广州地区汉族人群肺癌易感性标记物cyp1a1、cyp2e1和gstm1与肺癌关系的病例对照研究

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1、广州地区汉族人群肺癌易感性标记物CYP1A1、CYP2E1和GSTM1与肺癌关系的病例对照研究:王德全 陈思东 汪保国 蔡旭玲 冼雪珍【摘要】  [目的]探讨广州地区汉族人群谷胱苷肽硫转移酶(GSTM1)、细胞色素P4501A1(CYP1A1)和细胞色素P4502E1(CYP2E1)基因多态性与肺癌易感性的关系。[方法]选取中山大学附属第一医院、广州市肿瘤医院、广州市红十字会医院等医院的广州籍新发肺癌病人91例及同期上述各医院的同性别非肺部疾患病人91例作对照,采用聚合酶链式反应(PCR)和限制性片段长度多态性(RFLP)技术检测CYP1A1、CYP

2、2E1和GSTM1的基因多态性。[结果]与野生型的CYP1A1相比,突变型肺癌OR为1.51(0.76~3.01),CYP2E1C2C2基因型与C1C1基因型比较,其OR为5.48(1.21~25.23),GSTM1基因缺失型的OR值为1.26(0.69~2.30),而三者联合作用时,则可增加患肺癌的危险,其OR值为3.97(0.94~16.79),但无统计学意义(P>0.05)。[结论]CYP1A1、CYP2E1和GSTM1的某些基因型增加了患肺癌的危险性,但尚未达到统计学的显著性水平,说明它们均不是肺癌个体易感性的主效基因,而是次效基因。【

3、关键词】基因多态性 肺肿瘤 病例对照研究  1材料与方法1.1研究对象病例于广州市肿瘤医院、广州市红十字会医院、中山大学附属第一医院等2000年至2001年广州籍新发肺癌病人91例,其中男性60例,女性31例。年龄22岁~84岁。对照组1:1匹配于同期同一医院非肿瘤非肺部疾患的病人,性别相同,年龄±2岁。对照组91例,其中男性60例,女性31例,年龄最小22岁,最大82岁。两组间的年龄和性别的分布差异无显著性。1.2样本的采集采集实验对象的静脉血8ml~10ml,于4℃冰箱静置分离血清及血凝块,取血凝块于-70℃冰冻保存。1.3DNA的制备新鲜血凝块

4、或冰冻血凝块室温解冻后,采用DNA酚抽提方法提取DNA。1.4CYP1A1基因型的检测引物序列:5′?鄄CAGTGAAGAGGTGTAGCCGCT?鄄3′和:5′?鄄TAGGAGTCTTGTCTCATGCCT?鄄3′,由上海生工生物工程技术服务有限公司合成。PCR反应体积及反应条件:ddH2O8.5μl,10×Buffer5.0μl,dNTPs1.0μl(0.01μmol),引物2种各10.0μl(3.125×10-5μmol)(0.655μM),Taq酶0.5μl(2.5U),模板5.0μl。94℃预变性2min,然后用94℃50s(变性)、54℃

5、50s(退火)、72℃60s(延伸),进行30个循环,最后72℃7min。PCR扩增产物用MSPI酶切:扩增产物10μl,(10U)MsPI内切酶1μl,10×Buffer2μl,ddH2O2μl1000g,离心数秒,加石蜡25μl,37℃水浴1~3h,65℃水浴10~15min终止酶切,取8μl酶切产物点样用1.8%琼脂凝胶作电泳分析。结果判断:野生型为340bp,突变型140,200bp2个片段,杂合型为140,200,340bp3个片段。1.5CYP2E1基因多态性检测引物设计:CYP4502E1PstI/RsaI型引物:5′?鄄CCAGTCG

6、AGTCTACATTGTCA?鄄3′,5′?鄄TTCATTCTGTCTTCTAACTGG?鄄3′。PCR反应条件:ddH2O8.5μl,10×Buffer5.0μl,dNTPs1.0μl(0.01μmol),引物4种各10.0μl(3.125×10-5μmol)(0.655μM),Taq酶0.5μl(2.5U),模板5.0μl。94℃预变性2min,然后用94℃50s(变性)、54℃50s(退火)、72℃60s(延伸),进行30个循环,最后72℃7min。PCR扩增产物的酶切:总体积15μl:扩增产物10μl,(10U)RsaI内切酶1μl,10×B

7、uffer2μl,ddH2O2μl1000g,离心数秒,加石蜡25μl,37℃水浴1~3h,65℃水浴10~15min终止酶切,取8μl酶切产物点样用1.8%琼脂凝胶作电泳分析。结果判断:PCR产物长度为410bp,经RsaI酶切后,在紫外光下可见三种情况:①出现360bp和50bp的两条亮带,此为C1C1野生型纯合子;②只出现410bp的亮带,此乃C2C2突变型纯合子;③若出现上述的全部三条亮带,此为C1C2杂合子。1.6GSTM1基因多态性检测两对引物(见表1)分别特异性扩增GSTM1基因片断(215bp)及参照基因β?鄄globin(β?鄄珠蛋

8、白、268bp),由上海生物工程公司合成。1.6.1PCR扩增ddH2O18.5μl,10×Buffer5.

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