青篱柴转录组高通量测序分析及SSR分子标记的开发

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1、学校代码：10663学号：15010100556贵州师范大学硕士学位论文青篱柴转录组高通量测序分析及SSR分子标记的开发High-throughputsequencingAnalysisanddevelopmentofSSRmolecularmarkersinthetranscriptomeofTirpitziasinensis专业名称：生态学专业代码：071300研究方向：植物繁殖生态学申请人姓名：黄建敏导师姓名：汤晓辛二零一八年六月目录摘要..........................................................

2、IAbstract......................................................III第一章文献综述..............................................11.1青篱柴及其研究进展....................................11.2高通量转录组测序相关背景介绍..........................11.2.1转录组定义.......................................11.2.2测序技术的发展.......

3、............................21.2.3转录组测序.......................................31.3遗传标记研究进展......................................41.3.1遗传标记.........................................41.3.2SSR标记研究进展.................................51.4研究背景、目的及意义..................................61.4.1研

4、究背景.........................................61.4.2研究目的和意义...................................6第二章青篱柴转录组生物信息学分析............................82.1研究材料..............................................82.1.1植物材料.........................................82.1.2实验试剂..............................

5、...........82.1.3实验仪器.........................................82.2研究方法..............................................82.2.1青篱柴总RNA提取.................................82.2.2总RNA检测.......................................82.2.3测序文库构建.....................................92.2.4转录组测序.......

6、................................92.2.5转录组数据的组装.................................92.2.6转录组数据的分析.................................92.3结果与分析...........................................102.3.1RNA提取及质量检测..............................102.3.2转录组测序与组装................................112.3.3转录组

7、序列的功能注释............................122.3.4KOG分类........................................132.3.5GO分类.........................................142.3.6KEGG代谢通路分析...............................172.3.7编码蛋白框（CDS）预测...........................242.3.8基因转录因子分析................................27

8、2.3.9基因表达水平分析.............