基于高通量测序技术的膀胱癌转录组分子标记的初步筛选

《基于高通量测序技术的膀胱癌转录组分子标记的初步筛选》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、万方数据中图分类号数三Z：!垒UDC610学校代码!Q5兰3密级公珏硕士学位论文基于高通量测序技术的膀胱癌转录组分子标记的初步筛选，州■●1●n1^『lneDrlml上ySCreenlngO士mo上eCU上armar量【erSO士bladderurothelialcarcinomabasedonHigh—throughputsequencing作者姓名：学科专业：研究方向：学院(系、所)：指导教师：肖四方临床医学临床检验诊断学中南大学湘雅医学院附属海口医院张淑芳教授答辩委员会主席中南大学二。一四年五月万方数据学位论文原创性声明本人郑重声明，所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研

2、究工作及取得的研究成果。尽我所知，除了论文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得中南大学或其他教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我共同工作的同志对本研究所作的贡献均已在论文中作了明确的说明。申请学位论文与资料若有不实之处，本人承担一切相关责任。作者签名：塑日期：兰年三月旦目学位论文版权使用授权书本学位论文作者和指导教师完全了解中南大学有关保留、使用学位论文的规定：即学校有权保留并向国家有关部门或机构送交学位论文的复印件和电子版；本人允许本学位论文被查阅和借阅；学校可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用

3、复印、缩印或其它手段保存和汇编本学位论文。保密论文待解密后适应本声明。作者签名：!基望查导师签名立遮i盘芳万方数据基于高通量测序技术的膀胱癌分子标记的初步筛选摘要：目的：基于高通量测序技术、RT—qPcR和免疫组化技术，从转录层面和蛋白表达角度探索膀胱尿路上皮癌发生发展的可能机制，筛选出膀胱肿瘤早期诊断和监测的分子标记。方法：通过高通量测序技术对一膀胱尿路上皮癌的患者进行转录组测序和生物信息学分析，筛选到候选的差异表达分子，同时收集31对膀胱尿路上皮癌肿瘤组织和癌旁非肿瘤组织样品，采用RT—qPCR验证这些差异表达分子CDHl、vEGFA、PTPRF和CLDN7的表达水平。同时对C

4、DHl和CLDN7进行免疫组化进行检测，探讨这些分子在肿瘤的发生发展中的分子机制和临床意义。结果：1．CDHl、VEGFA、PTPRF和CLDN7可能成为候选膀胱癌早期诊断和监测的分子标记；CDHl和CLDN7mRNA在肿瘤组织相对癌旁非肿瘤组织表达上调，但差异无统计学意义(伶O．05)；2．vEGFA在肿瘤组织中相对癌旁非肿瘤组织表达上调，差异有统计学意义(尺0．05)；3．cDHl、VEGFA、PTPRF和CLDN7分别与肿瘤复发关系作多元Logistic回归分析，结果发现PTPRF表达作为肿瘤复发因素进入模型(户O．002)，说明PTPRF和肿瘤复发关系密切；4．CDHl和C

5、LDN7免疫组化显示：CDHl在膀胱肿瘤组织和癌旁非肿瘤组织蛋白表达中未发现有明显统计学意义差异(脚．05)，膀胱尿路上皮癌肿瘤组织CLDN7表达上调，具有统计学意义(氏0．05)。结论：1．CLDN7、VEGFA和PTPRF等差异表达基因被纳入可能的膀胱癌分子早期诊断和治疗的分子标记候选集；2．VEGFA可能作为候选的膀胱肿瘤诊断的分子标记，PTPRF可能与膀胱肿瘤的复发关系比较密切。全文图15幅，表13个，参考文献76篇。关键词：膀胱尿路上皮癌；高通量测序；分子标记筛选；转录组；差异表达基因分类号：R737．14Ⅱ万方数据ThestIldyOfmolecularmarkerso

6、fbladderu加theHalAbstI曩Ct：Obiective：Toe)【ploremeoccun．enceanddevelopmentofbladderur．0thelialcarciIlomaof也epossiblemechanismbasedon仃趾scriptometecllIlologyf如mnleperspectlVeof仃锄scriptionandproteiIle冲ressiom趾dtoscreenearlydi卿losis觚dmollitorillgofmolecularmarkersofbladdercancer．Memods：T1lisp啊ectadop

7、tedlligll—t11roughputsequenciIlgtecIulologytope—b皿缸anscriptomesequenciI】曙锄dbioiIl】}bmaticsa工lalysisonnon．t哪orandtIlmortissues锄ples，screenedandidemified廿ledi丘．eremiallyexpressedgenesofbladdercancer．Meanwbieweverifiedourhypo也esisandident毋