基于老鼠免疫抑制数据的基因主效应及交互效应分析

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1、?纖麵r立Z硕±研究生学位絶文基于老鼠免疫抑制数据的基因主效应及交互效应分析申请人:谢婉秋学号:21211011-培养单位:数学科学学院学科专业:应用数学研巧方向:应用统计指导教师:周影完成日期:20巧年3月28日独创性声明本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研妃作及取得的研巧成裝臟所知,除了如特别加嘘注和致屬地方外论文中不包含其他人,己经发表或撰写过的巧究成果也不包含为获得黑龙江大学或其他教育机构的学,位或证书赚贈的材料.学位论文作者签名鮮日厭峨月巧学位论娜权使歷权书本人完全了解、使用

2、学位论文的规定同意学校保留并向壁驻鲜关保留,国家有关部口或机构送交论文的复印件和昕版论文被查阔和借阅.本人授,允许权黑龙江大学可切将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索可臥,采用影印、缩印賊他复制郎保存、汇编本学位论克学位论文储St鉛日親牌月化鉛日期:麟6月巧基于老鼠免疫抑制数据的基因主效应及交互效应分析申请人:谢婉秋学号:2121101培养单位:数学科学学院学科专业:应用数学研究方向:应用统计指导教师:周影完成日期:2015年3月28日中文摘要中中中文文文摘摘摘要要要现代生物技术面临着一个巨大的挑战,即如何提出一个行之有效、计算可行的处理高维数据的

3、方法,问题大多集中在处理基因之间的交互效应上.传统的方法受到算法的复杂程度,软件计算能力等方面的限制不再适用.因此,提出一个切实可行的统计方法势在必行.本文主要研究老鼠群体对紫外线辐射引起的免疫抑制易感性基因间的主效应及交互效应.首先,我们利用筛选清理(ScreenandClean)和Dantzig变量选择的方法筛选数据变量,建立合理模型,分析位点间的主效应及交互效应.比较两种方法检测的显著位点之间的区别,并评价两种方法的优缺点.结果显示Dantzig变量选择的方法较前者准确度更高.其次,结合Dantzig变量选择方法提出两阶段法,在全基因组范围内检测老鼠群体的与紫外线辐射引起免疫抑制

4、易感性有关的性状之间的主效应及交互效应.最后,分析总结所应用的方法,识别出主效应显著性强烈的位点是D10Mit170,交互效应显著的位点对是D14Mit266和D19Mit34.关键词:老鼠免疫抑制数据;主效应;交互效应;变量筛选;两阶段法;–I–黑龙江大学硕士学位论文AbstractWearefacingatoughchallengewhenwestudymodernbiotechnology,thatistosay,howtoproposeaneffective,feasiblemethodforprocessingthehigh-dimensionaldata.Theproblem

5、ismainlyconcentratedintreatingtheinteractionbetweengenes.Thetraditionalmethodisnolongerapplicable,aslimitedbythecomplexityofthealgorithm,thecomputingpowerofsoftwareandotheraspects.Thus,puttingforwardapracticalstatisticalmethodisimperative.Thispaperstudiesthemaineffectandinteractionbetweengenesoni

6、mmunesuppressionsusceptibilitycausedbyultravioletradiationinmicepopulation.First,wefilterdatavariablesbyusingScreenandCleanandDantzig,establishareason-ablemodel,thenanalyzethemaineffectsandinteractioneffectsbetweentheloci,comparethedistinctionbetweensignificantsitesdetectedbytwomethods,thuse-valuate

7、theadvantagesanddisadvantagesofthetwomethods.TheresultsshowthatDantzigvariableselectionmethodismoreaccuratethantheformer.Second,weproposeatwo-stagemethodcombinedDantzigvariableselection,todetectthegenome-widemaineffectandinte

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