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1、生物多样性!"##"，!"（$）：$%&’$$$!!!!!!!!"#$"%&’(")+,"&-,&群体遗传学研究中的数据处理方法!#$%&’数据的%()%分析"张富民!葛!颂（中国科学院植物研究所系统与进化植物学重点实验室，!北京!(###)%）摘要：近年来，+,-数据和+./0+分析广泛地应用于群体遗传学和保护遗传学研究。然而，由于+,-标记具显性特点，加上目前进行+./0+分析所依赖的+,-1234567软件不完善，使得对+,-数据进行+./0+分析时存在许多不足。本文介绍了+./0+分析的基本过程，同时引入一个新的程序-89+用以
2、替代+,-1234567，并详述了将-89+与:;<+./0+联用，对+,-数据进行+./0+分析的具体步骤与注意事项。最后，以产自中国和巴西&个普通野生稻（!"#$%"&’()+,）天然群体为例，演示了对+,-表型数据进行+./0+分析的过程，讨论了+./0+分析结果在群体遗传结构上的意义。通过对+./0+算法的分析，同时比较$种距离系数所得+./0+结果，我们认为在进行+./0+分析时选择<=;>?;距离和欧氏距离平方较为合适，而目前国内使用较多的@+88+-系数不适合+./0+分析。关键词：群体遗传结构，+,-1234567，-8
3、9+，进化距离中图分类号：A%$B!!!文献标识码：+!!!文章编号：(##CD##)$（"##"）#$D#$%&D#B’+,++-+./0101-2324.+,13-56-6,170#8#+-+./01039$%&’:+,+;1,<%()=%"EF+.15，G=IJ5K-%."%/"#’0#1/23%/(4%,5678&/(,%"#9/%,#，:,1/(/&/2’9/%,#，;<(,212=4%523#’04(2,421，92(>(,+(###)%%>0,?+7,：45LJM+MNO1P17L,JOQMJRNS16-<+（+
4、,-）L434S4T7U775156R74215KOQH27L1523HL172J5NJNHO431J545L6J527RT431J5K7573162V+54OQ212JPMJO76HO4RT4R14567（+./0+）S42U76JM7J57JP3S71MNJR3453M73SJL2H31O1W7L15454OQ212JPNJNHO431J5K75731623RH63HR7V8HRR753OQ，:;<+./0+123S7MJ23NJNHO4R2JP3X4R73S4312H27LPJR+./0+454OQ212，45LJP375RH52
5、3JK73S7RX13S+,-1234567，42JP3X4R73J64O6HO437K757316L12345672VFJX7T7R，64H31J522SJHOLU734Y75XS75+./0+454OQ21212H27L3JNRJ67223S7+,-L434U764H27JP3S7LJM154536S4R4637R12316JP+,-M4RY7R45L3S7O1M13431J5JP+,>-1234567V;53S12N4N7R，X7UR17POQ153RJLH673S7NR1561NO745L4OKJR13SMJP+./0+454O
6、Q21245LL7>26R1U7457XNRJKR4M，-89+，3S432HU2313H372PJR+,-1234567V:74O2J1OOH23R4373S7NRJ672272JPRH5>515K3S7NRJKR4M2-89+45L:;<+./0+V;54LL131J5，X7454OQW771KS3!"#$%"&’()+,NJNHO431J5242457Z4MNO73JL7MJ523R437SJX3JNRJ6722+,-L434X13S+./0+，45LL126H223S7R72HO3215O1KS3JPNJNHO431J5K757
7、31623RH63HR7V9154OOQ，U427LJ53S76JMN4R12J5JPPJHR6JMMJ5OQH27LL12345676J7PP1>617532，X72HKK7233S433S76J7PP1617532JP=H6O1L7452[H4R7LL123456745L<=;>?;R43S7R3S45@+88+-4R72H134UO7PJR454OQ212JPMJO76HO4RT4R14567V@6/;3?:0：NJNHO431J5K75731623RH63HR7，+,-1234567，-89+，7TJOH31J54RQL1234
8、567!基金项目：国家重点基础研究发展规划“)B%”项目（G"####$&#C）和国家杰出青年科学基金（%##"C##C）收稿日期："##"D#CD"#；接受日期："##"D#)D")作者简介：张富民，男
