南瓜ISSR-PCR反应体系的建立与优化-论文.pdf

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1、分子植物育种,2014年,第12卷,第4期,第802-809页MolecularPlantBreeding,2014,Vo1.12,No.4,802—809技术主题TechnologyFeature南瓜ISSR—PCR反应体系的建立与优化朱海生·,2卢丽芳,温庆放1,2’林义章31福建省农业科学院作物研究所,福州,350013;2福建省农业科学院蔬菜研究中心,福州,350013;3福建农林大学园艺学院,福州,350002通讯作者,541585978@qq.com摘要为获得南瓜ISSR最优扩增体系,为后续南瓜的遗传多样性分

2、析和亲缘关系鉴定奠定基础,本研究以‘密本’南瓜为筛选体系材料,采用单因素试验,对ISSR反应体系的M、dNTP、Taq酶、引物和DNA浓度等5个因素进行优化。研究结果表明,南瓜ISSR25L最佳反应体系为:2.5L10xBufer,2.0mmol/LM,0-3mmol/LdNTP,1U酶,0.48mmol/L引物,75ng的DNA。在此基础上,对筛选出的12条引物进行退火温度的优化,最终确定每条引物的最佳退火温度。利用该反应体系,选用引物891对85个南瓜品种进行所确立扩增体系的验证,结果显示扩增产物条带清晰明亮、多态性

3、丰富,且特异性强、重复性好,表明本研究所确定的反应体系适用于南瓜的ISSR分子标记。关键词南瓜,ISSR,分子标记,PCR扩增EstablishmentandOptimizationofISSR—PCRAmplificationSysteminSquashZhuHaisheng。LuLifangWenQingfang。LinYizhang。1CropsResearchInstitute,FujianAcademyofAgriculturalSciences,Fuzhou,350013;2VegetableResearch

4、Center,FujianAcademyofAgriculturalSciences,Fuzhou,350013;3CollegeofHorticulture,FujianAgricultureandForestryUniversity,Fuzhou,350002Correspondingauthor,541585978@qq.comIX)I:10.132718.mpb.012.000802AbstractInordertoobtaintheISSR—PCRreactionsystemofSquash,Wetookano

5、ptimizationexperimentwithsinglefactordesignwhichwasconcentratedonfivefactorsofMg2+,dNTP,7EINApolymerase,primerandtemplateDNAbyusingthesquash‘miben’asthematerialoffiltersystemtosetupagoodfoundationofanaly-singthegeneticdiversityandrelationshipidentificationofSquas

6、h.Thetestresultshowedthatthegreatest25LISSRreactionsystemwhichcontained2.5IxL10xBufer,2.0mmol/LM,0.3mmol/LdNTP,1UTaqDNApolymerase,0.48mmol/Lprimer,75ngtemplateDNA.Onthisbasis,optimizedannealingtemperatureof12primerswhichhavebeenscreened,andultimatelydeterminedthe

7、optima1annealingtemperatureofeachprimer.85squasheswereamplifiedwithprimer891undertheoptimizedreactionconditions.Thetestresultshowedtheamplificationproductswhichwereclearandbright,abundantpolymorphism,strongspecificityandgoodrepeatability.Accordingly.itwassuitable

8、forISSRanalysisofsquash.KeywordsSquash,ISSR,Molecularmarker,PCRamplification南瓜(CucurbitamoschataL.)属于葫芦科(Cucur-贮存、适应性强,具有多种保健功能,从而获得“世界bitaceae)南瓜属(Cucurbita)的

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