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1、第29卷第3期水产科学Vol.29No.32010年3月FISHERIESSCIENCEMar.2010海洋经济贝类遗传图谱的相关研究进展1,2112姚韩韩,林志华,董迎辉,沈和定(1.浙江万里学院生物与环境学院,浙江宁波315100;2.上海海洋大学水产与生命学院,上海201306))摘关键要词:遗传图谱;分子标记;贝类中图分类号:Q789文献标识码:C文章编号:1003-1111(2010)03-0178-06遗传连锁图谱的构建,是遗传学研究的一个重大,同一染色体上的基因在遗传过程中倾向于维系要领域,它
2、为人们进一步认识生物基因组组成、克在一起,而表现为基因连锁。它们之间的重组是通隆染色体的基因及定位重要经济性状的主效基因过同源染色体的非姐妹染色单体之间的交换来实奠定了基础。遗传图谱的建立为基因定位,特别是现的。在遗传连锁图谱中,标记之间的距离一般用一些重要经济性状和数量性状位点(QTL)定位,以cM(centiMorgan)表示,它揭示的是不同基因座之[1]至最终为克隆这些基因提供基础。间的重组频率(1cM相当于1%的重组率)。海洋经济贝类养殖在海洋产业中占重要地位,2遗传图谱构建的过程近些年来一些主要养殖种类流行病
3、的蔓延和大规模死亡屡屡发生,迫切需要对养殖贝类进行抗逆性构建遗传图谱的主要步骤包括:(1)构建合适状提高的遗传改良;而未来的遗传改良更多的依赖的作图群体,包括亲本的选择,分离群体类型的选于分子生物学手段,其中最有效的手段之一是通过择及群体大小的确定等;(2)利用合适的分子标记筛选和建立有效的分子标记并构建遗传图谱,从而进行分析;(3)利用计算机软件进行图谱构建,建立对某些抗病基因进行准确定位,进行分子标记辅助标记间的连锁排序和遗传距离。遗传图谱的构建育种,促进海洋经济贝类养殖业的发展。构建贝类需要大量的标记进行统计分析,
4、需要借助计算机进遗传图谱,将促进海洋经济贝类标记辅助选择行处理,目前应用得比较广泛的软件有LINK-[2](MAS)育种和遗传改良。笔者主要对遗传图谱的AGE、MAPMAKER/EXP等;(4)利用计算机软件绘出遗传图谱,常用的绘图软件有MapDraw构建和贝类遗传图谱研究进展方面进行综述。[3]V2.1和Mapchart2等。1遗传图谱构建的理论基础2.1构建合适的作图群体遗传连锁图谱是通过遗传重组交换进行连锁构建遗传连锁图谱,首先要创建作图群体。创分析所得到的基因在染色体上相对位置的排列图。建作图群体的过程,本质
5、上是通过减数分裂使得目遗传连锁图谱是伴随着遗传标记的发展而发展的。的基因或标记位点产生分离。建立一个合适的作相应的遗传图谱划分为经典遗传图谱和分子连锁图群体是遗传作图的关键。对于海洋经济贝类来图谱,不论是经典遗传图谱还是分子连锁图谱,都说,作图群体有很多种,杂交F1群体、回交群体、F2是基于遗传信息在染色体上是线性排列这一基本群体、重组近交系、双单倍体、单倍体等都是常用的[4]事实。而目前所说的遗传连锁图谱多指分子连锁作图群体。在创建作图群体的过程中要根据作图谱,即根据某一多态性DNA片段在分离群体中图目的、图谱分辨率的
6、要求以及不同物种创建作图的分离情况作为基础而得到的图谱。群体的难易程度而定,每种作图群体均有其优缺连锁图谱构建的理论基础是染色体的交换与点。重组。在细胞减数分裂时,非同源染色体上的基因杂交F1群体适合于杂合度较高的水产动物,相互独立、自由组合,同源染色体上的基因产生交它可以在短期内建成,且能够同时对双亲作图,是[5]换与重组,交换的频率随基因间距离的增加而增一种很有潜力的作图群体。Yu等利用杂交F1群收稿日期:2009-06-11;修回日期:2009-08-17.基金项目:国家863计划项目(2006AA10A41
7、0);浙江省重大科技攻关计划项目(2006C12013);温州市科技兴海项目(S20080019).作者简介:姚韩韩(1985-),女,硕士研究生,研究方向:贝类遗传育种;E-mail:yaohanhan1020@126.com.通讯作者:林志华(1965-),男,研究员,研究方向:水产动物繁育及遗传育种;E-mail:zhihua9988@126.com.第3期姚韩韩等:海洋经济贝类遗传图谱的相关研究进展179体为作图群体,构建了美洲牡蛎(Crassostreavir-PCR检测DNA多态性的一种方法,选择性地扩增[1
8、3]ginica)的遗传连锁图谱。基因组DNA酶切片段。AFLP的优点是信息回交群体或F2群体适合于一个初始构建遗传量大、多态性强、灵敏度高、稳定性好、重复性高,可连锁图谱的物种,因为这2种作图群体有着很强的以同时检测多个位点,可以快速地增加图谱标记密连锁不均衡性,所以能够检测到分布很广的标记。度和图谱覆盖率,因此A
