花生种质资源重要农艺品质性状的全基因组关联分析硕士论

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1、学校代码学号或申请号密级10459z20106202郑州大孚专业硕士学位论文题目：花生种质资源重要农艺和品质性状的全基因组关联分析作者姓名：导师姓名：学科门类：专业名称：培养院系：完成时间：严玫田保明教授张新友研究员遗传学与分子生物学生物工程生物工程系2012年5月。1==urAthesissubmittedtoZhengzhouUniversityforthedegreeofMasterGenome-wideAssociationanalysisofMainAgronomicandQualitytraitsinaworldwidecollectio

2、nofpeanut(Arachishypogaea)germplasmByMeiYanSupervisor：Prof．BaomingTianProf．XinyouZhangGeneticsandMoleculerbiologyBiologicalEngineeringBiologicalEngineeringDepartmentMay20122㈣5Ⅲ6Ⅲj1Ⅲ2㈣0iiii●■●洲2舢Y原创性声明本人郑重声明：所呈交的学位论文，是本人在导师的指导下，独立进行研究所取得的成果。除文中已经注明引用的内容外，本论文不包含任何其他个人或集体己经发表或撰写过的

3、科研成果。对本文的研究作出重要贡献的个人和集体，均已在文中以明确方式标明。本声明的法律责任由本人承担。学位论文作者：日期：年月日学位论文使用授权声明本人在导师指导下完成的论文及相关的职务作品，知识产权归属郑州大学。根据郑州大学有关保留、使用学位论文的规定，同意学校保留或向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被查阅和借阅；本人授权郑州大学可以将本学位论文的全部或部分编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或者其他复制手段保存论文和汇编本学位论文。本人离校后发表、使用学位论文或与该学位论文直接相关的学术论文或成果时，第一署名单位仍然为郑

4、州大学。保密论文在解密后应遵守此规定。学位论文作者：2日期：年月摘要花生(ArachishypogaeaL．)是世界上五大重要的油料作物之一。我国是世界花生生产大国，产量、消费量和出口量均居世界首位。在我国油料作物中，花生产量约占油料作物总产的48％，而且发展潜力巨大。因此，开展花生基因组研究对振兴我国花生乃至油料作物产业，缓解食用植物油供需矛盾，具有重要的战略意义。本研究选用166份花生种质，包括国内不同年代的花生育成品种136个和外国种质30份，具有广泛的代表性和丰富的遗传多样性。采用传统的统计学方法对多个农艺性状的表型数据进行分析，初步揭示不同

5、性状的遗传特性。同时以多个已构建的花生遗传连锁图谱及复合图谱中的连锁群为花生拟染色体，在以往试验结果的基础上，选用64对遗传多样性丰富的SSR位点，对整个花生基因组进行扫描，通过标记的基因型数据，利用STRUCTURE2．3．1软件对群体进行结构划分。最终选用19项农艺性状的表型数据和种质的基因型数据，以结构划分依据Q因子作协变量对166份进行简单线性回归GLM模型分析。目的是通过表型．基因型全基因组关联分析，进一步揭示新的遗传现象，验证已有的遗传规律，同时发掘优异的基因位点。主要研究结果如下：l、通过性状频数分布图、聚类分析、结构划分的分析，可将1

6、66份种质划分为7大亚类。①从主茎高、侧枝长、结果枝、单株饱果数、百仁重、粗蛋白质含量、脂肪酸含量、油酸(C18：1)含量、亚油酸(C18：2)含量、油酸／亚油酸比值(a儿)对应的频数分布图，可发现各性状值主要集中分布在7个区段；②根据17个性状的综合聚类分析结果，也将种质划分为7个亚群；③依据Hardy-Weinberg平衡理论，经过LD检测，基于Bayesian模型和遗传聚类分析的结果，对166份种质进行结构划分，最终划分为7个亚群，其中2个亚群主要为外国核心种质(平均90％以上)，这与表型聚类分析划分结果相似。2、对2011年度获取的19个性状

7、的表型数据与种质群体的基因型数据进行关联分析。结果显示，在所用“对引物中有55对与性状呈显著关联，等位变异位点有536个。其中，与植物学性状关联的位点有30个，与产量性状关联的位点的有46个，与品质性状关联的分别有23个(2010结果)和29个(2011年结果)，与抗病性关联的有11个。从2010年和2011年品质性状关联数据中发掘出12个呈显著关联且稳定遗传的SSR位点。摘要3、对花生种质的相关数值进行简单统计分析与关联分析，揭示并验证遗传规律。①采用描述统计、相关性分析对性状遗传多样性分布特点及不同性状间关系的分析表明，同类型性状的数值频数分布极

8、为相似，不同类型性状间相关性要低于同类型内不同性状间的相关性。在相关分析表中，产量性状(8个)和品质性状(5