辣椒叶片总RNA快速提取.doc

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1、辣椒叶片总RNA快速提取  摘要:采用改良的Trizol法对辣椒叶片的总RNA进行了提取,利用琼脂糖凝胶电泳、紫外分光光度法、RT-PCR进行RNA纯度、完整性检测。结果表明,Trizol法提取可获得较高质量的辣椒叶片总RNA,能满足后续的研究需要。  关键词:辣椒;总RNA;改良Trizol法;提取  中图分类号:Q522;S641.3文献标识码:A文章编号:0439-811417-3630-02    RapidExtractionofTotalRNAfromCapsicumannuumLeaves  

2、  LIXiao-xia,XIAOZhong-jiu,SONGPei-yong,ZHOUXun,XIEYu      Abstract:TrizolextractionmethodwasmodifiedtoextracttotalRNAfromCapsicumannuumleaves.Theresultofagargelelectrophoresis,ultravioletrayphotometerandRT-PCRshowedthatthetotalRNAobtainedbymodifiedTrizolm

3、ethodwasofhighquality,andsuitablefordownstreamapplications.  Keywords:Capsicumannuum;totalRNA;modifiedTrizolmethod;extraction    植物组织中总RNA的提取是植物分子生物学研究的基本技术之一,高质量RNA的获得是进行RT-PCR、Northernblot、cDNA文库构建等分子生物学研究的前提条件[1,2]。植物组织中富含纤维等多糖物质,很容易与RNA发生共沉淀[3],此外RNase

4、非常稳定,极易导致RNA降解,因此要获得纯度高、完整性好的高质量RNA有一定的难度。辣椒叶片富含纤维、多糖和酚类物质,对总RNA提取方法进行探讨,以获得理想的效果就显得尤为重要。本研究在尝试了多种提取方法的基础上,使用改良的Trizol法提取辣椒叶片总RNA,以期为后续的研究奠定良好的基础。  1材料与方法  1.1材料与试剂  实验用辣椒材料为西安8819、牛角椒、遵义朝天椒,从市场上购买种子,实验室盆栽,取花期辣椒叶片,用75%乙醇进行表面清洁后晾干,无菌刀片切取0.1g,称重后立即用于实验或用锡箔纸包

5、裹后进行液氮速冻,置于-80℃冰箱保存。  Trizol购自Invitrogen公司,焦碳酸二乙酯购自生工生物工程有限公司,反转录试剂盒及PCR用品购自宝生物工程有限公司,引物由天根生化科技有限公司合成,其他试剂均为国产分析纯。试剂均用0.1%DEPC水配制,塑料耗材用0.1%DEPC水处理过夜后湿热高温灭菌;研钵等器皿在180℃烘烤6h以上,以避免RNA酶污染[4]。  1.2方法与步骤  1.2.1总RNA的提取参照Trizol试剂使用说明并作改良。①取辣椒叶片材料,置于预冷的研钵中,加入适量液氮,迅速

6、研磨成粉末,加入1mLTrizol试剂,充分匀浆;②转入无RNase的2mL的离心管,室温溶化后加入500μL等体积的酚、氯仿混合液,剧烈震荡混匀5min,4℃、13500r/min离心15min,③吸取上层水相至另一离心管中,加入0.5mL预冷的异丙醇混匀,室温放置10min,4℃  13500r/min离心10min,弃上清。④加入75%乙醇,温和振荡离心管,悬浮沉淀,重复两次,4℃、  7500r/min离心5min,超净工作台吹干,溶于30μLRNasefree水,-80℃储存。  1.2.2凝胶电

7、泳检测RNA的完整性取6μL提取的RNA样品进行1%琼脂糖凝胶电泳,检测样品的完整性。  1.2.3总RNA纯度的测定取5μL提取的RNA样品用RNasefree水稀释到200μL,用752型紫外分光光度计分别测定在260、280nm波长下样品的OD值,判断其纯度。  1.2.4RT-PCR扩增辣椒actin基因RNA反转录合成cDNA链后,选用辣椒持家基因actin基因进行PCR,以验证提取的RNA是否可用,其特异性引物为P1:5′-AGGGATGGGTCAAAAGGATGC-3′,P2:5′-GAGAC

8、AACACCGCCTGAATAGC-3′,目标片段大小为289bp;PCR反应体系为25μL,包括反转录cDNA模板1μL,10×PCRBuffer2.5μL,MgCl22.5μL,dNTPs0.5μL,引物各1μL,TaqDNA聚合酶0.5μL,ddH2O16μL。PCR扩增在PTC-200型扩增仪上完成,PCR反应程序为:94℃,3min;94℃,30s,58℃,45s,72℃,1min,30个循环;72℃延

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