H5亚型禽流感病毒LAMP快速检测方法的建立-论文.pdf

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1、第36卷第2期中国预防兽医学报Vo1.36.No.22014年2月ChineseJournalofPreventiveVeterinaryMedicineFeb.2014doi:10.39698.issn.1008—0589.2014.02.06H5亚型禽流感病毒LAMP快速检测方法的建立包红梅,李一经,王秀荣,陈化兰(1.中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室/农业部动物流感重点开放实验室,黑龙江哈尔滨150001;2.东北农业大学动物医学学院,黑龙江哈尔滨150030)摘要:为建

2、立快速检测H5亚型禽流感病毒(AⅣ)的方法,本研究根据GenBank中登录的H5亚型AIVHA基因序列,设计了一套特异识别HA基因序列中6个不同区段的环介导恒等温扩增(LAMP)引物,建立了基于LAMP技术检测H5亚型AIV的检测方法。结果表明,该方法对H5AIVRNA的最小检测限为0.1pfu,灵敏度高于普通一步法RT.PCR10倍;扩增反应可以在30min内完成;在反应体系中添加钙黄绿素(FD)荧光染料后,可以通过肉眼观察有无荧光直接判定结果。灵敏性及特异性试验表明,该方法灵敏度高、特异性好,能够

3、作为H5亚型A1V的病原学快速检测方法。关键词:禽流感病毒;LAMP方法;H5亚型禽流感病毒中图分类号:$852.65文献标识码:A文章编号:1008.0589(2014)02.0107.04Developmentofaloop—mediatedisothermalamplificationmethodfordetectionofsubtypeH5avianinfluenzavirusBAOHong-mei,LIYiding2,WANGXiu—rong,CHENHua—lan(1.KeyLaborat

4、oryofAnimalInfluenzaoftheMinistryofA鲥cultural,StateKeyLaboratoryofVeterinaryBiotechnologyHarbinVeterinaryResearchInstitute,ChineseAcademyofAgriculturalSciences,Harbin150001,China;2.CollegeofVeterinaryMedicine,NortheastAgriculturalUniversity,Harbin150030

5、,China)Abstract:InordertodeveloptherapiddetectionmethodforH5subtypeavianinfluenzavires(AIV),aloop—mediatedisothermalamplification(LAMP)forthedetectionofH5subtypeA1VwasdevelopedwithasetofspecificprimersweredesignedbasedonthesequencesofH5subtypeAIVhemaggl

6、utinin(HA)geneavailableinGenBank,targetingthe6distinctsequencesofgenes.TheresultsshowedthattheLAMPwasspecifictoamplificationfromH5subtypeA1V,butnotfromothersubtypeA1Vsandotheravianvirus,andthedetectionlimitoftheLAMPmethodwas0.1pfuforH5subtypeAIV,whichwa

7、s100一foldhigherthanthatofroutineone-stepRT-PCR.Theamplificationcouldbecompletedwithin30mininawaterbothatconstanttemperatureof62.5℃.Withtheadditionofafluorescentdye,theresultswereeasiertobeinterpreted.Therefore。thesensitivityandspeciflcityLAMPmethodcould

8、beappliedforepidemiologicalsurveyandclinicaldiagnosisforH5subtypeAIVinfection.Keywords:avianinfluenzavires;loop—mediatedisothermalamplification(LAMP);H5subtypeavianinfluenzavirus*Correspondingauthor收稿日期:2013.07.12基金项目:中央级公益性科研院所基

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