陆地棉snp遗传图谱构建及产量纤维品质性状的qtl定位

《陆地棉snp遗传图谱构建及产量纤维品质性状的qtl定位》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、密级：论文编号：中国农业科学院学位论文陆地棉ＳＮＰ遗传图谱构建及产量纤维品质性状的ＱＴＬ定位ＣｏｎｓｔｒｕｃｔｉｏｎｏｆＳＮＰＧｅｎｅｔｉｃＭａｐａｎｄＩｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎｏｆＱＴＬｓ化ｒＹｉｅｌｄａｎｄＦ化ｅｒｉｍｌｉＴｒａｉｔｓｉｎＵｌａ打ｄＣｏ村ｏｎＧｏ巧Ｑ巧ｐ（ｈｉｒｓｕｔｕｍ）硕古研巧生：张震指导教师：袁有禄申请学位类别：农业推广硕±专业领域名称：作物培养单位：中国农业科学院棉花研巧所中国农业科学税研究生院２０１５年６月密级:论文编号:中国农业科学

2、院学位论文陆地棉SNP遗传图谱构建及产量纤维品质性状的QTL定位ConstructionofSNPGeneticMapandIdentificationofQTLsforYieldandFiberQualityTraitsinUplandCotton(Gossypiumhirsutum)硕士研究生：张震指导教师：袁有禄申请学位类别：农业推广硕士专业领域名称：作物培养单位：中国农业科学院棉花研究所中国农业科学院研究生院2015年6月Secrecy:No.ChineseAcademyofAgriculturalSciencesDissertationConstru

3、ctionofSNPGeneticMapandIdentificationofQTLsforYieldandFiberQualityTraitsinUplandCotton(Gossypiumhirsutum)M.S.Candidate：ZhangZhenSupervisor：ProfessorYuanYou-luDegree：MasterofAgriculturalExtensionSpecialty:CropScienceJune2015III摘要棉花是世界上最重要的经济作物之一，它可以为人类的生活以及工业的发展提供天然的纤维能源。随着社会的发展和人民生活

4、水平的不断提高，具有高纤维品质的棉种也越来越受到人们的关注。本研究采用来自四川农业大学，具有高强纤维的陆地棉优异品系0-153和在黄河流域大田推广的陆地棉栽培品种中棉所41选系SGK9708作为亲本，构建重组自交系群体，并利用棉花70K芯片进行遗传图谱的构建，并用复合区间作图法对于产量性状和纤维品质性状进行QTL定位，这些工作为分子标记的辅助选择奠定了基础。所有的产量性状以及纤维品质性状在所有的11个试验环境下的偏斜度绝对值均小于1，近似符合正态分布，符合数量性状受微效基因控制的特征，可以进行QTL的定位。相关性分析表明，纤维长度，纤维整齐度，纤维强度之间呈现

5、极显著正相关，马克隆值与纤维长度，纤维强度呈现极显著负相关。铃重与籽指呈显著正相关，衣分与籽指呈显著负相关，纤维强度与铃重，衣分均呈现显著负相关，纤维长度与衣分，呈显著负相关，这说明，同步改良产量与纤维品质仍存在较大困难。利用棉花70K芯片提供的SNP探针共63058个在亲本0-153和SGK9708及其重组自交系群体之间进行筛选，共筛选出多态性标记6898个。利用HighMap对6898个多态性标记进行连锁分析，选择其中最大的26个连锁群，并通过序列比对，将他们对应到陆地棉染色体上构建出SNP遗传图谱。该遗传图谱包含有5434个标记，总遗传距离为4686.1

6、8cM，平均遗传距离为0.97cM的遗传图谱。在这些连锁群中，最大的连锁群含有386个标记，最小的连锁群中含有78个标记。其中A基因组13条染色体总遗传距离和平均遗传距离分别为为2068.69cM和121.98cM，D基因组13条染色体总遗传距离和平均遗传距离分别为2657.49cM和233.86cM。利用WinQTLCart2.5的复合区间作图法（CIM）对于2007，2008，2009，2010，2013年，共5年11个环境共6个地点的表形数据对产量性状以及纤维品质性状进行QTL定位。最终定位出在3个环境稳定的和产量性状相关的QTL共46个，其中，与铃重有

7、关的QTL有14个，与衣分有关的QTL共14个，与籽指有关的QTL共18个;与纤维品质相关的QTL共60个，其中，与纤维长度相关的QTL共14个，与纤维整齐度相关的QTL共8个，与马克隆值相关的QTL共11个，与纤维伸长率相关的QTL共9个，与纤维强度相关的QTL共18个。且这些QTL在A基因组1号，2号，5号，7号，9号，10号，12号，13号，以及D基因组5号，9号，10号，12号染色体中呈现成簇分布，这对于下一步的分子聚合育种，功能基因的挖掘，以及纤维品质和产量的同步改良，起到了一定的促进作用。关键词：陆地棉，纤维品质，产量，SNP标记，QTLIIIAb

8、stractCottonisoneof