il1b+3954-taq ⅰ基因多态性与慢性牙周炎易感性的关系

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1、IL1B+3954/TaqⅠ基因多态性与慢性牙周炎易感性的关系:韩冰,苟建重,陈曦,李生斌【摘要】目的探讨IL1B+3954/TaqⅠ基因多态性与慢性牙周炎易感性的关系。方法收集汉族人群116名受试者,其中包括66例中重度慢性牙周炎(CP)患者和50例牙周健康对照者,提取外周静脉血白细胞DNA,采用标准化的聚合酶链反应限制性片段长度多态性(PCRRFLP)的方法,进行IL1B+3954/TaqⅠ基因型的检测,比较各基因型检出率的差别。结果IL1B+3954/TaqⅠ位点均以A1/A1基因型占优势,CP组A

2、1/A2基因型检出率和健康对照组相比无统计学差异。结论IL1B+3954/TaqⅠ等位基因2可能与汉族人群中重度慢性牙周炎遗传易感性无关。【关键词】牙周炎;白细胞介素1;单核苷酸多态性;基因型;遗传易感性ABSTRACT:ObjectiveTostudypleeachsubjectandgenomicDNAeachsample.Singlenucleotidepolymorphisms(SNPs)atIL1B+3954/TaqⅠerasechainreactionrestrictionfragmentleng

3、thpolymorphisms(PCRRFLP)assay.ResultsInthecontrolgroup,highernumericalvaluesoftheA1/A1genotypeple.Statisticalanalysisrevealednosignificantdifferencebetorphisms(SNPs)oftheIL1B+3954/TaqⅠgeneandprevalenceand/orseverityofchronicperiodontitis.  KEYERGeneAmpPCRSyst

4、em9600,USA);高速台式离心机(HERMLEZ230MR,Germany);垂直电泳仪(DYYⅢ28A,北京);TaqⅠ限制性内切酶(宝生物工程大连有限公司)。  1.2病例收集选择在西安交通大学医学院口腔医院口腔内科门诊就诊的中重度慢性CP患者。入选者3代均为汉族,无口腔正畸治疗史,无明显错颌畸形,无全身系统性疾病(糖尿病、心血管疾病和血液性疾病),半年内未接受过牙周治疗,3个月内未服用抗菌素,妇女未妊娠。CP组纳入标准:口腔内至少有4个探诊深度大于5mm的位点,X线片显示牙槽骨吸收超过根长1/2。选取C

5、P患者66例,年龄23~68岁,平均(47.73±9.93)岁;正常对照组50例,年龄21~67岁,平均(42.02±12.33)岁,均无病理性牙周附着丧失。CP组和健康对照组间的年龄分布均衡,经统计学分析差异无统计学意义。  1.3样本采集和DNA提取取研究对象前臂静脉血2mL,0.5mol/LEDTA抗凝,Chelex100溶液提取外周静脉血白细胞DNA,4℃冷室保存备用。  1.4IL1B+3954/TaqⅠ多态性目的基因片段的扩增和酶切引物由北京奥科生物技术有限责任公司合成:A:5′CTCAGGTGTC

6、CTCGAAGAAATCAA3′;B:5′GCTTTTTTGCTGTGAGTCCCG3′。PCR反应条件:总反应体系40μL,引物A、B各2.4μL(10μmol/L),dNTP14μL(1mmol/L),MgCl22.4μL(25mmol/L),10×PCR缓冲液4μL,TaqDNA聚合酶1.0μL(2.5u/μL),模板DNA8μL,无菌去离子水5.8μL补足体积至40μL。  循环参数:94℃5min预变性后,进入主循环,包括5×(94℃、54℃、72℃各1min),25×(94℃、52℃、72℃各1mi

7、n);最后72℃延伸5min。25g/L琼脂糖凝胶电泳检测扩增产物,证实获得194bp目的基因片段。  PCR产物酶切:PCR产物酶切体系20μL,PCR产物10μL,TaqⅠ限制性内切酶0.6μL(10u/μL),10×NEBBuffer2μL,去离子水7.4μL补足体积至20μL,混匀后置于65℃水浴摇床过夜进行酶切,酶切产物保存于-20℃冰箱。PCR产物经60g/LPAGE垂直电泳,硝酸银染色证实获得目的基因片段。  1.5统计学处理所有统计分析均用SPSS11.5统计软件完成。采用Fisher确切概率法(双侧

8、检验),检验水准α=0.05;关联强度采用比值比(oddsratios,OR)和95%可信区间(confidenceintervals,CI)表示。  3讨论  IL1是多功能细胞因子,包括IL1α和IL1β,IL1ra是IL1受体的天然拮抗剂。编码IL1α、ILβ和IL1ra的IL1A、IL1B和IL1RN基因合称IL

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