外源性DNA残留量测定法(qPCR法)

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时间:2019-08-03

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1、重组抗人表皮生长因子受体人源化单克隆抗体外源性DNA残留量测定法(qPCR法)1原理实时定量PCR(qPCR)扩增分2个阶段,指数增长阶段和之后出现的非指数平台阶段。在指数增长阶段,每个循环PCR产物量大约增加一倍。然而,随着反应的进行,反应体系组成成分的消耗,其中的一种或多种成分限制反应,产物增长速度变慢,反应进入平台期。反应最初,虽然产物呈指数增长,但是荧光处于背景水平,检测不到荧光增加。但积累了足够的扩增产物,才可检测到的荧光信号,这个循环数叫初始循环数,即CT。CT值主要由扩增反应体系中模板的初始浓度决定的。如果模板初始浓度高,只需要较少的扩增循环就可以积累足够的产物,产生

2、高过背景的荧光信号,因此,反应就有一个小或早出现的CT;相反,如果模板初始浓度低,需要较多的扩增循环才能产生高过背景的荧光信号,反应就有一个大或迟出现的CT。两者之间关系的建立是qPCR用于定量的依据。2主要仪器表2仪器信息表名称厂家型号实时定量PCR仪Bio-RadCFXConnect3主要试剂表3试剂信息表名称厂家规格残留DNA样品制备试剂盒ABI1)LysisBuffer,2bottles,50ml/bottle;2)BindingSolution,1emptybottle;3)WashBufferConcentrate,2bottles,26ml/bottle;4)Elut

3、ionBuffer;1bottle,25ml;5)ProteinaseK(PK)Buffer,1bottle,50ml;6)MagneticParticles,2tubes,1.5ml/tube;7)ProteinaseK,2tubes,20mg/ml,1.25ml;8)YeasttRNA,2tubes,10mg/ml,0.5ml;Glycogen,2tubes,5mg/ml,1.0ml/tube.残留DNA定量检测试剂盒(CHO)ABI1)DNAControl,1bottle,40μl;2)DNADilutionBuffer(DDB),1bottle,7ml;3)2×Enviro

4、nmentalMasterMix,2tubes,0.75ml/tube;4)10×DNAResl-TimePCRAssayMix,1tube,300μl;5)NegativeControl,1tube,1.0ml.4溶液配制4.1蛋白酶K混合液(新配)附件13-14重组抗人表皮生长因子受体人源化单克隆抗体外源性DNA残留量测定法(qPCR)1reaction(100μl/sample)10reaction(100μl/sample)ProteinaseK10μl100μlProteinaseKBuffer60μl600μl4.2裂解混合液(新配)试剂体积(μl)Glycogen(5

5、mg/ml)180tRNA(10mg/ml)4LysisBuffer7600合计77844.3DNA标准品稀释TubelabelDilutionpg/μlpg/reactionDNAControl30000300000SD110μlDNAControl+990μlDDB3003000SD250μlSD1+450μlDDB30300SD350μlSD2+450μlDDB330SD450μlSD3+450μlDDB0.33SD550μlSD4+450μlDDB0.030.3SD650μlSD5+450μlDDB0.0030.03NTCDDB00注:DNA标准品溶液4℃放置保存1天,-2

6、0℃放置保存1周。5测定方法5.1样品处理5.1.1除蛋白1)在2ml离心管中加入100μl样品;2)每100μl的样品中加入70μl的蛋白酶K混合液,混合均匀,56℃水浴30min;3)每100μl的样品中加入360μl的裂解液,室温裂解2小时以上。5.1.2DNA的纯化1)磁珠使用前于37℃温浴10min,高速涡旋,彻底悬浮磁珠;2)每100μl的样品加入30μl的磁珠悬浮液;3)每100μl的样品加入300μl的BindingSolution,涡旋混合5min;4)12000r/min离心30sec,将离心管放置于磁力架上,静置5min直至溶液清澈,弃上清;5)从磁力架上取下

7、离心管,加入300μl的WashBuffer,涡旋混合5sec;6)12000r/min离心30sec,将离心管放置于磁力架上,静置2min,弃上清;7)重复步骤6)1次,打开离心管的盖子,室温下风干;8)加入50μl的ElutionBuffer,高速涡旋10sec,70℃处理10min,在温浴过程中,涡旋2~3次;附件13-14重组抗人表皮生长因子受体人源化单克隆抗体外源性DNA残留量测定法(qPCR)9)12000r/min离心30sec,将离心管放置于磁力架上,

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