Biomics CRISPR Cas9 基因敲除技术.pdf

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1、CRISPR/Cas9基因敲除技术CRISPR(ClusteredRegularlyInterspacedShortPalindromicRepeats)RNA,是最近几年才发现的原核生物中的调控RNA,用以抵御病毒和质粒入侵。在II型CRISPR系统中,CRISPRRNA(crRNA)与转录激活crRNA(Trans-activatingcrRNA,tracrRNA)退火形成的复合物能特异识别基因组序列,引导Cas9核酸内切酶在目的片段生成DNA双链断裂(double-strandbreaks,DSBs)。CRISPR-Cas系统的高效基因组编辑功能已被应用于

2、多种生物,包括人、小鼠、大鼠、斑马鱼、秀丽隐杆线虫、植物及细菌。多个科研小组的研究都显示,与锌指核酸酶(ZFNs)和转录激活样效应核酸酶(Transcriptionactivator-likeeffectornucleases,TALEN)相比较,CRISPR-Cas系统介导的基因组靶向实验在真核细胞中具有相似甚至更高的效率。Biomics专注于RNA基因调控多年,最新推出基因组编辑工具CRISPR/Cas9专家系统,该系统灵活简单、可以对特定基因组位点进行切割置换,特异性高、细胞毒性低。CRISPR/Cas9系统可广泛应用于基因组工程,如基因抑制,基因敲除,基

3、因敲入,基因修复等。CRISPR-Cas9体系的RNA-DNA识别机制为基因组工程研究提供了一项简便而强大的工具。其最重要的优势是Cas9蛋白可在多个不同的gRNA的引导下同时靶向多个基因组位点,起到多靶点调控的作用。òCRISPR与RNAi的区别目前已经广泛应用的RNAi技术的靶标是mRNA,而CRISPR通过RNA识别DNA序列然后再改变DNA序列,是可以遗传的。由于编码mRNA的DNA序列只占总DNA的极少部分,因此靶向DNA序列的CRISPR的靶标要比RNAi广得多,更有可能筛选出针对某DNA序列的特异CRISPR靶标。作为一种新的基因编辑技术,CRIS

4、PR/Cas9有以下特点和优势:1、操作简单,靶向精确性更高。sgRNA靶向序列和基因组序列必须完全匹配,Cas9才会对DNA进行剪切。编码sgRNA的序列不超过100bp,因此比构建TALENs和ZENs更简单方便,用于CRISPR的sgRNA识别序列仅需20个核苷酸。2、CRISPR/Cas9系统是由RNA调控的对DNA的修饰,其基因修饰可遗传。3、基因修饰率高,基因调控方式多样,例如敲除、插入、抑制、激活等4、可实现对靶基因多个位点同时敲除。5、无物种限制。6、实验周期短,最快仅需2个月,节省大量时间和成本。©Biomics提供以下CRISPR/Cas9专

5、家系统服务1、与客户协商根据靶序列设计RNA序列(3个工作日);Biomics具有丰富的sgRNA设计经验,提供的序列经过blast,优选脱靶效应最低的序列提交给客户。此外,为进一步提高sgRNA的特异性和降低脱靶效应,我们提供双切口sgRNA对设计(Figure1)。。Figure1.SchematicillustratingDNAdouble-strandedbreaksusingapairofsgRNAsguidingCas9D10Anickases(Cas9n).2、客户根据自身需要选择sgRNA表达载体构建,或sgRNA体外转录合成(构建周期:10个工

6、作日)A、sgRNA表达载体构建,该构建载体为Biomics独有设计策略,连接效率更高,鉴定方法准确便捷。客户可以根据自身需要选择载体构建服务或直接购买试剂盒(PrecutSgRNACloningkit&pSD-gRNAPlasmid)质粒pSD-gRNA专门用于在哺乳动物细胞中表达sgRNA,该质粒含CMV启动子驱动的GFP报告基因表达框,与Cas9表达质粒一起转染细胞即可以完成基因组编辑功能。此质粒由Biomics独立设计含氨苄抗性用于阳性克隆筛选,试剂盒提供预剪切线性质粒,客户可以直接进行连接筛选阳性克隆,降低了客户酶切质粒不完全导致假阳性克隆的出现几率。

7、B、sgRNA体外合成。TM客户可以根据自身需要选择sgRNA合成纯化服务或直接购买试剂盒(T7sgRNAMICscriptTMKIT&EzOmicsRNAQUICKclearKIT-)体外转录的sgRNA与质粒表达的sgRNA相比,更简便快捷,省去了质粒构建的步骤,整个操作过程仅需20h(包括过夜孵育)。转录纯化后的sgRNA可直接进行转染及细胞显微注射。¢sgRNA合成引物(反向引物设计为固定模式,由Biomics提供)¢PCRkit(e.g.pfuDNApolymerase)TM¢T7sgRNAMICscriptKITTM¢EzOmicsRNAQUICKc

8、learKIT-----

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