不同动物来源的新城疫病毒f基因序列分析

《不同动物来源的新城疫病毒f基因序列分析》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、动物医学进展，２０１４，３５（１２）：３６－４０ＰｒｏｇｒｅｓｓｉｎＶｅｔｅｒｉｎａｒｙＭｅｄｉｃｉｎｅ不同动物来源的新城疫病毒Ｆ基因序列分析冯淑萍１，石伟革２，孙翔翔３，潘杰４，黄胜斌１，曾咏芳３，何奇松１，杨可研３，胡巧云１＊，熊毅１（１．广西区动物疫病预防控制中心，广西南宁５３０００１；２．兴安县动物疫病预防控制中心，广西兴安５４１３００；３．广西大学动物科学技术学院，广西南宁５３０００５；４．广东永顺生物制药股份有限公司，广东广州５１００００）摘要：为了解广西地区新城疫病毒（ＮＤＶ）在不同动物宿主内的分布流行情况，对从广西地区鸡、野鸟、猪、鹅、马等５种不同动物体内分离到

2、ＮＤＶ毒株，进行了Ｆ基因的克隆扩增和序列分析。结果表明，５个ＮＤＶ分离株Ｆ基因的核苷酸序列同源性为８５．２％～９８．６％，推导氨基酸序列同源性为８８．９％～９８．６％，同源性差异较大；５个毒株的Ｆ基因与国内贵州、长春、福建等地的当前流行株同源性较高；以Ｆ基因前３７４ｂｐ核甘酸同源性比较分型表明，鸡源、鹅源、马源毒株为当前流行的基因Ⅶ型，而猪源毒株和野鸟源毒株为传统的基因Ⅱ型。关键词：新城疫病毒；Ｆ基因；序列分析；同源性中图分类号：Ｓ８５２．６５９．５；Ｑ７８９文献标识码：Ａ文章编号：１００７－５０３８（２０１４）１２－００３６－０５新城疫病毒（Ｎｅｗｃａｓｔｌｅｄｉｓｅａｓｅｖ

3、ｉｒｕｓ，ＮＤＶ）属ｔｉｎｉｎｎｅｕｒａｍｉｎｉｄａｓｅ，ＨＮ）糖蛋白、融合（ｆｕｓｉｏｎ，Ｆ）于副黏病毒科中的禽腮腺炎病毒属，其基因组ＤＮＡ糖蛋白及衬于脂质膜内面的非糖基化内膜（ｍａｔｒｉｘ，［１］包括６个基因，编码６种结构蛋白，其中核衣壳蛋白Ｍ）蛋白。其编码的蛋白从３′端开始依次为ＮＰ－（ｎｕｃｌｅｏｃａｐｓｉｄｐｒｏｔｅｉｎ，ＮＰ）、磷蛋白（ｐｈｏｓｈａｔｅｐｒｏ－Ｐ－Ｍ－Ｆ－ＨＮ－Ｌ。其中ＨＮ、Ｆ是糖基化蛋白，在病毒ｔｅｉｎ，Ｐ）和大蛋白（ｌａｒｇｅｐｒｏｔｅｉｎ，ＬＰ）与基因组ＲＮＡ表面形成刺突，因此也被称为刺突蛋白（ｓｐｉｋｅｐｒｏ－有关。另外３种与病毒的脂质膜有关

4、，即固定在病ｔｅｉｎ）。ＨＮ蛋白通过识别，吸附于细胞表面的受体，毒膜表面纤突上的血凝素－神经氨酸酶（ｈａｅｍａｇｇｌｕ－参与病毒粒子感染；而Ｆ蛋白通过释放融合多肽，收稿日期：２０１３－１２－２３基金项目：广西自然科学基金项目（２０１０ＧＸＮＳＦＤ０１３０３３）作者简介：冯淑萍（１９８４－），女，广西崇左人，主要从事动物传染病控制研究。＊通讯作者櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙櫙［１６］张娅，于丹妮，赵巍，等ＬｕｘＳ基因在变异链球菌铁代谢中ｓｅｎｓｉｎｇｐｒｏｔｅｉｎＬｕｘＳｒｅｖｅａｌｓａｃａｔａｌｙｔｉｃｍｅｔａ

