不同核酸提取方法对荧光pcr定量结果有何影响

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1、中国人民解放军第三0二医院王海滨写在课前的话荧光定量PCR质量一般有三个要素,分别是试剂、仪器和人员,另外还有内标的影响。对荧光定量PCR的影响因素较多,因此要得出比较准确、稳定性的PCR结果,需要对各个环节进行严格控制。荧光定量PCR质量的影响因素有哪些?一、荧光定量PCR质量的三个要素荧光定量PCR质量一般有三个要素,分别是试剂、仪器和人员。试剂是由生产厂家专门提供,包括核酸提取与扩增两个部分。核酸提取是由不同单位的工作人员进行操作,扩增部分是由厂家专门制备好的。仪器包括三个方面:温控、光学和软件,不同仪器温控、光学、软件三

2、个部分原理和性能均有一定差异。不同单位人员的专业知识和管理方式方法不同,对检测结果也有明显的影响。另外还有内标的影响。荧光定量PCR质量的影响因素有()窗体顶端A.试剂B.仪器和人员C.内标D.以上均有窗体底端A.试剂B.仪器和人员C.内标D.以上均有正确答案:D解析:荧光定量PCR质量的影响因素有试剂、仪器和人员和内标。试剂包括核酸提取与扩增两个部分,核酸提取是由不同单位的工作人员进行操作,涉及环节较多。不同仪器温控、光学、软件三个部分原理和性能均有一定差异。不同单位人员的专业知识和管理方式方法不同,对检测结果也有明显的影响。

3、不同核酸提取方法对荧光PCR定量结果有何影响?二、不同核酸提取方法对荧光PCR定量结果的影响目前临床常用的核酸提取方法有:一是聚乙二醇法,也称煮沸法;二是层析柱法,也称为提纯法;第三是磁珠法,也称吸附法。第四是近年出现的血清或血浆的检测标本直接加入方法。第五是近年罗氏公司引进的COBASTaqMan全自动核酸提取与扩增系统,其提取原理是磁珠法。(一)聚乙二醇法1、操作步骤取100微升配置好的聚乙二醇工作液,需注意目前所用的聚乙二醇一般是20%的聚乙二醇,较黏稠,试剂盒保存温度为-20度,因此在温室要彻底的复溶,溶化呈液状。加样时

4、吸100微升,因为黏稠,一定要过吸、停顿,然后把吸头外多余的聚乙二醇粘掉,再加到相应的操作管中。吸和加均注意停顿,加入到操作管里面的含量应该尽量精确至100微升。由于液体的黏稠,不同的人、不同的操作手法差异特别大。加好100微升的聚乙二醇后加入100微升待测标本,主要包括血清、血浆或其他液体,二者要彻底混匀。第二步是13000转离心,一般用角度离心机离心10分钟,弃掉上清液,尽可能少留残余,并保证不把沉淀物吸掉,沉淀物含有核酸成分。第三步加入碱性裂解液25微升,碱性裂解液往往带有悬浮物,充分混匀。含有核酸的沉淀物往往比较黏稠,加

5、上碱性裂解液通过振荡混匀常常不会把沉淀物振开,而如果通过吹打混匀,又容易把沉淀物带走一部分。此操作环节建议操作人员咨询实际生产厂家,因为试剂盒标准品不通过核酸提取,如果这一步标本的核酸丢失过多,而外标标准又无变化,对结果的影响较大,是振荡混匀或者吹打混匀,要求操作人员和厂家达成共识。最后一步是100度煮沸10分钟,后13000转离心10分钟。取上清液进行PCR检测。2、优缺点优点是操作较快速,可部分去除标本中的PCR干扰物质(胆红素、血脂、离子等)。缺点是核酸丢失严重。弃掉的上清液含有大量HBV(50%左右);碱性裂解液核酸裂解

6、不彻底,与混匀程度密切相关(丢失30%左右)。操作步骤较多,每个环节均存在不同实验室人员和仪器的差异,因此影响因素较多。(二)层析柱法1、操作步骤层析柱方法主要用于RNA的提取,以QIaGen试剂为例做简单的分析。它分为四个步骤:第一步是取560微升已配置好的核酸裂解液,与140微升待检的标本(血清、血浆或其他的液体)混匀,室温静置10分钟。第二步加500微升的无水乙醇混匀,8000转离心1分钟。第三步是层析柱过滤,将加过乙醇的标本加到层析柱,通过8000转离心1分钟,滤掉多余液体,核酸即可在层析柱上吸附,然后用洗涤液A和B洗脱

7、柱上的盐和蛋白质,13000转高速离心2分钟,将层析柱和层析膜上多余的物质离下去,在层析柱的中间加50微升的洗脱液,室温静置10分钟,让它彻底溶在水中,10000转离心3分钟,洗脱液即可进行PCR扩增。2、注意事项第一步核酸裂解液含有异硫氰酸胍或盐酸胍,胍盐是裂解核酸的物质,它在低温时容易结晶、凝集,结晶后如果不能彻底溶化,只是取上清液和带液标本提取核酸,容易出现假阴性。通常的做法是在56度的环境让核酸裂解液彻底溶化,以肉眼看不到结晶为标准。另外是在室温静置10分钟,有的试剂盒是在72度放置10分钟。目前的核酸裂解液对病毒的裂解

8、效果非常强,二者混匀之后,标本中的核酸基本上在1到2分钟均能够彻底裂解,放置的时间延长对病毒裂解效果不再有意义,反而对标本中的RNA起到降解作用。因此建议不同的实验室应摸索最佳条件。第三步是过层析柱,滤过后的液体,再进行一次过滤,发现层析柱过滤的东西含有近一半核

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