果蝇免疫响应藤黄微球菌刺激的动态TF-miRNA-lncRNA-gene调控网络研究

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1、１＂ｖ？＇＂＾－－＇．；：ｉ．：．…ｓ．■：．？：；＼／．：、ｉ：：：ＶＳＶ索取号：Ｑ９５３／１７．４３１：１４１２０１００１密级：公开南京砰疮犬＃博士学位论文国ｈｍｔｉｍｎｉＦＥＬｎｎｕＪｙ果蝇免疫响应藤黄微球菌刺激的动态＿ＴＦ－－ｍｉＲＮＡｌｎｃＲＮＡｇｅｎｅ调控网络研究研究生魏官云指导教师马飞教授培养单位生命科学学院－賴斗生鮮二级学科动物学完成时间２０１８年３月２８日答辩时间２０１

2、８年５月１９日学位论文独创性声明本人郑重声明：所提交的学位是本人在导师指导下进行的研究工作和取得的研宄成果。本论文中除引文外，所有实验、数据和有关材。本论文中除引文和致谢的内容外料均是真实的，不包含其他人或其它机构已经发表或撰写过的研究成果。其他同志对本研究所做的贡献均己在论文中作了声明并表示了谢意。学位论文作者签名：ＩｆＩ日期：：，学位论文使用授权声明研宄生在校攻读学位期间论文工作的知识产权单位属南京师范大学。学校有权保存本学位论文的电子和纸质文档

3、，可以借阅或上网、公布本学位论文的部分或全部内容，可以采用影印、复印等手段保存汇编本学位论文。学校可以向国家有关机关或机构送交论文的电子和。（纸质文档，允许论文被查阅和借阅保密论文在解密后遵守此规定）：保密论文注释本学位论文属于保密论文，密级：保密期限为年。学位论文作者签名Ｉ指导教师签名：日期：：ｒ＿日期／今如ｍｍ摘要随着非编码ＲＮＡ的深入研宄，发现各类非编码ＲＮＡ在生命活动过程中扮演着非常重要的调控作用，特别是ｍｉｃｒｏＲＮＡ（ｍｉＲＮ

4、Ａ）和长链非编码ＲＮＡＵｏｎｇｎｏｎｃｏｄｉｎｇＲＮＡ，ｌｎｃＲＮＡ）在各种生理过程中执行着复杂多样的调控功能。免疫系统的稳态是生物体得以生存的重要保障，免疫应答过度激活或不足都会对生物体造成不同程度的损伤，因此免疫系统的稳态需要受到精确的调控。越来越多的研宄表明ｍｉＲＮＡ和ＩｎｃＲＮＡ在免疫稳态的调控中发挥重要的作用。然而，目前有关转录因子（Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎｆａｃｔｏｒ，ＴＦ）、ＬｎｃＲＮＡ、ｍｉＲＮＡ和基因是如何协同一精密调控免疫稳态的机制仍不清晰，需要进

5、步的深入研宄。一果绳（Ｚ）ｍｓｏｐ／ｎ７ａｗｅ／ａｎｏｇａｓｔｏＯ是个经典的模式生物，其便捷的遗传可操作性、完备的基因组注释以及丰富的突变株种类，为研宄果蝇先天免疫响应的调控机制提供了重要的基础。特别是果蝇Ｔｏｌｌ和Ｉｍｄ信号通路分别与哺乳动物ＴＬＲ和ＴＮＦ－ｃｔ信号通路高度同源，揭示了果蝇与哺乳动物在先天免疫调控途径“”－ｍ－－上存在着共同的进化起源。因此，系统开展ＴＦｉＲＮＡｌｎｃＲＮＡｇｅｎｅ调控网络在果蝇先天免疫响应中的功能及其作用机制研宄，不仅有助于阐明果蝇自身免

6、疫稳态的维持机制，而且对深入理解哺乳动物先天免疫响应的调控机制也具有重“”。－－－要的科学意义为此，本论文围绕ＴＦｍｉＲＮＡｌｎｃＲＮＡｇｅｎｅ调控网络在果蝇一，对藤黄微球菌（Ｍｃｒａｃｏｃｃｗｓ先天免疫响应中的作用机制这重要科学问题／３１２２４ＲＮＡ－ｓｅ刺激果蝇雄成虫、和小时（ｈｏｕｒ，ｈ）后的样本进行了ｑ一和ｓｍａ－ＩｉｌｌＲＮＡｓｅｑ；开发了ｎｃＲＮＡ和ｍＲＮＡ预测流程；获得了批潜在的果虫笔“”－－ｃＲＴＦ－ｉＲＮＡｌｎｃＲＮＡｅｎｅ新，ＩｎＮＡ和新ｍｉＲＮＡ；

7、构建了ｍｇ免疫调控网络揭“”ＴＦ－－ｎＲＮＡ－ｅｎｅ示了动态ｍｉＲＮＡｌｃｇ调控网络的结构特征及其在果蝇先天免疫响应中可能的作用机制。本论文获得的主要研宄结果如下：１Ｍ／ｔｅｗ刺激过ｉＲＮＡ、ＩｎＲＮＡ、基因呈现出显著．果蝇免疫响应ｗ程中ｍｃ的动态变化特征，差异表达的基因和ｃＲＮＡ的１２ｈ，而差异表Ｉｎ数量在达到峰值达的ｍｉＲＮＡ却在２４ｈ最多。这些结果表明，动态的ｍｉＲＮＡ和ＩｎｃＲＮＡ表达可能在果蝇免疫响应中扮演十分关键的调控作用。２．差异表达基因的生物学

8、通路富集分析显示，差异表达基因参与了不同的信号通路，包括Ｔｏｌｌ和Ｉｍｄ等免疫信号通路，以及其它非免疫信号通路，表明不同信号通路的协同在激活果蝇免疫响应和维持稳态中起重要的调控作用，。此外大量的免疫相关基因在３和１２ｈ表达上调，而在２４ｈ则下调，暗不果绳免疫响Ｉ摘要．一３一些基因需要被抑制来应的早期（，１２ｈ）需要些基因被快速转录，而另外激活免疫响应，同时免疫响应后期（２４ｈ）大量的基因需要被下调以避免免疫系统的过度反应。