酚、氯仿、异戊醇法沉淀DNA.doc

酚、氯仿、异戊醇法沉淀DNA.doc

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1、酚:氯仿:异戊醇法抽提基因组DNA1.从无水乙醇中取出少许肌肉或者性腺组织(约50mg),剪碎,加入干净灭菌的EP管中;2.准备适量的裂解缓冲液SNET(600μL),随即在SNET中加入蛋白酶K使终浓度为400μg/ml,向组织中裂解缓冲液。SNET:20mmol/Ltris-Cl(Ph8.0)5mmol/LEDTA(Ph8.0)400mmol/LNaCl1%(m/V)SDS上述溶液需经过0.45μm的硝酸纤维素滤器过滤除菌,保存于室温。3.管子垂直放置于震荡平台或振动恒温箱中55℃放置过夜(消化过程中样品的充分混合时非常必要的。过夜消化后,应当看不到组织,缓冲液呈现灰

2、色状态).4.加入等体积(600μL)的酚:氯仿:异戊醇,密闭管口,室温下置于震荡平台30min.(不同的实验阶段,需要不同的振动速度.)备注:酚取下层(上层为保护液)过会变成淡黄色为佳,酚:氯仿:异戊醇混合后澄清才可以用5.离心吸取上清(4℃11,000rpm(11200×g)最大转速简短离心25分钟(5min钟就好),转移上清至另一新的离心管中)。6.取出消化液,加入600μL(等体积)酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)混合液(按一个样品1.5ml配置),温和混匀20min,11,000rpm(11200×g)离心15min,回收上清;5min7.重复酚/氯仿/异戊醇

3、抽提过程2次后,然后换成每管600uL氯仿抽提。8.回收的上清液加入1/10体积的3mol/LNaAc和等体积异丙醇,温和混匀后-20℃静置2h9.4℃13000转/分离心20min,弃上清;5min10.用75%乙醇洗涤1-2次(1000ul,11000转/分离心2min),弃上清;轻柔晃匀11.冰冻无水乙醇洗涤1-2次(1000ul,11000转/分离心4min)弃上清,自然晾干或烘干,DDW或TE溶解,30-50ul,再加入1ul10mg/ml的RNA酶溶液,37℃温育2h,核酸蛋白定量仪检测OD及浓度。12.DNA质量检测用脉冲场电泳检测抽提DNA质量,也可以用一

4、块20cm长1%琼脂糖凝胶30-35V/cm过夜电泳。

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