第1章-氨基酸

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1、第一章蛋白质的构件---氨基酸ProteinArchitecture---AminoAcid(AA/Aa/aa)一、蛋白质的化学组成和分类1、元素组成蛋白氮占生物组织所有含氮物质的绝大部分。蛋白质含量=每克样品中含氮的克数6.25凯氏定氮法依据外形分类球状蛋白质:globularprotein纤维状蛋白质:fibrousprotein膜蛋白质:membraneprotein依据蛋白质的组成分类简单蛋白simpleprotein单纯蛋白,仅由氨基酸组成结合蛋白conjugatedprotein由简单蛋白与其它非蛋白成分结合而成P152、蛋白质构件酸/碱能将蛋白完全

2、水解酶水解一般是部分水解得到各种AA的混合物得到多肽片段和AA的混合物氨基酸是蛋白质的基本结构单元蛋白质——胨——多肽——肽——AA3、AA的一般结构天然形成的AA在300种以上。构成蛋白质的AA只有20余种,且都是L-α-氨基酸。L-α-氨基酸在晶体或溶液状态下AA的存在状态四、AA的分类(一)常见的proteinAA按R基的极性性质:1、非极性R基aa2、不带电荷的极性R基aa3、带正电荷的R基aa4、带负电荷的R基aa根据酸碱性蛋白质氨基酸(20种)酸性氨基酸天冬氨酸谷氨酸碱性氨基酸赖氨酸组氨酸精氨酸中性氨基酸极性氨基酸非极性氨基酸丝氨酸苏氨酸半胱氨酸酪氨酸

3、天冬酰氨谷氨酰胺甘氨酸丙氨酸亮氨酸异亮氨酸苯丙氨酸甲硫氨酸色氨酸脯氨酸缬氨酸请见教材P17各AA的3字母代号(二)不常见的蛋白质氨基酸由常见AA衍生或修饰而来。ε-δδ鸟氨酸瓜氨酸(三)非蛋白质氨基酸4、氨基酸的酸碱性质(一)兼性离子H3N—CH—COOHR+(pH<pI)H3N—CH—COO-R+(pH=pI)H2N—CH—COO-R(pH>pI)(二)氨基酸的解离(三)氨基酸的等电点当溶液为某一pH值时,AA主要以兼性离子的形式存在,分子中所含的正负电荷数目相等,净电荷为0。这一pH值即为AA的等电点(pI)。在pI时,AA在电场中既不向正极也不向负极移动,即

4、处于两性离子状态。对于侧链含有可解离基团的AApI取决于两性离子两边pK’值的算术平均值酸性AA:pI=(pKα-COO-+pKR-COO-)/2碱性AA:pI=(pKα-NH3++pKR-NH2)/2侧链不含解离基团的中性AApI=(pK’1+pK’2)/2六、氨基酸的化学反应(一)α-氨基参加的反应(一)α-氨基参加的反应1.与亚硝酸反应2.与酰化试剂反应3.烃基化反应4.形成Schiff’s碱反应5.脱氨基反应NH2OHRCHCOOH+HNO2RCHCOOH+H2O+N2VanSlyke法测氨基氮(体积)。N2中的1/2为氨基氮。氨基酸定量和蛋白质水解程度的

5、测定。NO2FO2N+H2N—CH—COOHRNO2O2NHN—CH—COOHR+HF弱碱性DNP-氨基酸(黄色)DNFBSanger法测定N末端氨基酸基础—N=C=S+N—CH—COOHHHRPITC—N—C—N—CH—COOHHHRSPTC-氨基酸—N—CHRSNCCOPTH-氨基酸pH8.3无水HF异硫氰酸苯

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