《动物寄生虫病学》许金俊-实验十二动物寄生虫病的分子生物学诊断

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1、实验十二动物寄生虫病的分子生物学诊断一、实验目的和要求本实验以弓形体病的PCR诊断为例介绍动物寄生虫病的分子生物学诊断方法,让学生了解动物寄生虫病的分子生物学PCR诊断方法的如本原理和操作步骤。二、实验材料和仪器设备1、弓形虫虫株:NT株(猪源汤山分离株)购自江苏省农科院,本实验室保存。2、实验动物:ICR小鼠(18—22g),购自扬州大学比较医学中心。3、NT株弓形1UDNA:人工感染MT株ICR小鼠腹水,按照酚一氯仿法提取DNA,分光光度计进行定最,分装后保存于-20°Co4、试剂:蛋白酶K(上海Promega公司),dNTPs,M

2、gcl2,TaqDNA聚合酶,DL2000Marker购自上海生物工程公司。GenomeDNAExtractionKit(codeD9081)购自TaKaRa公司(大连)。英他常规试剂均为国产分析纯级,购ft扬州市屮林生化试剂有限公司。5、引物:据Burg等(1989)提供的B1基因设计并合成1对引物:上游引物P1:5'-GGAACTGCATCCGTTCATGAG一3'(694-714bp)和下游引物P2:5,-TCTTTAAAGCGTTCGTGGTC-3(887-868bp)o该引物扩増片断长度为194bpo据J.T.Ellis等(1

3、998)的报告设计并合成第2对引物,上游引物P3为5,-CGCTGCAGGGAGGAAGACGAAAGTTG-3';下游引物为P45'-CGCTGCAGACACAGTGCATCTGGATT-3',PCR产物的长度529bp„以上2对引物由大连宝生物公司合成。6、仪器:PCR扩增仪,新加坡生产的PCRsystem2400型和徳国生产的T-GradientThermoblock;电泳仪,北京市六一仪器厂生产的DYY-2型稳压稳流电泳仪;凝胶数码成像系统,上海天能科技有限公司生产的Gis-2008型;冷冻离心机,上海安亭科学仪器厂,TGL—1

4、6G—A型。6、耗材:PCR管、琼脂糖、Tip头、冰盒等7、试剂的配制(1)PBS缓冲液(pH7.4):在800mL水中加入NaCL18g,KCL0.2g,NaHP0(1.44g,KH2PO40.24g,以HC1调至pH7.4,加水定容至1000mL。(2)DNA提取液:10mmol/LTris-HClpH8.0,0.lmol/LEDTApH8.0,0.5%SDS(3)TE缓冲液(Tris-EDTA缓冲液)(pH8.0):10mmol/LTris-HClpH8.0,lmol/LEDTA(4)50mL0.5mol/LEDTA(pH8.0)

5、:称取9.30625gEDTA,加入40mL双蒸水,加入NaOH(约1.3g)使JtpH8.0,然后加入双蒸水,使艮为50mL。(5)0.1mol/LTris-HCl(pH&O)的配制:称取Tris1.214g,加入双蒸水,用浓HC1调整其pH&0。(6)无DNA酶的RNA酶的配制:将胰RNA酶(RNA酶A)溶于10mmol/LTris-HCl(pH7.5)、15mmol/LNaCl中,配成10mg/mL的浓度,于100°C加热15min,缓慢冷却至室温,分装,保存于一20°C。(7)10%SDS的配制:在900mL水中溶解100g电泳

6、级SDS,加热至68°C助溶,加入几滴浓HC1调节溶液的pH值至7.2,加水定容至1000mL,分装备用。(8)ACD抗凝液:柠檬酸0.84g,柠檬酸钠1.32g,葡简糖1.47g,加水至100mL.(9)TAB缓冲液:10mmol/LTris-HClpH7.5,10mmol/LKC1,2mmol/LEDTA,4mmol/LMgCl2(10)加样缓冲液:0.25%浪酚蓝,0.25%二甲苯青,15%聚蔗糖,配制后室温保存。(11)饱和酚一氯仿一异戊醇(25:24:1):饱和酚25份加氯仿24份加1份异戊醇。(12)氯仿一异戊醇(24:1)

7、:氯仿24份加1份异戊醇。三、实验方法和步骤1、猪组织样品的采集:活畜或屠宰动物的组织样品如肺和肺门淋巴结、腹水或者抗凝全血,无菌采集待检样品,4C保存待检。2、组织内弓形虫模板DNA的制备:取肺及肺门淋巴结组织各lg,去掉筋膜,剪碎,加入lml裂解液,以匀浆器研磨成细胞匀浆,加入蛋白酶K使其终浓度为1OOPg/ml,55水浴2h,不时摇振。取出水浴中的指形管,加等体枳饱和酚一氯仿一异戊醇,上下缓慢颠倒10次,室温下,12000rpin离心5min。吸取上层水相,置丁•另一指形管中,加入等体枳氯仿一异戊醇,轻轻混匀,12000mm离心5

8、mino吸取上层液相,置于另一指形管中,加入等体枳氯仿,轻轻混匀,12000“ni离心5mino吸取匕层液相,置于另一指形管中,加入2倍体积的无水乙醇,置于一20°C15min以上,沉淀DNA。取出指形管,

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