the’“XiangHaintlleregion01XiangHai‘Candidate：Supervisor：AssociateSupervisor：AcademicDegreeAppliedfor：Speciality：Dateof0ralExamination：University：LIFen

3、gyongProf．HuaYupingMasterPhysiologyJune，2014NortheastForestry万方数据摘要禽副黏病毒(Avianparamyxovims，APMV)在分类上属于副黏病毒科(Paramyxoviridae)，副黏病毒亚科(Paramyxivirinae)，禽副黏病毒属(Avulavirus)，整个基因组长度约为15．16kb，基因结构为：3'-NP．P⋯MFHN．L．5’，依次编码核衣壳蛋白、磷蛋白、基质蛋白、融合蛋白、血凝素．神经氨酸酶蛋白。APMV根据

4、血凝抑制试验(HI)和神经氨酸酶抑制试验(NI)可以分为9个血清型。新城疫病毒(NewcastleDiseasevirus，NDV)是APMV-1的唯一成员，新城疫(NewcastleDisease，ND)给很多国家的家禽业带来了巨大的经济损失。野生鸟类中经常会分离到低致病性的NDV，但是对其分类、基因亚型和对家禽的潜在致病性却知之甚少，另外野生鸟类中还存在其他类型APMV。因此加强对野鸟APMV监测是十分必要的。1．2012年春天向海地区野鸟源NDV分离鉴定。2012年春天从向海地区采集到139

5、份健康野鸭咽拭子和泄殖腔拭子，分离到22株NDV,分离率15．8％，分别来自琵嘴鸭、鹊鸭、赤膀鸭和斑嘴鸭。对其F基因克隆、序列测定分析，结果表明，所有NDV分离株F基因ORF长度为1662bp，编码553个氨基酸，同源性98％．100％，遗传进化关系表明22株NDV分离株均属于ClassI基因4型。F蛋白裂解位点处的氨基酸序列112ERQE／GRLll7，具有典型弱毒特征，同我国江苏鸭源，美国鹅源及美国野生水禽源NDV毒株处于同一分支上。2．一株ClassIShoveler／JL／374／2012

6、毒株全基因测序。参考GenBank中发表的相关全基因组参考序列，设计了14对特异性引物，采用RT-PCR方法对分离株Shoveler／JL／374／2012全基因组进行扩增。克隆和序列测定，结果表明该分离株全基因组长度为15198bp，与GenBank上所公布的标准ClassI毒株，DE．R49／99，JSl0，9a3b等毒株的全基因组长度相同；比Losta，B1，Herts33等NDV毒株多12个碱基(TGGGAGACGGGG)，位于P基因的编码区内。3．禽副黏病毒6型的分离鉴定及F和HN基因的

7、序列分析。2011年秋天从吉林省向海自然保护区采集的300份野鸭咽喉拭子和泄殖腔拭子中分离到18株APMV-6，通过RT-PCR方法，扩增了5株来源于不同宿主的APMV-6的F和HN基因。结果表明5株病毒的F基因长度均为1836bp，HN基因为203lbp；5株病毒F和HN基因同源性分别超过99％，且与TW分离株的同源性最高为98％；遗传进化分析表明5株病毒均属于Classl分支。关键词野生鸟类；禽副黏病毒；新城疫病毒和APMV-6；分离鉴定；遗传进化分析万方数据AbstractAbstractA

8、vianparamyxovirus(APMV)belongstothegenusAvulavirusinthefamilyofParamyxoviridae．TheAPMVshavebeendividedintoninedifferentserotypesbasedonhemagglutinationinhibition(HI)andneuraminadaseinhibition(NI)assays．APMVhasapproximatelya15kbRNAgenomeencodin