5、ｌｓｉｔｅ［Ｊ］．Ｐｒｏｃ的作用研究［Ｊ］．口腔医学杂志．２０１３，３３（４）：２３９－２４１．ＮａｔｌＡｃａｄＳｃｉＵＳＡ，２００１，９８（２０）：１１１６９－１１１７４．［１７］ＨｉｌｇｅｒｓＭＴ，ＬｕｄｗｉｇＭＬ．Ｃｒｙｓｔａｌｓｔｒｕｃｔｕｒｅｏｆｔｈｅｑｕｏｒｕｍ－ＣｌｏｎｉｎｇａｎｄＰｒｏｋａｒｙｏｔｉｃＥｘｐｒｅｓｓｉｏｎｏｆＬｕｘＳＧｅｎｅｆｒｏｍＥｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓｆａｅｃａｌｉｓＸＪ０５ＩｎｄｕｃｉｎｇＬａｍｂＥｎｃｅｐｈａｌｉｔｉｓＧＵＯＢｉｎｇ－ｊｉａｏ，ＬＵＳｈｕａｉ，ＷＡＮＧＸｉ－ｃｈｕ，ＺＨＥＮＧＴｉｎｇ－ｔｉｎｇ，ＺＨＯＵＸｉａ，ＹＡＮＧｅｎ

6、－ｑｉａｎｇ（ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＡｎｉｍａｌＳｃｉｅｎｃｅａｎｄＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，ＳｈｉｈｅｚｉＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｓｈｉｈｅｚｉ，Ｘｉｎｊｉａｎｇ，８３２０００，Ｃｈｉｎａ）Ａｂｓｔｒａｃｔ：ＬｕｘＳｇｅｎｅｗａｓａｍｐｌｉｆｉｅｄｆｒｏｍｔｈｅｃｈｒｏｍｏｓｏｍａｌＤＮＡｏｆＥｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓｆａｅｃａｌｉｓＸＪ０５ｉｎｄｕｃｉｎｇｌａｍｂｅｎｃｅｐｈａｌｉｔｉｓｗｉｔｈＰＣＲ，ｔｈｅｆｒａｇｍｅｎｔｓｗｅｒｅｓｅｑｕｅｎｃｅｄａｎｄａｎａｌｙｚｅｄａｎｄｃｏｍｐａｒｅｄｗｉｔｈｔｈｅｃｏｒｒｅ－ｓｐｏｎｄｉｎｇｓｅｑｕｅｎｃｅｓｉｎＧｅｎＢａｎｋ．Ｔｈｅｐｒｏ

7、ｋａｒｙｏｔｉｃｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｖｅｃｔｏｒｗａｓｃｏｎｓｔｒｕｃｔｅｄａｎｄｔｈｅｒｅｃｏｍｂｉｎａｎｔｐｒｏｔｅｉｎｓｗｅｒｅａｎａｌｙｚｅｄｂｙＳＤＳ－ＰＡＧＥａｎｄＷｅｓｔｅｒｎｂｌｏｔ．Ｔｈｅｆｕｌｌ－ｌｅｎｇｔｈｇｅｎｅｗａｓ４５９ｂｐ，ｔｈｅｈｉｇｈｅｒｈｏ－ｍｏｌｏｇｉｅｓｗｅｒｅ６１．２％ａｎｄ１００％ｃｏｍｐａｒｅｄｗｉｔｈＢｏｃｉｌｌｕｓｃｅｒｅｕｓａｎｄＥｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓｆａｅｃａｌｉｓＶ５８３．Ｔｈｅｇｅｎｅｅｎｃｏｄｅｄ１５２ａｍｉｎｏａｃｉｄｓａｎｄｈ