猪耳型性状全基因组关联分析及重要候选基因msrb3的克隆分析

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1、密级：论文编号：中国农业科学院学位论文猪耳型性状全基因组关联分析及重要候选基因的克隆分析Genome-wideAssociationStudyforPorcineEarMorphologyandResearchoftheImportantCandidateMSRB3硕士研宄生：张跃博指导教师：王立贤研宄员申请学位类别：农学硕士专业：动物遗传育种与繁殖研究方向：猪分子数量遗传学培养单位：北京畜牧兽医研宄所研究生院2015年6月独创性声明本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研宄工作及取得的研宄成果。尽我所知，除了文中特别加以标注和致谢

2、的地方外，论文中不包含其他人己经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得中国农业科学院或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研宄所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。研究生签名:來狄褚时间:y/i年/月3曰关于论文使用授权的声明本人完全了解中国农业科学院有关保留、使用学位论文的规定，即：中国农业科学院有权保留送交论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同意中国农业科学院可以用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容。研宄生签名:时间

3、:年/月i曰导师签名:时间：>〇〇_年^月^曰中国农业科学院硕士学位论文评阅人、答辩委员会签名表论文题目猪耳型性状全基因组关联分析及重要候选基因从_3的克隆分析动物遗传育论文作者张跃博专业研究方向猪分子数量遗传学种与繁殖指导教师王立贤培养单位(研宄所、中心）北京畜牧兽医研究所姓名职称单位专业签名中国农业大学动物王楚端教授动物遗传育种评科技学院北京畜牧兽医阅杜立新教授动物遗传育种研究所人答辩主席中国农业大学动物张勤教授动物遗传育种科技学院3答辩委员

4、中国农业大学动物孙东晓教授动物遗传育种科技学院中国农业大学动物王楚端教授动物遗传育种科技学院中

5、国农业大学动物张胜利教授动物遗传育种科技学院北京畜牧兽医杜立新教授动物遗传育种研宄所中国农业科学院北李俊雅研究员动物遗传育京畜牧兽医研宄所中国农业科学院北赵桂苹研究员动物遗传育种京畜牧兽医研宄所会议记录乂秘书）论文答辩时间地点2015年5月27日上午8:30,北京畜牧兽医研宄所科研楼会议室Secrecy:No.ChineseAcademyofAgriculturalSciencesDissertationGenome-wideAssociationStudyforPorcineEarMorphologyandResearchoftheIm

6、portantCandidateMSRB3M.S.Candidate：ZhangYueboSupervisor：WangLixianMajor：Animalgenetics,breedingandreproductionSpecialty:PigmolecularandquantitativegeneticJune2015本研究由中国农业科学院科技创新工程(ASTIP-IAS02)；国家科技支撑计划(No.2011BAD28B01)；现代农业产业技术体系；中国农业科学院基本科研业务专项(No.2014ZL006)项目资助Thisresea

7、rchworkwassupportedby:AgriculturalScienceandTechnologyInnovationProgram(ASTIP-IAS02);NationalKeyTechnologyR&DProgramofChina(No.2011BAD28B01);EarmarkedfundforModernAgro-industryTechnologyResearchSystem;ChineseAcademyofAgriculturalSciencesFoundation(No.2014ZL006)摘要耳型是猪的重要品

8、种特征之一，在品种鉴定中发挥重要作用。但是，目前对耳型基因定位研究较少，还未揭示其主效基因及因果突变位点。本研究利用Illumina的猪SNP60芯片，在大白猪×民猪F2资源群体中对耳型性状进行全基因组关联分析，对定位到的显著关联区间进行精细定位，并对重要候选基因MSRB3进行cDNA全序列克隆及分析。主要研究内容如下：采用基于混合模型及回归的快速全基因组关联分析及基因组控制的方法，对F2资源群体的耳型性状进行全基因组关联分析，共检测到23个全基因组水平显著的SNPs（P<1.0509×10-6），将影响耳型性状的QTL定位到SSC5上位于

9、30.31Mb和36.11Mb之间的长为5.80Mb的区域内，其中，最显著关联的SNP位点ASGA0025237位于WIF1内（P=2.39×10-7）。为了进一步缩小QTL区间