杉木nac基因的克隆、表达和snp分析

杉木nac基因的克隆、表达和snp分析

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时间:2019-03-20

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1、應纖密级不保密UDC630硕±学位论文杉木iVAC基因的克隆、表达和SNP分析作者姓名;刘琼瑶捲导教师:黄华宏教授学科专业名称:林木遗传育种研究方向;林业化物技术所在学院:林业与生物技术学院S论嫌交日期;20"年6月浙江农林大学.2015年6月J_I独创性声明本人帝明,所呈交的学位论文,是在指导教师指导下,通过我的努力取得的成果,并且是自己撰写的。尽我所知,除了文中作了标注和致谢中已经作了答谢的地方外,论文中不包含其他人发表或採写过的研巧成果,也不包

2、含在浙江农林大学或其他教育机构获得学位或证书而使用过的一同对本研巧做出贡献的同志,都在论文中作了明确的说明并表示了谢意材料。与我。如被査有严重侵犯他人知识产权的行为,由本人承担应有的责任。学位论文作者亲笔签名:砸游日期;如诚(則日论文使用授权的说明本人完全了解浙江农林大学有关保留、使用学位论文的规定,即学校有权送交论文的复印件,允许论文被査阅和借阅(,可1;学校可^公布论文的全部或部分内容1^采用影印、缩印或其他复制手段保存论文。保密,在年后解密可适用本授权书。□__不保密,本学位论文属于不保密。面

3、""(请在方框内打V)一‘為乂>鮮学位论文作者亲笔签名:龄瑪日期:占弓?司《指导教师亲筆签名:苗容H期:些[J9車l:凶巧ZhejiangA&FUniversityDissertationfortheDegreeofMasterIsolation,ExpressionandSingleNucleotidePolymorphismsAnalysisOfNACgenesinChinesefir(Cunninghamialanceolata)Candidate:LIUQiong-yaoAdviser:HUANGHua-hong,pr

4、ofessorSpeciality:GeneticsandBreedingofForestTreesDateofSubmission:June,2015ZhejiangA&FuniversityLin’an,zhejiangprovince,P.R.ChinaJune,2015摘要杉木(Cunninghamialanceolata(Lamb.)Hook)是我国南方一种重要的速生材用树种,用途广泛。材质改良是杉木育种的重要内容之一,缩短选择周期,加快遗传改良进程是需要解决的主要难题,而该问题的解决有赖于对其木材材质性状遗传基础的了解和掌握。近年

5、来,许多NAC基因被证明与植物次生细胞壁合成有关。本论文主要开展杉木NAC基因的克隆、表达特异性、遗传转化,以及单核苷酸多态性研究,主要结果如下:利用转录组测序获得的相关数据,克隆了8个具有完整开放阅读框的杉木NAC基因的cDNA序列,分别命名为ClNAC1~ClNAC8,序列长度在1060~1597bp之间。推测出它们所编码的蛋白序列由285~377个氨基酸残基构成,在N端都含有一个128~143个氨基酸残基组成的NAC结构域。系统进化树结果分析表明,ClNAC1、ClNAC6与拟南芥中的SND2/3具有较高同源性,ClNAC8与拟南芥NS

6、Ts和杨树中的PtrWNDs等具有较高同源性。其它5个ClNACs与拟南芥的ATAF1/2、NAC055、NAC072等基因聚在一个分支。利用荧光定量PCR研究8个ClNACs在杉木10个不同器官和组织中的表达特性,发现ClNAC1和ClNAC6在不同组织和器官的表达规律相似,在木质化茎中相对表达量较高,而且主要在木质化茎的木质部中优势表达;ClNAC2和ClNAC3在根中的表达量显著高于其他器官和组织;ClNAC4、ClNAC7均是在雄球花中的表达量最高,其次是根中的表达量,在其他器官和组织中则较低;ClNAC5在一年生叶片中表达量最高,在

7、茎中的表达量最低;ClNAC8在雄球花和雌球花中的表达量最高,在木质化茎中的表达量是非木质化茎中表达量的2倍,在三年生枝条木质部中的表达量是皮中表达量的7倍左右。结合ClNACs基因生物信息学分析推测,ClNAC1、ClNAC6和ClNAC8与次生细胞壁合成有关。选择ClNAC8构建了超表达载体对烟草进行异源转化,获得T0代转基因烟草阳性植株6株,通过表型观测发现转基因烟草叶片相对于对照组烟草较小,叶片质感稍厚实,叶缘褶皱多,推测ClNAC8的超表达对烟草的生长造成了一定影响。通过MEGA4和DnaSP5.0对来自6个群体的40个基因型个体的

8、ClNAC8基因序列进行SNP的检测,共挖掘到187个SNPs,SNP频率为1/13bp,多样性水平达到I0.01368。外显子中存在29个错义突变,38个同义突变

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