Western Blot显色篇

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时间:2019-08-03

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1、WesternBlot显色篇WB蛋白印迹在生物化学这一块是常规实验,就像有人说炒菜中境界最高也最难的是蛋炒饭一样,实验中常规实验也是很考验技能的,除了潜心研究原理、认真揣摩技巧以外,对于新实验试剂的信息把握,勇于尝试新方法也是非常之重要的——各大厂家都在不断开发更方便更灵敏的新产品,“idea是生产力”嘛,因此生物通这里介绍一些能把我们从日常操作中解脱出来,获得“升级版”效果WB产品。   讲完了WesternBlotting的电泳转移仪器,蛋白分子量标准和转移膜之后,我们最后来探讨一下WB的检测系统。一般的WB检测过程中,

2、都会有封闭、一抗、二抗和底物显色这四道工序要“加工”。我个人觉得底物显色这最后一步是最关键的,也是最有文章可以作的一个部分。你看,光标记方式就有生物素标记,地高辛标记,各种酶标记等等,酶标的底物又有各种生色底物、化学发光法底物和荧光底物可供选择;就连识别一抗的配体也不一定非要二抗不可,也可以是抗生物素蛋白,链亲和素或者ProteinA或G等,更别说各种试剂盒琳琅满目,叫人好像无从下手!不过不急,生物通帮你作个参考,让你对各种产品的优点缺点一览无遗,真正成为一个WB高手。另外如果实验室有已经建立的固定的显色方法,那也没关系,有

3、时候不经意浏览到的方法可能就会对你的实验有莫大的帮助——这也就达到我们的目的了。与蛋白质组学一线专家面对面,赶快报名参加第二期蛋白质组学技术与应用高级培训班!   封闭和一抗的选择没有太多的选择余地——封闭前面介绍过了;一抗?现在的抗体产品说明书一般都有注明应用范围的,说明可以用于WB的就OK。如果没有这些信息可以遵从以下原则:单抗专一性高,但是经过SDS-PAGE变性胶电泳的蛋白质可能由于原来的识别位点构象发生改变而不被识别,多抗不如单抗专一性高但更容易得到结果。如果还有多种抗体选择,那当然是来源于兔或者小鼠抗体为好,因为

4、后继的检测试剂盒一般都是针对兔鼠的居多,因而选择范围更大通用性也更强。除了无标记的一抗,还有生物素等各种标记一抗。还听说有用荧光标记的一抗直接检测而降低背景和非特异结合,不过由于少了二抗的级联放大信号扩增,信号也会比较弱,所以需要选择荧光信号特别明亮的标记(Invitrogen收购了著名的MolecularProbes后有推出AlexaFluor的抗体标记试剂盒,生物通这里有详细而精彩的介绍,我们就不罗嗦了。毕竟不是WB的主流方法。)一抗的稀释度通常需要预实验摸条件,可以根据说明书上建议的WB稀释度附近做2—3个梯度,如果是

5、用化学发光法检测,由于灵敏度高而建议将稀释度再放大一些。   二级试剂的作用是信号扩增,选择是根据一抗的标记形式而决定的,对于无标记的一抗,可以选择对应一抗来源种属的标记二抗,或者更便宜的标记蛋白A(来自金黄葡萄球菌ProteinA可以高度亲和来自人,兔,豚鼠的IgG,但对大鼠、山羊和鸡的IgG亲和力弱)。不过,二抗是更可靠的选择——除了要选择对应一抗的来源种属,也要根据你准备采用的检测方法选择合适的标记。     酶促反应比同位素安全且快速,已经成为WesternBlot的主流检测方法。酶促反应可以搭配不同的底物从而实现不

6、同的显色方法:化学发光Chemiluminescent和底物显色Colormetirc/Chromogen,前者灵敏度很高——随着各大厂家努力开发研制灵敏度更高的发光底物,化学发光法的灵敏度已经达到pg级别,甚至还有Femto级别的,灵敏度超过了同位素;而后者由于直接显色而操作简便且成本低。最为大家熟悉当数辣根过氧化物酶HRP(HorseradishPeroxidase,属于过氧化物酶POD类)和碱性磷酸酶AP(AlkalinePhosphatase),此外还有比较少见的葡萄糖氧化酶(GlucoseOxidase)、β半乳糖

7、苷酶β-Galactosidase。.HRP辣根过氧化酶是最常见的酶促发光或显色的交联酶,由于HRP比活高、特异性更强、分子量小(40kD)、稳定和作用底物范围广的优点而得到广泛使用。HRP的底物种类有不少,主要可以分为化学发光底物和生色底物2大类。对于底物的选择,主要考虑的是灵敏度、背景和使用的方便性和稳定性——比如底物可溶性高使用就比较方便;对于WB来说产物不可溶有助于信号在原位的积累和结果的稳定(产物可溶的底物更适合于Elisa)。   HRP的生色底物显色有DAB,4-CN,CN/DAB,AEC和TMB等(而得到可溶

8、性产物的底物如OPD,ABTS等则适用于ELISA)中,与化学发光法中的酶促基团发光不同,底物显色主要是利用底物在有HRP和过氧化氢的存在下失去电子而呈现出颜色变化积累这一过程检测WB的结果。底物DAB4-CNAECTMB学名4-chloro-1-naphthol3,3,5,53,3-di

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