ynz22位点多态性与食管癌遗传易感性论文

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1、YNZ22位点多态性与食管癌遗传易感性论文.freelp-FLP技术,对陕西正常人群(71例)、食管癌组织(38例)及癌旁组织(31例)YNZ22-VNTR位点进行多态性分析.结果在正常人群中YNZ22位点共检出29种基因型,10个等位基因片段,片段大小范围在168~938bp之间,杂合度为70.42%,PIC为0.84;在食管癌中共检出YNZ22位点11种基因型,8个等位基因片段,杂合度为10.15%.freels/geics;tandemrepeatsequencesAbstract:AIMToobservethepo

2、lymorphismofYNZ22lo-cusin71normalunrelatedsubjectsfromHanpopulationinShaanxiProvince,andassessitspossiblerelationshiparkersofesophagealcancer.METHODSThepolymorphismofYNZ22-VNTRlocusp-FLPinthe71normalsubjects,38esophagealcancersamplesand31pericancerousnon-tumorsamp

3、les.RESULTST168bpto938bpalsubjects.Thehet-erozygosityandPICofYNZ22ortissues.Theheterozygosityalsubjectsandthatofesophagealcancer(χ2=41.28;P0.01,DF=7).Amongthepartnershipsbetortissues,mutationofYNZ22locusentrepetitionnumberentsalsubjects,andonlyA8allelefragmentorti

4、ssues.Neitherofthetentsorphicgeicmarker.Thereshouldbeaclosercorrelationbetorphism(re-ductionofcoresegmentrepetitionnumber)andesophagealcancersusceptibility.0引言食管癌是陕西常见的恶性肿瘤,具有高发和家族聚集现象.YNZ22(17p13.3)是17p末端杂合度较高的多态遗传标记位点,并与Miller-Dieker综合征密切相关.由于其位于抑癌基因p53(17p13.1)

5、近侧,并与之连锁,故常用于肿瘤杂合性丢失(lossofhet-erozygosity,LOH)的研究,间接提示抑癌基因p53的突变情况.迄今国内外尚末见到关于YNZ22位点多态性分布与食管癌遗传易感性关系的报道,我们应用PCR-Amp-FLP技术比较了陕西汉族正常人群与食管癌人群YNZ22位点等位基因多态性分布,试图阐明YNZ22能否成为食管癌人群群体中理想的遗传易感性标记.1材料和方法1.1材料71例正常无血缘关系的陕西汉族人群血液样本;38例鳞状食管癌标本;31例癌旁组织标本(均由唐都医院胸外科提供,癌及癌旁组织经病理

6、组织切片确诊).1.2方法1.2.1DNA提取抗凝血(3~5mL)或组织块采用常规蛋白酶K,酚氯仿法进行抽提.1.2.2PCR反应总反应体积30μL,内含dNTPs200μmolL-1,一对引物各25pmolL-1,TaqDNA聚合酶(华美公司)2.5IU,模板DNA约5ng.PCR引物:5’-CGAAGAGTGAAGTGCACAGG-3’和5’-CACAGTCTTTATTCTTCAGCG-3’(赛百盛公司).PCR程序:94℃变性45s;55℃复性45s;72℃延伸60s,循环30次,最后一次循环72℃延伸10min.1

7、.2.3扩增产物检测20gL-1琼脂糖凝胶,含溴乙锭1mgL-1,于扩增产物中加入1/5体积的上样缓冲液进行电泳,以100bpDNALadder(华美公司)为标准判型.电压4~5Vcm-1,电泳2h,EB染色.在紫外检测仪下观察并照相.统计学处理:基因型及等位基因频率用直接计数法,并按Hardy-,RoychoudhuryAK.Samplingvariancesofheterozygosi-tyandgeicdistance[J].Geics,1974;76:379-390.[3]olecularcharacterizat

8、ionofaspontaneouslygeneratedneics,1988;3:347-351.[4]SinghS,SimonM,MeybohmI,JantkeI,JonataassH,GoeddeHellinedGe,1994;11(5):264-266.[7]DekaR,DeCrooS,YuLM,

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