赤麂线粒体全基因组测序与比较进化分析

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1、英文摘要COWandsheep)，thephylogenetictreewasconstructedbasedontheirconcatenatedscqtlonccsof3protein-codinggenes．Theresultsshow：@thosespeciesaredividedinto3cladeswhichareamuntjak—sheep—COWclade，apig—alpacacladeandahippopotamus—whaleclade；Qthedivergencebetweenthemuntjaka

2、ndsheeplineagesoccurredat14．7millionyearsagoandthedivergencebetweenthemuntjakandCOWlineagesoccurredat16．0millionyearsago；@thereisacloserrelationshipbetweenmuntjakandsheepthanthatbetweenmuntjakandCOW．[Keywordslmuntjak，Mitochondrialgenome，Phylogeneticrelationshipres

3、earch主旦查至生墅蒌——符号、变量、缩略词等本论文专用术语的注释表缩写词ATPbpCOXCRCvtBD·loopkbMDⅪMEMPmtDNAMYBPND加AHNJPCRRFLPrRNATmtRNAUPGMA英文蛆PsynthaseFOsubunitbasepairsCytochromeoxidasesubunitControlregeionCytochromebDisplacementLoopkilobasepairsMultidrugresistantMinimumEvolutionMaximumParsimonym

4、ethodMitochondrialDNAmillionyearsbeforepresentNADHdehydrogenasesubunitNeighbor-joiningmethodPolymeraseChainReactionRestrictionFragmentLengthPolymorphismRibosomalRNAmeltingtemperatureTransferRNAgeneUnwei【ghtedPairGroupMethodwithArithmaticMearlVlI中文ATP合成酶亚基碱基对细胞色素氧化

5、酶业璀控制区／D—loop区细胞色素B编码基因D—loop区／控制区千碱基对多药耐药基因最小进化法最大简约性法线粒体DNA百万年自Ⅱ脱氢酶亚基邻位相连法聚合酶链反应限制性内切酶图谱核糖体RNA基因解链温度转运RNA基因非加权成刈中均数法倘i十义虬刘t上前言日!J舌线粒体基因组(Mitochondrialgenome)是共价闭合的双链DNA，大小在16．5kb左手^每个细胞有1000～10000个拷贝，线粒体基因组结构简单稳定，很少受到序列甄排的影⋯，并呈母系遗传，由于这些特点线粒体基因组成为研究分子进化的重要手段flll2

6、1。同时随着分j7牛物学和生物信息学的发展，大片断序列的测序和序列分析已比较容易实现，因而利用线粒体序列研究进化关系的方法得到越来越多研究者的青睐。赤麂(Muntiacusmuntja_j})是鹿科(Cervidae)麂亚科(Muntiacinae)动物，主要分布在尼泊尔、锡金、印度东北部、缅甸西部和我国云南地区及华南、东南和西南部分地区【3】，是体型最大的一种麂，同时也是目前已知的哺乳动物中染色体最少的动物，其核型为2n=6早，7d【4】。国内自70年代以来有众多实验室用赤麂细胞株研究细胞周期、染色体进化及遗传毒理，是公

7、认的一种模式动物‘31’而赤麂的起源和进化关系一直是令人迷惑而又是个很有意义的研究课题15]【6I。前人已经从考古学‘w、分支分类学‘81、细胞遗传学【q1、mtDNA多念性‘101等多力’⋯做过川究，但难以得到一致的结论。也有些学者利用线粒体部分序列(如Ctyb、12SrRNA等)对麂属动物做过进化研究⋯】，但由于信息量太少，所以得出的结论也有限‘12】，如要得出更准确的结论还需要更多的线粒体序列信息。基于此我们测定了小麂的线粒体全基因组之后又测定了赤麂的线粒体全基因组并进行了基因定位和序列分析，并利用GenBm3k得到

8、一些物种的线粒体序列。我们讨论了赤麂在麂亚科、鹿科、鲸偶蹄类中进化地位以及其他相关物种的进化关系，以期为麂亚科动物资源保护提供基础资料，为鹿科动物及鲸偶蹄类动物遗传多样性提供科学依据。东南入学硕士学位论文赤麂进化地位研究进展文献综述关键词：赤麂，线粒体基因组，进化分析摘要：麂亚科动物赤麂由于_是目前已知